See download stats for:    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor software packages

This page was generated on 2020-04-03 13:17:55 -0400 (Fri, 03 Apr 2020).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 75

1BiocGenerics (30834)
2BiocVersion (29740)
3IRanges (28635)
4S4Vectors (28162)
5Biobase (26863)
6zlibbioc (22823)
7BiocParallel (22409)
8AnnotationDbi (22397)
9XVector (21047)
10GenomicRanges (20103)
11GenomeInfoDb (19442)
12limma (19361)
13SummarizedExperiment (19335)
14DelayedArray (18274)
15Biostrings (17648)
16Rsamtools (14970)
17annotate (14935)
18biomaRt (14096)
19genefilter (13737)
20GenomicAlignments (13117)
21rtracklayer (13000)
22graph (12098)
23GenomicFeatures (12075)
24edgeR (11950)
25BiocInstaller (11452)
26Rhtslib (10762)
27DESeq2 (10747)
28geneplotter (10684)
29Rhdf5lib (10555)
30preprocessCore (9524)
31rhdf5 (9474)
32multtest (8156)
33qvalue (7438)
34Rgraphviz (7343)
35RBGL (7292)
36affyio (6704)
37affy (6658)
38BSgenome (6538)
39impute (6228)
40fgsea (6069)
41BiocFileCache (5815)
42DOSE (5723)
43clusterProfiler (5665)
44VariantAnnotation (5487)
45ProtGenerics (5394)
46ShortRead (5392)
47ensembldb (5383)
48GOSemSim (5263)
49enrichplot (5108)
50HDF5Array (5089)
51GEOquery (5057)
52sva (4781)
53AnnotationFilter (4536)
54ComplexHeatmap (4517)
55GSEABase (4342)
56DelayedMatrixStats (4294)
57KEGGREST (4185)
58DESeq (3842)
59AnnotationHub (3821)
60SingleCellExperiment (3691)
61biovizBase (3624)
62vsn (3340)
63interactiveDisplayBase (3270)
64phyloseq (3168)
65beachmat (3149)
66KEGGgraph (3145)
67pathview (3088)
68Gviz (3037)
69biomformat (2930)
70pcaMethods (2902)
71scater (2845)
72Category (2741)
73topGO (2648)
74aroma.light (2635)
75AnnotationForge (2557)

All software packages

All software package stats in one file: bioc_pkg_stats.tab

All software package download scores in one file: bioc_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor software repository (all packages combined)

A

a4 (79)
a4Base (104)
a4Classif (81)
a4Core (129)
a4Preproc (122)
a4Reporting (81)
a4reporting (0)
ABAEnrichment (80)
ABarray (77)
abseqR (44)
ABSSeq (72)
acde (78)
ACE (56)
aCGH (139)
ACME (84)
ADaCGH2 (64)
ADAM (41)
ADAMgui (35)
adaptest (53)
adductomicsR (40)
adSplit (66)
AffiXcan (39)
affxparser (1485)
affy (6658)
affycomp (101)
AffyCompatible (88)
affyContam (68)
affycoretools (372)
affydata (1)
AffyExpress (70)
affyILM (64)
affyio (6704)
affylmGUI (106)
affyPara (67)
affypdnn (77)
affyPLM (1326)
affyqcreport (0)
affyQCReport (215)
AffyRNADegradation (68)
AffyTiling (4)
AGDEX (65)
Agi4x44PreProcess (2)
agilp (156)
AgiMicroRna (108)
agimicrorna (0)
AIMS (303)
ALDEx2 (286)
alevinQC (41)
AllelicImbalance (77)
AlphaBeta (16)
alpine (70)
ALPS (20)
alsace (72)
altcdfenvs (73)
AMARETTO (41)
AMOUNTAIN (70)
amplican (87)
ampliQueso (25)
AnalysisPageServer (57)
anamiR (62)
Anaquin (74)
AneuFinder (99)
ANF (59)
animalcules (39)
annaffy (438)
AnnBuilder (1)
annmap (56)
annotate (14935)
AnnotationDbi (22397)
annotationdbi (0)
AnnotationFilter (4536)
AnnotationForge (2557)
AnnotationFuncs (94)
AnnotationHub (3821)
AnnotationHubData (115)
annotationTools (113)
annotatr (261)
anota (69)
anota2seq (82)
antiProfiles (59)
APAlyzer (15)
apcluster (0)
apComplex (91)
apcomplex (0)
apeglm (1387)
applera (0)
appreci8R (43)
aroma.light (2635)
ArrayExpress (548)
ArrayExpressHTS (42)
arrayMagic (0)
arraymvout (0)
arrayMvout (57)
arrayQCplot (0)
arrayQuality (78)
arrayQualityMetrics (508)
arrayqualitymetrics (0)
ArrayTools (99)
ArrayTV (66)
ARRmNormalization (60)
artMS (75)
ASAFE (55)
ASEB (63)
ASGSCA (64)
ASICS (77)
asmn (1)
ASpediaFI (14)
ASpli (98)
AssessORF (40)
ASSET (76)
ASSIGN (75)
ATACseqQC (240)
AtlasRDF (5)
atSNP (40)
attract (68)
AUCell (451)
Autotuner (23)
AWFisher (16)

B

BaalChIP (55)
BAC (60)
bacon (95)
BADER (61)
BadRegionFinder (55)
BAGS (59)
ballgown (797)
bamsignals (517)
BANDITS (39)
banocc (59)
basecallQC (62)
BaseSpaceR (75)
Basic4Cseq (78)
BASiCS (118)
BasicSTARRseq (57)
basilisk (1)
basilisk.utils (1)
batchelor (744)
BatchQC (110)
BayesKnockdown (53)
BayesPeak (101)
bayNorm (77)
baySeq (473)
BBCAnalyzer (56)
BCRANK (76)
bcSeq (64)
BDMMAcorrect (53)
beachmat (3149)
beadarray (663)
beadarraySNP (71)
beaddatapackr (0)
BeadDataPackR (648)
BeadExplorer (0)
BEARscc (65)
BEAT (57)
BEclear (72)
betr (5)
bgafun (58)
BgeeCall (2)
BgeeDB (94)
BGmix (44)
bgx (61)
BHC (149)
BicARE (105)
BiFET (68)
BiGGR (66)
BigMatrix (0)
bigmelon (66)
bigmemoryExtras (55)
bigPint (46)
bim (1)
bioassayR (82)
biobase (0)
Biobase (26863)
biobroom (174)
biobtreeR (4)
bioCancer (73)
BiocCaseStudies (67)
BiocCheck (278)
biocDatasets (0)
BiocFileCache (5815)
BiocGenerics (30834)
biocGraph (235)
biocinstaller (0)
Biocinstaller (0)
BiocInstaller (11452)
biocLite (0)
BiocNeighbors (2312)
BiocOncoTK (66)
Bioconductor (0)
BioCor (72)
BiocParallel (22409)
BiocPkgTools (83)
BiocSet (16)
BiocSingular (2119)
BiocSklearn (339)
BiocStyle (2322)
BiocVersion (29740)
biocViews (1943)
BiocWorkflowTools (72)
bioDist (231)
biomaRt (14096)
BioMedR (1)
biomformat (2930)
BioMM (34)
BioMVCClass (57)
biomvRCNS (55)
BioNet (231)
bionet (0)
BioNetStat (67)
BioQC (109)
BioSeqClass (136)
biosigner (75)
biostrings (0)
Biostrings (17648)
BiostringsCinterfaceDemo (0)
biosvd (59)
BioTIP (13)
biotmle (58)
biovizBase (3624)
BiRewire (75)
birta (67)
birte (28)
biscuiteer (14)
BiSeq (115)
BitSeq (100)
blacksheepr (13)
blima (56)
BLMA (68)
bnbc (54)
BPRMeth (68)
BRAIN (144)
brainflowprobes (11)
brainImageR (23)
BrainStars (56)
branchpointer (52)
breakpointR (42)
brendaDb (15)
bridge (58)
BridgeDbR (75)
BrowserViz (93)
BrowserVizDemo (11)
BSgenome (6538)
bsseq (874)
BubbleTree (60)
BufferedMatrix (65)
BufferedMatrixMethods (61)
BUMHMM (62)
bumphunter (1815)
BUS (59)
BUScorrect (36)
BUSpaRse (52)
BuxcoR (0)

C

CAFE (50)
CAGEfightR (68)
CAGEr (113)
CALIB (63)
calm (13)
CAMERA (573)
CAMTHC (40)
canceR (69)
cancerclass (63)
CancerInSilico (54)
CancerMutationAnalysis (60)
CancerSubtypes (130)
CAnD (53)
caOmicsV (57)
Cardinal (134)
casper (72)
CATALYST (273)
Category (2741)
categoryCompare (59)
CausalR (67)
cbaf (63)
ccfindR (71)
ccmap (83)
CCPROMISE (51)
ccrepe (73)
celaref (77)
celda (78)
cellbaseR (64)
CellBench (44)
cellGrowth (61)
cellHTS (3)
cellHTS2 (199)
cellity (75)
CellMapper (59)
CellMixS (38)
CellNOptR (120)
cellscape (69)
CellScore (48)
CellTrails (53)
cellTree (81)
CEMiTool (182)
ceRNAnetsim (5)
CeTF (5)
CexoR (57)
CFAssay (63)
CGEN (91)
CGHbase (248)
CGHcall (221)
cghMCR (70)
CGHnormaliter (55)
CGHregions (67)
ChAMP (508)
CHARGE (47)
charm (50)
ChemmineOB (485)
ChemmineR (423)
chemminer (0)
CHETAH (72)
ChIC (46)
Chicago (88)
chimera (70)
chimeraviz (99)
ChIPanalyser (50)
ChIPComp (64)
chipenrich (101)
ChIPexoQual (52)
ChIPpeakAnno (796)
ChIPQC (262)
ChIPseeker (1067)
chipseq (473)
ChIPseqR (126)
ChIPSeqSpike (72)
ChIPsim (126)
ChIPXpress (45)
chopsticks (128)
chroGPS (55)
chromDraw (59)
ChromHeatMap (76)
ChromoViz (1)
chromPlot (101)
chromstaR (73)
chromswitch (51)
chromVAR (234)
CHRONOS (72)
cicero (156)
cindex (1)
CINdex (54)
circRNAprofiler (18)
cisPath (65)
ClassifyR (69)
cleanUpdTSeq (65)
cleaver (154)
clippda (63)
clipper (79)
cliqueMS (20)
Clomial (59)
Clonality (64)
clonotypeR (58)
clst (62)
clstutils (55)
CluMSID (44)
clustComp (56)
clusterExperiment (482)
ClusterJudge (48)
clusterProfiler (5665)
clusterprofiler (0)
clusterSeq (53)
ClusterSignificance (55)
clusterStab (130)
clustifyr (1)
CMA (140)
cn.farms (60)
cn.mops (165)
CNAnorm (68)
cnanorm (0)
CNEr (554)
CNORdt (62)
CNORfeeder (72)
CNORfuzzy (57)
CNORode (99)
CNPBayes (38)
CNTools (167)
CNVfilteR (14)
cnvGSA (61)
CNVPanelizer (71)
CNVRanger (52)
CNVrd2 (56)
CNVtools (74)
cnvtools (0)
cobindR (56)
CoCiteStats (61)
COCOA (55)
codelink (64)
CODEX (132)
coexnet (63)
CoGAPS (116)
cogena (79)
coGPS (56)
COHCAP (72)
cola (35)
coMET (78)
compartmap (48)
COMPASS (84)
compcodeR (86)
compEpiTools (68)
CompGO (73)
ComplexHeatmap (4517)
condcomp (20)
CONFESS (49)
consensus (49)
ConsensusClusterPlus (2542)
consensusDE (56)
consensusOV (57)
consensusSeekeR (58)
contiBAIT (61)
conumee (102)
convert (143)
copa (64)
COPDSexualDimorphism (1)
copynumber (296)
CopyNumber450k (2)
CopyNumberPlots (38)
CopywriteR (111)
coRdon (77)
CoRegFlux (29)
CoRegNet (76)
Cormotif (55)
CorMut (61)
coRNAi (5)
CORREP (56)
coseq (91)
cosmiq (61)
cosmo (1)
cosmoGUI (0)
COSNet (54)
CountClust (104)
countsimQC (58)
covEB (58)
CoverageView (88)
covRNA (50)
cpvSNP (56)
cqn (203)
CRImage (80)
CRISPRseek (109)
crisprseekplus (51)
CrispRVariants (96)
crlmm (145)
CrossICC (13)
crossmeta (73)
CSAR (132)
csaw (262)
CSSP (57)
CSSQ (4)
ctc (275)
CTDquerier (45)
ctgGEM (1)
cTRAP (45)
ctsGE (72)
cummeRbund (548)
cummerbund (0)
customProDB (111)
CVE (54)
cycle (58)
cydar (98)
CytoDx (57)
cytofast (45)
cytofkit (110)
cytolib (795)
CytoML (382)

D

dada2 (1442)
dagLogo (55)
daMA (54)
DAMEfinder (2)
DaMiRseq (82)
DAPAR (116)
DART (59)
DASC (3)
DASiR (3)
DAVIDQuery (2)
DBChIP (97)
dcanr (40)
dcGSA (61)
DChIPRep (56)
ddCt (113)
ddgraph (6)
DDiGGER (0)
ddPCRclust (48)
dearseq (4)
debCAM (13)
debrowser (208)
DECIPHER (998)
deco (40)
DEComplexDisease (48)
decompTumor2Sig (37)
DeconRNASeq (166)
decontam (182)
DEDS (94)
DeepBlueR (80)
deepSNV (96)
DEFormats (198)
DEGraph (59)
DEGreport (287)
DEGseq (260)
DelayedArray (18274)
DelayedDataFrame (38)
DelayedMatrixStats (4294)
deltaCaptureC (12)
deltaGseg (58)
DeMAND (59)
DeMixT (57)
DEP (247)
DepecheR (44)
DEqMS (64)
derfinder (428)
derfinderHelper (381)
derfinderPlot (91)
DEScan2 (62)
deseq (0)
DESeq (3842)
DESeq2 (10747)
DEsingle (143)
destiny (792)
DEsubs (54)
DEWSeq (14)
DEXSeq (623)
dexus (59)
DFP (55)
DIAlignR (2)
DiffBind (693)
diffcoexp (55)
diffcyt (180)
diffgeneanalysis (0)
diffGeneAnalysis (56)
diffHic (92)
DiffLogo (65)
diffloop (102)
diffuStats (64)
diggit (59)
Director (46)
DirichletMultinomial (919)
discordant (63)
DiscoRhythm (33)
dittoSeq (1)
divergence (30)
dks (54)
DMCFB (13)
DMCHMM (52)
DMRcaller (100)
DMRcate (638)
DMRforPairs (54)
DMRScan (52)
dmrseq (104)
DNABarcodeCompatibility (34)
DNABarcodes (110)
DNAcopy (2314)
DNaseR (1)
DNAshapeR (85)
domainsignatures (6)
DominoEffect (54)
doppelgangR (56)
DOQTL (51)
Doscheda (62)
DOSE (5723)
doseR (32)
drawProteins (82)
DRIMSeq (249)
DriverNet (63)
DropletUtils (672)
DrugVsDisease (60)
dSimer (31)
DSS (730)
DTA (56)
dualKS (55)
DupChecker (56)
dupRadar (100)
dyebias (56)
DynDoc (503)
dyndoc (0)

E

EasyqpcR (101)
easyreporting (4)
easyrnaseq (0)
easyRNASeq (121)
EBarrays (125)
EBcoexpress (59)
EBImage (2250)
EBSEA (52)
EBSeq (453)
EBSeqHMM (89)
ecolitk (59)
EDASeq (2443)
edd (1)
EDDA (61)
edge (120)
edger (0)
edgeR (11950)
eegc (51)
EGAD (63)
EGSEA (211)
eiR (55)
eisa (72)
ELBOW (56)
ELMER (347)
EMDomics (62)
EmpiricalBrownsMethod (84)
ENCODExplorer (84)
EnhancedVolcano (1087)
EnMCB (4)
ENmix (148)
EnrichedHeatmap (150)
EnrichmentBrowser (270)
enrichplot (5108)
enrichTF (34)
ensembldb (5383)
ensemblVEP (133)
ENVISIONQuery (54)
EpiCluster (0)
EpiDISH (130)
epigenomix (61)
epihet (35)
epiNEM (55)
epivizr (76)
epivizrChart (48)
epivizrData (77)
epivizrServer (78)
epivizrStandalone (65)
erccdashboard (85)
erma (158)
ERSSA (49)
esATAC (156)
esetVis (67)
eudysbiome (51)
evaluomeR (32)
EventPointer (65)
EWCE (2)
ExCluster (42)
ExiMiR (56)
exomeCopy (225)
exomecopy (0)
exomePeak (85)
exomePeak2 (1)
exonfindR (0)
exonmap (0)
ExperimentHub (1700)
ExperimentHubData (74)
explorase (37)
ExpressionAtlas (87)
ExpressionView (59)
exprExternal (0)
externalVector (1)

F

fabia (123)
facopy (15)
factDesign (62)
FamAgg (76)
farms (64)
fastLiquidAssociation (54)
FastqCleaner (63)
fastseg (596)
fbat (1)
FCBF (50)
fCCAC (49)
fCI (60)
fcoex (14)
fcScan (14)
fdrame (58)
FELLA (97)
FEM (424)
ffpe (64)
FGNet (102)
fgsea (6069)
FindMyFriends (81)
FISHalyseR (55)
fishpond (54)
FitHiC (67)
flagme (59)
flipflop (29)
flowAI (267)
flowBeads (65)
flowBin (65)
flowcatchR (53)
flowCHIC (66)
flowCL (108)
flowClean (136)
flowClust (540)
flowCore (1583)
flowCyBar (58)
flowDensity (158)
flowFit (59)
flowFlowJo (1)
flowFP (99)
flowMap (58)
flowMatch (69)
flowMeans (156)
flowMerge (82)
flowPeaks (99)
flowPhyto (1)
flowPloidy (57)
flowPlots (58)
flowq (0)
flowQ (14)
flowQB (38)
FlowRepositoryR (62)
FlowSOM (755)
flowSpecs (15)
flowSpy (14)
flowStats (531)
flowTime (62)
flowTrans (85)
flowType (69)
flowUtils (611)
flowViz (819)
flowVS (66)
flowworkspace (0)
flowWorkspace (743)
fmcsR (171)
focalCall (53)
FoldGO (44)
FourCSeq (71)
frenchFISH (1)
FRGEpistasis (59)
frma (159)
frmaTools (62)
FunChIP (49)
FunciSNP (61)
funtooNorm (48)

G

GA4GHclient (52)
ga4ghclient (1)
GA4GHshiny (49)
gaga (76)
gage (875)
gaggle (53)
gaia (163)
GAPGOM (31)
GAprediction (50)
garfield (59)
GARS (46)
GateFinder (59)
gaucho (15)
gcapc (53)
gcatest (53)
gCMAP (55)
gCMAPWeb (37)
gCrisprTools (70)
gcrma (1692)
GCSscore (12)
GDCRNATools (268)
GDSArray (75)
gdsfmt (1184)
geecc (53)
GEM (57)
gemini (14)
genArise (62)
genbankr (150)
GENE.E (6)
gene2pathway (1)
GeneAccord (35)
GeneAnswers (101)
geneAttribution (52)
GeneBreak (51)
geneClassifiers (51)
GeneExpressionSignature (69)
genefilter (13737)
genefu (317)
GeneGA (49)
GeneGeneInteR (56)
GeneGroupAnalysis (1)
GeneMeta (84)
GeneNetworkBuilder (84)
GeneOverlap (243)
geneplast (53)
geneplotter (10684)
GeneR (1)
geneRecommender (60)
GeneRegionScan (54)
GeneRfold (1)
geneRxCluster (54)
GeneSelectMMD (62)
GeneSelector (29)
GENESIS (189)
GeneSpring (1)
GeneStructureTools (70)
geNetClassifier (89)
genetics (1)
GeneticsBase (0)
GeneticsDesign (72)
GeneticsPed (113)
GeneTonic (1)
GeneTraffic (0)
GeneTS (1)
geneXtendeR (53)
GENIE3 (347)
genoCN (58)
GenoGAM (68)
genomation (359)
GenomeBase (1)
GenomeGraphs (198)
GenomeInfoDb (19442)
genomeinfodb (0)
genomeIntervals (221)
genomeintervals (0)
genomes (78)
GenomicAlignments (13117)
genomicalignments (0)
GenomicDataCommons (709)
GenomicFeatures (12075)
GenomicFiles (683)
GenomicInteractions (151)
GenomicOZone (14)
GenomicRanges (20103)
GenomicScores (300)
GenomicTuples (57)
Genominator (66)
genoset (155)
genotypeeval (55)
GenoView (2)
genphen (66)
GenRank (53)
GenVisR (357)
GEOmetadb (235)
GEOquery (5057)
GEOsearch (4)
GEOsubmission (55)
gep2pep (49)
gespeR (83)
GEWIST (50)
gff3Plotter (0)
GGBase (107)
ggbio (1717)
ggcyto (565)
GGtools (97)
ggtree (1976)
GIGSEA (36)
girafe (127)
GISPA (55)
GLAD (219)
GladiaTOX (27)
Glimma (973)
glmSparseNet (41)
GlobalAncova (301)
globalSeq (52)
globaltest (939)
gmapR (89)
GmicR (15)
GMRP (53)
GNET2 (31)
goCluster (0)
GOexpress (125)
GOfuncR (110)
GOFunction (69)
GoogleGenomics (21)
GOpro (56)
goProfiles (115)
goprofiles (0)
gosemsim (0)
GOSemSim (5263)
goseq (1064)
GOSim (120)
goSTAG (57)
gostats (0)
GOstats (2405)
GOsummaries (94)
GOTHiC (76)
goTools (84)
gotools (0)
gpart (65)
gpls (120)
gprege (60)
gpuMagic (10)
gQTLBase (146)
gQTLstats (173)
gramm4R (16)
graper (33)
graph (12098)
GraphAlignment (61)
GraphAT (56)
graphite (1301)
GraphPAC (62)
GRENITS (63)
GreyListChIP (58)
GRmetrics (117)
groHMM (68)
GRridge (58)
GSALightning (54)
GSAR (150)
GSCA (58)
gscreend (13)
GSEABase (4342)
gseabase (0)
GSEABenchmarkeR (69)
GSEAlm (109)
gsean (61)
GSReg (58)
GSRI (55)
GSVA (1461)
gtrellis (139)
GUIDEseq (70)
Guitar (93)
Gviz (3037)
gwascat (299)
GWASTools (388)
gwasurvivr (53)

H

h5vc (65)
hapFabia (56)
Harman (173)
Harshlight (54)
harshlight (0)
HCABrowser (34)
HCAExplorer (13)
HCsnip (7)
HDF5Array (5089)
HDTD (54)
heatmaps (223)
Heatplus (529)
HelloRanges (82)
HELP (59)
HEM (56)
hexbin (1)
hiAnnotator (74)
HIBAG (96)
HiCBricks (40)
hicbricks (1)
HiCcompare (100)
hicrep (83)
hierGWAS (60)
hierinf (35)
HilbertCurve (84)
HilbertVis (190)
HilbertVisGUI (37)
HiLDA (16)
hipathia (70)
hiReadsProcessor (52)
HIREewas (39)
HiTC (160)
hmdbQuery (68)
HMMcopy (191)
hopach (230)
HPAanalyze (48)
hpar (240)
HTqPCR (153)
HTSanalyzeR (132)
HTSeqGenie (36)
htseqtools (0)
htSeqTools (96)
HTSFilter (188)
HumanTranscriptomeCompendium (42)
HybridMTest (78)
hypeR (48)
hyperdraw (80)
hypergraph (116)

I

iASeq (52)
iasva (48)
iBBiG (103)
ibh (51)
iBMQ (43)
iCARE (61)
Icens (278)
icetea (47)
iCheck (54)
iChip (53)
iClusterPlus (161)
iCNV (57)
iCOBRA (101)
ideal (89)
ideogram (0)
IdeoViz (84)
idiogram (55)
IdMappingAnalysis (48)
IdMappingRetrieval (51)
idr2d (14)
iFlow (1)
iGC (54)
IgGeneUsage (14)
igvR (65)
IHW (826)
illuminaio (2444)
imageHTS (69)
IMAS (60)
Imetagene (51)
IMMAN (54)
ImmuneSpaceR (76)
immunoClust (56)
IMPCdata (51)
ImpulseDE (59)
ImpulseDE2 (110)
impute (6228)
INDEED (39)
infercnv (182)
InPAS (60)
INPower (52)
inSilicoDb (12)
inSilicoMerging (13)
insilicomerging (0)
INSPEcT (75)
InTAD (62)
intansv (62)
InteractionSet (339)
interactiveDisplay (108)
interactiveDisplayBase (3270)
IntEREst (74)
InterMineR (81)
IntramiRExploreR (44)
inversion (0)
inveRsion (55)
IONiseR (67)
iontree (5)
iPAC (67)
ipdDb (35)
IPO (132)
IPPD (126)
IRanges (28635)
IrisSpatialFeatures (11)
iSEE (233)
iSeq (56)
iSNetwork (0)
isobar (143)
IsoCorrectoR (51)
IsoCorrectoRGUI (38)
IsoformSwitchAnalyzeR (168)
IsoGeneGUI (52)
ISoLDE (50)
isomiRs (80)
iSPlot (0)
ITALICS (51)
iterativeBMA (59)
iterativebma (0)
iterativeBMAsurv (56)
iterClust (53)
iteremoval (45)
IVAS (69)
ivygapSE (50)
IWTomics (50)

J

JASPAR2018 (10)
jmosaics (3)
joda (53)
JunctionSeq (115)

K

karyoploteR (487)
KCsmart (54)
kebabs (123)
KEGGgraph (3145)
KEGGlincs (60)
keggorth (1)
keggorthology (80)
KEGGprofile (202)
KEGGREST (4185)
KEGGSOAP (2)
kimod (54)
KinSwingR (41)
kissDE (53)
kmknn (0)
KnowSeq (22)

L

lapmix (53)
LBE (117)
ldblock (96)
LEA (312)
LedPred (53)
les (56)
levi (36)
lfa (189)
limma (19361)
limmaGUI (88)
LINC (48)
LineagePulse (59)
LinkHD (13)
Linnorm (131)
lionessR (13)
lipidr (39)
LiquidAssociation (56)
lmdme (58)
LMGene (67)
LOBSTAHS (61)
loci2path (46)
logicFS (138)
logitT (57)
Logolas (69)
lol (53)
LOLA (133)
LoomExperiment (74)
LowMACA (64)
LPE (74)
LPEadj (57)
lpNet (53)
lpsymphony (842)
LRBaseDbi (58)
lumi (1029)
LVSmiRNA (57)
LymphoSeq (68)

M

M3C (249)
M3D (62)
M3Drop (233)
maanova (74)
Maaslin2 (32)
macat (57)
maCorrPlot (56)
MACPET (46)
MACSQuantifyR (11)
maDB (1)
madb (0)
made4 (294)
MADSEQ (54)
maftools (1359)
MAGeCKFlute (191)
maigesPack (61)
MAIT (94)
makecdfenv (145)
makePlatformDesign (1)
MANOR (51)
manta (65)
MantelCorr (52)
mAPKL (55)
maPredictDSC (53)
mapscape (53)
marray (1394)
martini (50)
maser (56)
maSigPro (267)
maskBAD (54)
MassArray (59)
massarray (0)
massiR (57)
MassSpecWavelet (1047)
MAST (809)
matchBox (52)
matchprobes (1)
Matrix (0)
MatrixRider (52)
matter (122)
MaxContrastProjection (61)
MBAmethyl (50)
MBASED (59)
MBCB (54)
mbkmeans (50)
mBPCR (53)
MBQN (5)
MBttest (49)
mcaGUI (53)
MCbiclust (67)
MCRestimate (58)
mCSEA (66)
mdgsa (71)
mdp (60)
mdqc (61)
MDTS (46)
MEAL (62)
MeasurementError.cor (52)
MEAT (1)
MEB (11)
MEDIPS (113)
MEDME (51)
MEIGOR (78)
Melissa (33)
mergemaid (0)
MergeMaid (86)
Mergeomics (60)
MeSHDbi (180)
meshes (89)
meshr (104)
MeSHSim (4)
messina (52)
metaArray (76)
metaarray (0)
Metab (64)
metabomxtr (72)
MetaboSignal (70)
metaCCA (62)
MetaCyto (63)
metagene (79)
metagene2 (34)
metagenomeFeatures (73)
metagenomeSeq (617)
MetaGxOvarian (1)
metahdep (52)
metaMS (106)
MetaNeighbor (76)
metaR (0)
metaSeq (63)
metaseqR (91)
metavizr (64)
MetaVolcanoR (29)
metaX (3)
MetCirc (60)
MethCP (11)
methimpute (51)
methInheritSim (51)
MethPed (59)
methrix (15)
MethTargetedNGS (52)
methVisual (60)
methyAnalysis (113)
MethylAid (72)
methylCC (13)
methylGSA (87)
methylInheritance (52)
methylKit (439)
MethylMix (119)
methylMnM (57)
methylPipe (77)
MethylSeekR (105)
methylumi (1188)
methyvim (49)
MetID (35)
MetNet (51)
mfa (73)
Mfuzz (298)
mfuzz (0)
MGFM (60)
MGFR (72)
mgsa (82)
MiChip (52)
microbiome (587)
microbiomeDASim (13)
microRNA (134)
MIGSA (56)
mimager (49)
MIMOSA (60)
MineICA (68)
minet (549)
minfi (1763)
MinimumDistance (50)
MiPP (54)
MIRA (76)
MiRaGE (65)
miRBaseConverter (82)
miRcomp (52)
mirIntegrator (54)
miRLAB (68)
miRmine (51)
miRNAmeConverter (60)
miRNApath (70)
miRNAtap (122)
miRSM (40)
miRsponge (51)
miRspongeR (43)
Mirsynergy (53)
missMethyl (743)
missRows (45)
mitch (5)
mitoODE (52)
mixOmics (1531)
MLInterfaces (420)
mlm4omics (35)
MLP (81)
MLSeq (161)
MMAPPR2 (14)
MMDiff (3)
MMDiff2 (52)
mmgmos (1)
mmnet (3)
MmPalateMiRNA (54)
MMUPHin (13)
mnem (32)
MODA (62)
Modstrings (41)
MOFA (92)
mogsa (70)
monocle (1738)
MoonlightR (63)
MoPS (52)
mosaics (83)
MOSim (12)
motifbreakR (80)
motifcounter (58)
MotifDb (340)
motifmatchr (339)
motifRG (118)
motifStack (438)
MotIV (448)
MPFE (51)
mpra (53)
MPRAnalyze (52)
mQTL.NMR (15)
msa (885)
msbase (0)
mscalib (0)
msgbsR (58)
MSGFgui (113)
MSGFplus (228)
msmsEDA (154)
msmsTests (137)
MSnbase (1534)
MSnID (200)
msPurity (91)
msQC (0)
MSstats (286)
MSstatsQC (60)
MSstatsQCgui (52)
MSstatsSampleSize (12)
MSstatsTMT (86)
mtbls2 (0)
MTseeker (33)
Mulcom (125)
MultiAssayExperiment (1114)
multiClust (91)
MultiDataSet (216)
multiHiCcompare (48)
MultiMed (54)
multiMiR (110)
multiOmicsViz (55)
multiscan (51)
multtest (8156)
muscat (27)
muscle (170)
MutationalPatterns (243)
MVCClass (54)
mvGST (5)
MWASTools (86)
mygene (339)
myvariant (84)
mzID (1431)
mzR (1682)

N

NADfinder (59)
NanoStringDiff (97)
NanoStringQCPro (83)
nanotatoR (31)
NarrowPeaks (59)
NBAMSeq (30)
NBSplice (49)
ncdfFlow (704)
ncGTW (15)
NCIgraph (62)
ndexr (74)
neaGUI (3)
NeighborNet (33)
nem (105)
netbenchmark (60)
netbiov (90)
netboost (27)
netboxr (5)
NetCRG (0)
netDx (2)
nethet (58)
NetPathMiner (75)
netprioR (48)
netReg (58)
netresponse (62)
NetSAM (52)
netSmooth (51)
networkBMA (60)
NGScopy (40)
ngsReports (50)
nnNorm (53)
NOISeq (596)
nondetects (65)
normalize450K (49)
NormalyzerDE (66)
NormqPCR (270)
normr (73)
NPARC (4)
npGSEA (57)
NTW (51)
nucleoSim (51)
nucleR (81)
nucler (0)
nuCpos (34)
nudge (15)
NuPoP (59)

O

occugene (50)
OCplus (126)
odseq (53)
OGSA (50)
oligo (1521)
oligoClasses (1637)
OLIN (57)
OLINgui (52)
OmaDB (71)
omicade4 (90)
omiccircos (0)
OmicCircos (238)
omicplotR (66)
omicRexposome (62)
OmicsLonDA (39)
omicsmarker (1)
OmicsMarkeR (82)
OMICsPCA (38)
omicsPrint (48)
OmnipathR (22)
Onassis (53)
oncomix (51)
OncoScore (53)
OncoSimulR (64)
oneChannelGUI (9)
oneSENSE (57)
onlineFDR (37)
ontoCAT (7)
ontoProc (67)
ontoTools (1)
openCyto (495)
openPrimeR (89)
openPrimeRui (56)
OperaMate (4)
oposSOM (72)
oppar (51)
oppti (11)
OPWeight (67)
OrderedList (111)
ORFik (91)
Organism.dplyr (377)
OrganismDbi (2356)
OSAT (66)
Oscope (75)
OTUbase (57)
OutlierD (69)
OUTRIDER (90)
OVESEG (30)

P

PAA (68)
packFinder (2)
PADOG (224)
PAIRADISE (30)
paircompviz (60)
pairseqsim (0)
pamr (1)
PAN (0)
pandaR (74)
panelcn.mops (64)
PAnnBuilder (16)
panp (61)
PANR (56)
PanVizGenerator (58)
PAPi (74)
parglms (51)
parody (74)
PAST (38)
Path2PPI (67)
pathifier (226)
PathNet (48)
PathoStat (64)
pathprint (51)
pathRender (55)
pathVar (54)
pathview (3088)
pathwayPCA (52)
PathwaySplice (67)
PatientGeneSets (0)
paxtoolsr (94)
Pbase (57)
pbcmc (14)
pcaExplorer (348)
pcaGoPromoter (90)
pcaMethods (2902)
PCAN (52)
PCAtools (193)
pcot2 (120)
PCpheno (56)
pcxn (50)
pdInfoBuilder (123)
pdmclass (7)
peakPantheR (14)
PECA (64)
PepsNMR (72)
pepStat (57)
pepXMLTab (61)
PERFect (12)
perturbatr (47)
PGA (64)
pga (1)
pgca (56)
PGSEA (219)
pgUtils (1)
phantasus (64)
PharmacoGx (165)
phemd (37)
phenoDist (14)
phenopath (83)
phenoTest (101)
PhenStat (67)
philr (128)
phosphonormalizer (53)
PhyloProfile (19)
phyloseq (3168)
Pi (70)
piano (306)
pickgene (52)
PICS (121)
Pigengene (88)
PING (50)
pint (51)
pipeFrame (35)
pkgDepTools (78)
plateCore (45)
plethy (53)
plgem (89)
plier (180)
plotGrouper (42)
PLPE (58)
plrs (53)
plw (54)
plyranges (315)
pmm (48)
pmp (2)
podkat (56)
pogos (59)
polyester (132)
Polyfit (54)
POST (47)
PoTRA (30)
PowerExplorer (52)
powerTCR (53)
PPInfer (63)
ppiStats (67)
pqsfinder (80)
prada (296)
pram (31)
prebs (64)
PrecisionTrialDrawer (33)
PREDA (77)
predictionet (39)
preprocessCore (9524)
primirTSS (36)
PrInCE (36)
Prize (56)
proBAMr (64)
proBatch (41)
PROcess (131)
procoil (58)
ProCoNA (14)
proDA (19)
proFIA (60)
profileplyr (39)
profileScoreDist (47)
progeny (96)
projectR (45)
pRoloc (288)
pRolocGUI (77)
PROMISE (54)
PROPER (77)
PROPS (47)
Prostar (98)
prostar (1)
prot2D (22)
proteinProfiles (52)
ProteomicsAnnotationHubData (54)
ProteoMM (54)
proteoQC (57)
ProtGenerics (5394)
PSEA (56)
psichomics (98)
PSICQUIC (78)
psygenet2r (54)
PubScore (4)
pulsedSilac (12)
puma (123)
PureCN (133)
pvac (57)
pvca (186)
Pviz (67)
PWMEnrich (97)
pwOmics (55)
pwrEWAS (17)
pxr (0)

Q

qckitfastq (34)
qcmetrics (77)
QDNAseq (206)
qpcrNorm (62)
qpgraph (125)
qPLEXanalyzer (54)
qrqc (144)
qsea (61)
qsmooth (42)
QSutils (44)
qtbase (0)
Qtlizer (13)
qtpaint (0)
QUALIFIER (67)
quantro (113)
quantsmooth (402)
QuartPAC (54)
QuasR (272)
QuaternaryProd (73)
QUBIC (99)
qusage (232)
qvalue (7438)

R

R3CPET (51)
r3Cseq (118)
R453Plus1Toolbox (58)
R4RNA (60)
RaggedExperiment (525)
rain (87)
rama (60)
ramigo (0)
RamiGO (25)
ramwas (65)
RandomWalkRestartMH (58)
randPack (59)
RankProd (342)
RareVariantVis (54)
Rariant (50)
RbcBook1 (60)
RBGL (7292)
RBioinf (68)
rbioinf (0)
rBiopaxParser (146)
RBM (52)
Rbowtie (286)
Rbowtie2 (188)
rbsurv (88)
Rcade (72)
RCAS (62)
RCASPAR (58)
rcellminer (68)
rCGH (75)
Rchemcpp (68)
RchyOptimyx (58)
RcisTarget (326)
RCM (35)
RConferoMapping (0)
Rcpi (133)
Rcwl (43)
RcwlPipelines (32)
RCy3 (518)
RCyjs (64)
RCytoscape (20)
RDAVIDWebService (348)
Rdbi (1)
RdbiPgSQL (0)
rDGIdb (63)
Rdisop (275)
RDRToolbox (144)
ReactomeGSA (14)
ReactomePA (1120)
readat (80)
ReadqPCR (278)
reb (50)
REBET (32)
receptLoss (1)
reconsi (1)
recount (372)
recoup (62)
RedeR (150)
REDseq (112)
RefNet (51)
RefPlus (57)
regioneR (1316)
regionReport (132)
regsplice (63)
REMP (66)
Repitools (227)
ReportingTools (927)
reposTools (1)
RepViz (32)
ReQON (51)
Resourcerer (1)
restfulSE (85)
rexposome (59)
rfcdmin (1)
rflowcyt (1)
rfPred (53)
rGADEM (523)
RGalaxy (61)
Rgin (46)
RGMQL (44)
RGraph2js (50)
Rgraphviz (7343)
rGREAT (201)
RGSEA (98)
rgsepd (73)
rhdf5 (9474)
rhdf5client (90)
Rhdf5lib (10555)
Rhisat2 (188)
Rhtslib (10762)
rHVDM (34)
RiboProfiling (79)
ribor (1)
riboSeq (0)
riboSeqR (73)
ribosomeProfilingQC (1)
RImmPort (53)
Ringo (261)
Rintact (1)
RIPSeeker (109)
Risa (57)
RITAN (70)
RIVER (52)
RJMCMCNucleosomes (47)
RLMM (53)
RMAGEML (1)
Rmagpie (57)
RMAPPER (1)
RMassBank (89)
rMAT (42)
rmelting (33)
RmiR (54)
rmir (0)
Rmmquant (41)
RNAAgeCalc (1)
RNAdecay (42)
RNAinteract (63)
RNAither (62)
rnaither (0)
RNAmodR (19)
RNAmodR.AlkAnilineSeq (16)
RNAmodR.ML (16)
RNAmodR.RiboMethSeq (16)
RNAprobR (51)
RNAsense (11)
rnaseqcomp (56)
RnaSeqGeneEdgeRQL (3)
rnaSeqMap (69)
RNASeqPower (130)
RNASeqR (44)
RnaSeqSampleSize (95)
RnBeads (256)
Rnits (55)
roar (68)
ROC (941)
Roleswitch (71)
Rolexa (2)
rols (267)
roma (0)
ROntoTools (90)
ropls (476)
ROTS (161)
RPA (70)
RProtoBufLib (661)
RpsiXML (75)
rpx (290)
Rqc (130)
rqt (48)
rqubic (96)
rRDP (68)
Rredland (1)
RRHO (80)
rrvgo (1)
Rsamtools (14970)
rsbml (90)
rScudo (35)
RSeqAn (51)
rSFFreader (25)
RSNPper (1)
Rsubread (1423)
RSVSim (71)
rSWeeP (1)
rTANDEM (153)
RTCA (65)
RTCGA (566)
RTCGAToolbox (454)
RTN (133)
RTNduals (74)
RTNsurvival (72)
RTools4TB (0)
RTopper (56)
rtracklayer (13000)
Rtreemix (55)
rTRM (63)
rTRMui (49)
runibic (73)
Ruuid (1)
RUVcorr (64)
RUVnormalize (68)
RUVSeq (790)
RVS (62)
RWebServices (2)
rWikiPathways (160)

S

S4Vectors (28162)
safe (390)
SAGElyzer (0)
sagenhaft (52)
SAGx (159)
SAIGEgds (14)
samExploreR (53)
sampleClassifier (59)
SamSPECTRAL (92)
sangerseqR (258)
SANTA (58)
sapFinder (54)
saps (2)
sarks (1)
savR (75)
SBGNview (18)
sbgr (2)
SBMLR (65)
SC3 (452)
Scale4C (47)
scAlign (43)
SCAN.UPC (119)
SCANVIS (15)
scater (2845)
scBFA (14)
SCBN (39)
scDblFinder (24)
scDD (137)
scde (313)
scds (61)
scFeatureFilter (44)
scfind (79)
scGPS (16)
schex (34)
ScISI (70)
scMAGeCK (4)
scmap (175)
scMerge (72)
scmeth (58)
SCnorm (176)
scone (164)
Sconify (62)
SCOPE (1)
scoreInvHap (46)
scPCA (14)
scPipe (99)
scran (1620)
scRecover (41)
scruff (63)
scsR (49)
scTensor (58)
scTGIF (13)
scTHI (1)
SDAMS (62)
segmentSeq (115)
selectKSigs (5)
SELEX (59)
SemDist (49)
semisup (46)
SemSim (1)
SEPA (35)
SEPIRA (45)
seq2pathway (63)
SeqArray (457)
seqbias (68)
seqCAT (66)
seqCNA (60)
seqcombo (70)
SeqGSEA (176)
seqLogo (1220)
Seqnames (0)
seqPattern (349)
seqplots (128)
seqsetvis (70)
SeqSQC (51)
seqTools (101)
SeqVarTools (371)
sesame (626)
SEtools (16)
sevenbridges (90)
sevenC (50)
SGSeq (275)
SharedObject (13)
shinyMethyl (105)
shinyTANDEM (64)
ShortRead (5392)
shortread (0)
SIAMCAT (79)
SICtools (35)
sidap (0)
sigaR (72)
SigCheck (58)
sigFeature (65)
SigFuge (50)
siggenes (1866)
sights (68)
signatureSearch (18)
signeR (89)
signet (52)
sigPathway (140)
SigsPack (15)
sigsquared (49)
SIM (53)
SIMAT (67)
SimBindProfiles (49)
SIMD (34)
SimFFPE (1)
similaRpeak (53)
SIMLR (105)
simpleaffy (601)
simulatorAPMS (0)
simulatorZ (53)
sincell (69)
SingleCellExperiment (3691)
singleCellTK (91)
SingleR (326)
singscore (434)
SISPA (57)
sitePath (29)
sizepower (65)
SJava (2)
skewr (49)
slalom (60)
SLGI (56)
slingshot (461)
slinky (58)
SLqPCR (69)
SMAD (36)
SMAP (53)
SMITE (69)
SNAData (0)
SNAGEE (51)
snapCGH (64)
snm (140)
snpAssoc (0)
SNPchip (222)
SNPediaR (53)
SNPhood (47)
snpMatrix (1)
snpMatrix2 (0)
SNPRelate (993)
snpStats (1218)
soGGi (137)
sojourner (12)
SomatiCA (3)
SomaticSignatures (176)
SpacePAC (60)
spade (9)
Spaniel (14)
sparseDOSSA (49)
sparsenetgls (37)
SparseSignatures (49)
SpatialCPie (30)
specL (56)
SpeCond (114)
SpectralTAD (34)
SPEM (74)
SPIA (441)
SpidermiR (100)
spikeLI (50)
spkTools (51)
splatter (316)
splicegear (49)
spliceR (25)
spliceSites (37)
SplicingGraphs (124)
splineTCDiffExpr (1)
splineTimeR (63)
SPLINTER (60)
splots (195)
SPONGE (54)
spotSegmentation (51)
SQLDataFrame (22)
SQUADD (49)
sRACIPE (31)
SRAdb (473)
sRAP (55)
SRGnet (47)
srnadiff (57)
sscore (54)
sscu (52)
sSeq (190)
ssize (87)
SSPA (311)
ssPATHS (11)
ssrch (43)
ssviz (66)
stageR (105)
stam (1)
STAN (67)
staRank (50)
StarBioTrek (54)
Starr (58)
STATegRa (58)
statTarget (99)
stepNorm (54)
stepwiseCM (4)
strandCheckR (34)
Streamer (66)
STRINGdb (481)
STROMA4 (59)
struct (2)
Structstrings (38)
structToolbox (2)
StructuralVariantAnnotation (65)
SubCellBarCode (31)
subSeq (88)
SummarizedBenchmark (62)
SummarizedExperiment (19335)
supraHex (279)
survcomp (623)
survtype (32)
Sushi (281)
sva (4781)
SVAPLSseq (49)
SVM2CRM (34)
SWATH2stats (73)
SwathXtend (49)
swfdr (52)
SwimR (51)
switchBox (63)
switchde (68)
synapter (124)
synergyfinder (132)
synlet (57)
SynMut (29)
systemPipeR (895)
systemPipeRdata (0)

T

TAPseq (1)
target (11)
TargetScore (61)
TargetSearch (74)
targetsearch (0)
TarSeqQC (54)
TCC (230)
TCGAbiolinks (1962)
TCGAbiolinksGUI (174)
TCGAutils (499)
TCseq (120)
TDARACNE (58)
tdaracne (0)
tenXplore (58)
TEQC (72)
ternarynet (51)
TFARM (45)
TFBSTools (571)
TFEA.ChIP (72)
TFHAZ (43)
TFutils (52)
tidybulk (1)
tiger (0)
tigre (54)
tilingArray (86)
timecourse (81)
TimerQuant (0)
timescape (80)
TimeSeriesExperiment (60)
TIN (48)
TissueEnrich (89)
TitanCNA (102)
tkWidgets (482)
TMixClust (70)
TNBC.CMS (27)
TnT (54)
TOAST (25)
tofsims (60)
ToPASeq (80)
topconfects (52)
topdownr (54)
topGO (2648)
topicmodels (0)
TPP (97)
TPP2D (33)
tracktables (86)
trackViewer (252)
tradeSeq (27)
transcriptogramer (52)
transcriptR (70)
transite (51)
tRanslatome (53)
TransView (65)
traseR (49)
TreeAndLeaf (1)
treeio (1764)
TreeSummarizedExperiment (31)
trena (45)
TReNA (2)
Trendy (73)
triform (51)
trigger (52)
trio (85)
triplex (57)
tRNA (42)
tRNAdbImport (33)
tRNAscanImport (47)
TRONCO (87)
TSCAN (170)
tscR (1)
tspair (60)
TSRchitect (58)
TSSi (36)
TTMap (48)
TurboNorm (51)
TVTB (57)
tweeDEseq (100)
twilight (118)
twoddpcr (53)
tximeta (377)
tximport (2269)
TxRegInfra (64)
TypeInfo (51)

U

Ularcirc (42)
UNDO (57)
unifiedWMWqPCR (53)
UniProt.ws (291)
Uniquorn (57)
universalmotif (94)
uSORT (59)

V

VanillaICE (76)
variancePartition (252)
VariantAnnotation (5487)
VariantExperiment (14)
VariantFiltering (61)
VariantTools (100)
vasp (1)
vbmp (80)
VCFArray (37)
Vega (55)
VegaMC (49)
VennDetail (44)
vidger (96)
viper (245)
virtualArray (5)
ViSEAGO (40)
vsn (3340)
vtpnet (44)
vulcan (52)

W

waddR (14)
wateRmelon (662)
wavClusteR (68)
waveTiling (48)
weaver (67)
webbioc (56)
widgetInvoke (1)
widgetTools (490)
wiggleplotr (81)
Wrench (345)

X

XBSeq (70)
XCIR (17)
xcms (1178)
XDE (53)
Xeva (32)
XINA (48)
xmapbridge (49)
xmapcore (1)
xps (66)
XVector (21047)
xvector (0)

Y

y2hStat (1)
yamss (58)
YAPSA (82)
yaqcaffy (68)
yarn (80)

Z

zFPKM (104)
zinbwave (627)
zlibbioc (22823)