See download stats for:    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor software packages

This page was generated on 2024-01-08 14:42:07 -0500 (Mon, 08 Jan 2024).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 75

1BiocVersion (53884)
2S4Vectors (51058)
3BiocGenerics (50855)
4GenomeInfoDb (50669)
5IRanges (46751)
6Biobase (44242)
7zlibbioc (44003)
8XVector (43096)
9BiocParallel (41895)
10DelayedArray (41505)
11Biostrings (40073)
12GenomicRanges (37916)
13AnnotationDbi (36239)
14MatrixGenerics (36143)
15SummarizedExperiment (34874)
16KEGGREST (33305)
17limma (31459)
18BiocFileCache (23511)
19biomaRt (21766)
20GenomicAlignments (21389)
21Rhtslib (21127)
22S4Arrays (21001)
23Rsamtools (20926)
24edgeR (20233)
25Rhdf5lib (20232)
26DESeq2 (19763)
27rtracklayer (19187)
28annotate (19101)
29rhdf5 (18264)
30treeio (18248)
31ggtree (17948)
32rhdf5filters (17820)
33GenomicFeatures (17563)
34graph (17404)
35BiocIO (17072)
36enrichplot (16467)
37clusterProfiler (16043)
38qvalue (15759)
39DOSE (15562)
40fgsea (15236)
41DelayedMatrixStats (14900)
42GOSemSim (14753)
43preprocessCore (14204)
44sparseMatrixStats (14081)
45SingleCellExperiment (13657)
46beachmat (13612)
47genefilter (13426)
48ComplexHeatmap (12394)
49BSgenome (11981)
50multtest (11333)
51BiocSingular (10994)
52ScaledMatrix (10938)
53geneplotter (10914)
54HDF5Array (10738)
55ProtGenerics (10674)
56impute (10026)
57AnnotationHub (9767)
58interactiveDisplayBase (9546)
59Rgraphviz (9336)
60scuttle (9269)
61AnnotationFilter (9157)
62ensembldb (9116)
63RBGL (9014)
64BiocNeighbors (8887)
65VariantAnnotation (8573)
66GEOquery (8443)
67affy (8032)
68GSEABase (7985)
69affyio (7921)
70SparseArray (7062)
71sva (6619)
72ExperimentHub (6566)
73scater (6107)
74ShortRead (5842)
75BiocStyle (5665)

All software packages

All software package stats in one file: bioc_pkg_stats.tab

All software package download scores in one file: bioc_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor software repository (all packages combined)

1

1imma (1)

A

a4 (53)
a4Base (106)
a4Classif (82)
a4Core (117)
a4Preproc (134)
a4Reporting (97)
ABAData (1)
ABAEnrichment (5)
abaenrichment (0)
ABarray (51)
abc (1)
abc.data (0)
abe (0)
abind (1)
abseqR (41)
ABSOLUTE (0)
ABSSeq (79)
acde (64)
ACE (71)
acepack (1)
aCGH (142)
ACME (65)
actuar (1)
ada (1)
adabag (1)
ADaCGH2 (46)
ADAM (97)
ADAMgui (52)
adaptest (2)
adductomicsR (44)
ade4 (2)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
ADImpute (60)
aditools (0)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (26)
admixtools (0)
ADMM (1)
adSplit (46)
adverSCarial (10)
AER (1)
afex (1)
affio (0)
AffiXcan (43)
affxparser (1522)
affy (8032)
affycomp (75)
AffyCompatible (27)
affyContam (72)
affycoretools (360)
affydata (1)
AffyExpress (3)
affyILM (41)
affyio (7921)
affylmGUI (49)
affyPara (3)
affypdnn (3)
affyPLM (1383)
affyplm (0)
affyQCReport (9)
AffyRNADegradation (41)
AffyTiling (2)
AGDEX (44)
aggregateBioVar (54)
aggregation (0)
AGHmatrix (1)
Agi4x44PreProcess (3)
agilp (93)
AgiMicroRna (119)
agricolae (5)
AHMassBank (23)
AICcmodavg (1)
AIMS (378)
AIPW (1)
airpart (40)
airr (1)
airway (1)
akima (1)
alabama (1)
alabaster (29)
alabaster.base (64)
alabaster.bumpy (57)
alabaster.files (9)
alabaster.mae (58)
alabaster.matrix (58)
alabaster.ranges (55)
alabaster.sce (53)
alabaster.schemas (64)
alabaster.se (55)
alabaster.spatial (55)
alabaster.string (55)
alabaster.vcf (53)
alakazam (1)
ald (1)
ALDEx2 (1064)
aldvmm (1)
alembic (1)
alevinQC (71)
AlgDesign (1)
alkahest.generic (1)
ALL (9)
AllelicImbalance (62)
alluvial (1)
almanac (1)
AlphaBeta (44)
alphahull (1)
AlphaMissenseR (1)
alphashape3d (1)
alpine (57)
ALPS (2)
AlpsNMR (55)
alr4 (1)
alsace (5)
altcdfenvs (70)
amap (1)
AMARETTO (83)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (0)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
AMOUNTAIN (88)
amplican (57)
ampliQueso (2)
AnalysisPageServer (2)
anamiR (3)
Anaquin (46)
ANCOMBC (1102)
AneuFinder (70)
AneuFinderData (0)
ANF (37)
animalcules (97)
animation (2)
annaffy (228)
AnnBuilder (1)
annbuilder (0)
anndata (1)
annmap (70)
annotate (19101)
annotation (1)
AnnotationDbi (36239)
annotationdbi (1)
AnnotationFilter (9157)
AnnotationForge (2514)
AnnotationFuncs (6)
AnnotationHub (9767)
AnnotationHubData (276)
annotationTools (104)
annotatr (436)
anota (58)
anota2seq (56)
anRichment (1)
anticlust (1)
antiProfiles (56)
AnVIL (585)
AnVILBilling (51)
AnVILPublish (40)
AnVILWorkflow (23)
anytime (3)
aod (1)
APAlyzer (52)
apcluster (1)
apComplex (42)
ape (10)
apeglm (3174)
apexcharter (1)
APL (74)
aplot (20)
appgen (1)
applera (1)
appreci8R (76)
aqp (1)
archive (1)
ArchR (1)
argparse (8)
argus.DS.Credentials (1)
argusDS.apc.utils (1)
argusDS.backtesting.engine (1)
argusDS.data (1)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (2)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.driver.importance (1)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (2)
argusDS.gamlss.modelling (2)
argusDS.gamlss.testing (1)
argusDS.gamlss.utils (1)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.spread.trading.utils (2)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (1)
argusDS.tabulator (1)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.utilities (1)
arm (1)
aroma.affymetrix (7)
aroma.apd (7)
aroma.core (8)
aroma.light (1815)
ArrayExpress (406)
arrayexpress (1)
ArrayExpressHTS (13)
arrayhelpers (1)
arrayMagic (2)
arrayMvout (39)
arrayop (1)
arrayQCplot (2)
arrayQuality (74)
arrayQualityMetrics (529)
arrayqualitymetrics (0)
ArrayTools (6)
ArrayTV (3)
ARRmNormalization (48)
arrow (12)
arsenal (1)
artMS (56)
arules (21)
ArvadosR (1)
ASAFE (49)
ASCAT (0)
ascii (1)
asciicast (1)
ASEB (53)
ASExtras4 (0)
ASGSCA (56)
ash (5)
ashr (1)
asht (1)
ASICS (61)
AsioHeaders (2)
askpass (83)
asmn (1)
asnipe (0)
ASpediaFI (14)
ASpli (74)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive.properties (6)
assertive.types (6)
assertr (1)
assertthat (1)
AssessORF (41)
ASSET (98)
ASSIGN (69)
AssotesteR (1)
ASURAT (51)
ATACCoGAPS (35)
ATACseqQC (301)
ATACseqTFEA (41)
ATE (0)
atena (78)
AtlasRDF (1)
ATR (1)
atSNP (44)
attachment (3)
attempt (1)
attract (41)
AUC (1)
AUCell (1949)
audio (1)
autonomics (46)
Autotuner (3)
av (1)
ava2 (1)
AWFisher (45)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (5)
aws.signature (5)
awst (44)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (1)
AzureGraph (1)
AzureRMR (2)
AzureStor (1)

B

BaalChIP (48)
babelgene (2)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
babynames (1)
BAC (29)
backports (71)
bacon (89)
bacr (0)
BADER (61)
badger (1)
BadRegionFinder (38)
BAGS (40)
baguette (1)
bain (1)
BalancedSampling (1)
ballgown (597)
bambu (244)
bamsignals (1062)
BANDITS (90)
bandle (46)
banocc (59)
barcodetrackR (42)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base (0)
base64 (1)
base64enc (1)
base64url (1)
basecallQC (48)
basefun (1)
BaseSpaceR (58)
Basic4Cseq (42)
BASiCS (137)
BASiCStan (35)
BasicSTARRseq (46)
basilisk (3911)
basilisk.utils (3671)
batchelor (3548)
BatchJobs (1)
BatchQC (96)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
BayesFM (1)
BayesianTools (0)
BayesKnockdown (39)
bayesm (5)
bayesmeta (1)
BayesPeak (6)
bayespeak (0)
BayesPen (0)
bayesplot (8)
bayesQR (1)
BayesSpace (199)
bayestestR (1)
BayesX (1)
bayNorm (70)
baySeq (370)
bayseq (0)
BB (1)
BBCAnalyzer (36)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
BCEE (0)
bcellViper (1)
BCRANK (51)
bcSeq (45)
BDgraph (0)
BDMMAcorrect (39)
bdsmatrix (1)
beachmat (13612)
beachmat.hdf5 (8)
beadarray (702)
beadarraySNP (47)
BeadDataPackR (696)
BeadExplorer (1)
beanplot (1)
BEARscc (37)
BEAT (36)
BEclear (53)
bedr (0)
beepr (1)
beer (45)
beeswarm (1)
bench (1)
benchdamic (54)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
BentoBox (0)
BERT (1)
Bessel (1)
bestNormalize (1)
betaHMM (1)
betareg (1)
betr (3)
BeviMed (0)
bezier (1)
BG2 (27)
bgafun (2)
BgeeCall (43)
BgeeDB (86)
BGLR (1)
BGmix (40)
bgx (40)
BH (81)
BHC (89)
BIApylon (1)
BiasedUrn (9)
BIAutils (1)
bibtex (1)
BicARE (114)
biclust (1)
bife (1)
BiFET (40)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigdist (1)
BiGGR (43)
BIGL (1)
biglasso (1)
biglm (1)
biglmm (1)
bigmelon (47)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigmemoryExtras (4)
bigparallelr (1)
bigPint (51)
bigreadr (1)
bigrquery (10)
bigsnpr (1)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (1)
bigutilsr (1)
billboarder (5)
bim (1)
BiMax (1)
BindingSiteFinder (48)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binom (1)
binr (0)
bio3d (1)
bioassayR (47)
biobank (1)
Biobase (44242)
biobase (1)
biobroom (164)
biobtreeR (52)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
bioCancer (51)
BioCartaImage (6)
BiocBaseUtils (3887)
BiocBook (11)
BiocBookDemo (1)
BiocCaseStudies (3)
BiocCheck (1397)
biocDatasets (1)
BiocDockerManager (43)
BiocFHIR (36)
BiocFileCache (23511)
BiocGenerics (50855)
BioCGenerics (0)
biocGraph (113)
BiocHail (22)
BiocHubsShiny (49)
BiocInstaller (582)
biocinstaller (1)
BiocInstallerf (0)
BiocIO (17072)
BiocManager (138)
BiocNeighbors (8887)
biocneighbors (1)
BiocOncoTK (58)
Bioconductor (1)
bioconductor (1)
bioconductor-geomxtools (0)
BioCor (62)
BiocParallel (41895)
BiocPkgTools (156)
BiocSet (222)
BiocSingular (10994)
BiocSklearn (49)
BiocStyle (5665)
biocthis (211)
BiocVersion (53884)
Biocversion (1)
biocversion (1)
biocViews (4142)
BiocWorkflowTools (162)
biodb (141)
biodbChebi (63)
biodbExpasy (36)
biodbHmdb (48)
biodbKegg (58)
biodbLipidmaps (35)
biodbMirbase (35)
biodbNcbi (39)
biodbNci (34)
biodbUniprot (40)
bioDist (220)
Biogenerics (1)
BioGenerics (1)
biom (0)
biomanager (1)
biomaRt (21766)
biomart (0)
biomartr (1)
BioMedR (1)
biomformat (4989)
BioMM (35)
BioMVCClass (38)
biomvRCNS (18)
BioNAR (43)
BioNERO (172)
BioNet (235)
BioNetStat (56)
BioPlex (3)
BioQC (104)
BioSeqClass (5)
biosigner (64)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostrings (40073)
biostrings (0)
biosvd (2)
BioTIP (50)
biotmle (50)
BioVersion (1)
biovizBase (5205)
BiRewire (107)
birta (5)
birte (2)
biscuiteer (44)
BiSeq (93)
bit (43)
bit64 (9)
bitops (5)
BitSeq (21)
bizdays (1)
blacksheepr (42)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blima (38)
BLMA (45)
blme (6)
blob (93)
blockcluster (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
BloodGen3Module (83)
bluster (4130)
BMA (1)
bmcite.SeuratData (1)
BMisc (1)
BMix (0)
bmp (1)
bnbc (65)
bnem (36)
bnlearn (1)
BOBaFIT (39)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (26)
boot (27)
bootstrap (1)
borealis (28)
Boruta (0)
botor (1)
box (5)
bpcp (1)
BPRMeth (73)
BradleyTerry2 (1)
BRAIN (86)
brainflowprobes (37)
brainImageR (1)
BrainSABER (11)
BrainStars (2)
branchpointer (57)
brave (1)
breakpointR (51)
brendaDb (40)
brew (67)
BRGenomics (136)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (1)
brickster (1)
bridge (13)
BridgeDbR (78)
bridgedist (0)
bridgesampling (1)
brio (8)
brms (2)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
broom (95)
broom.helpers (3)
broom.mixed (1)
BrowserViz (151)
BrowserVizDemo (1)
bs4Dash (6)
BSgenome (11981)
bsgenome (0)
BSGenome (1)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 (1)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3 (5)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (1)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (6)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (9)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (6)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 (0)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomeForge (39)
BSgenomes (1)
bsicons (1)
bslib (147)
bsplus (1)
bsseq (1253)
bst (0)
btergm (1)
BubbleTree (42)
BuenColors (1)
BufferedMatrix (84)
BufferedMatrixMethods (41)
bugsigdbr (166)
BUMHMM (36)
bumphunter (2435)
BumpyMatrix (363)
BUS (39)
BUScorrect (37)
BUSpaRse (182)
BUSseq (37)
butcher (1)
bvls (1)
BWStest (1)

C

C50 (1)
ca (3)
cache (1)
cachem (122)
CaDrA (10)
CAEN (31)
CAFE (40)
CAGEfightR (125)
cageminer (38)
CAGEr (98)
cAIC4 (1)
Cairo (6)
CALIB (3)
calib (0)
calibrate (0)
callr (71)
callthat (1)
calm (48)
CAM (1)
CAMERA (457)
campsis (1)
campsismod (1)
CAMTHC (2)
canceR (52)
cancerclass (58)
CancerInSilico (18)
CancerMutationAnalysis (3)
CancerSubtypes (147)
CAnD (4)
candisc (1)
canvasXpress (1)
caOmicsV (3)
caper (1)
capsidr (1)
capushe (1)
car (58)
carData (2)
cardelino (45)
Cardinal (136)
CardinalIO (48)
caret (53)
CARNIVAL (157)
carrier (1)
casebase (1)
casper (38)
castor (1)
CATALYST (412)
catboost (1)
catdata (1)
Category (1771)
category (0)
categoryCompare (39)
caTools (3)
CATT (1)
causaldata (1)
CausalR (60)
cba (1)
cbaf (39)
CBEA (63)
cBioPortalData (408)
CBNplot (76)
cbpManager (40)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (9)
ccdrAlgorithm (1)
ccfindR (79)
ccImpute (37)
ccmap (65)
CCPlotR (8)
CCPROMISE (37)
ccrepe (84)
ccube (0)
CDI (5)
cdip.datastore (1)
CDr (1)
celaref (55)
celda (519)
CellaRepertorium (50)
CellBarcode (40)
cellbaseR (54)
CellBench (113)
CellChat (1)
celldex (1)
cellGrowth (3)
cellHTS (3)
cellHTS2 (142)
CelliD (215)
cellity (46)
CellMapper (48)
cellmigRation (47)
CellMixS (66)
CellNOptR (112)
cellnoptr (0)
cellranger (1)
cellscape (44)
CellScore (36)
CellTrails (42)
cellTree (14)
cellxgenedp (128)
cem (1)
CEMiTool (112)
censcyt (41)
censReg (1)
Cepo (119)
ceRNAnetsim (47)
CeTF (60)
CexoR (37)
CFAssay (52)
cfdnakit (9)
cfDNAPro (40)
cfTools (24)
cgam (1)
cgdsr (1)
CGEN (59)
CGHbase (372)
CGHcall (341)
cghFLasso (0)
cghMCR (47)
CGHnormaliter (38)
CGHregions (55)
ChAMP (549)
ChAMPdata (0)
changepoint (1)
CHARGE (2)
charm (4)
checkmate (46)
checkr (1)
ChemmineOB (316)
ChemmineR (891)
chemometrics (1)
CHETAH (83)
ChIC (27)
Chicago (90)
chihaya (33)
chimera (4)
chimeraviz (78)
ChIPanalyser (38)
ChIPComp (47)
chipenrich (116)
ChIPexoQual (36)
ChIPpeakAnno (825)
chippeakanno (0)
ChIPQC (317)
ChIPseeker (1697)
chipseeker (0)
chipseq (521)
ChIPseqR (65)
ChIPSeqSpike (5)
ChIPsim (66)
ChIPXpress (73)
chk (3)
chopsticks (84)
CHORD (0)
chroGPS (3)
chromDraw (38)
ChromHeatMap (81)
chromote (3)
ChromoViz (1)
chromPlot (93)
ChromSCape (49)
chromstaR (71)
chromswitch (31)
chromVAR (1036)
chron (2)
CHRONOS (41)
cibersort (1)
cicero (207)
CIMICE (37)
CINdex (56)
cindex (0)
circlesize (1)
circlize (6)
circRNAprofiler (50)
CircSeqAlignTk (29)
circular (0)
cisPath (52)
CiteFuse (83)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (67)
ClassDiscovery (1)
ClassifyR (179)
classInt (20)
cleanrmd (1)
cleanUpdTSeq (74)
cleaver (163)
clevRvis (30)
cli (139)
CLIFF (1)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (39)
clipper (76)
clipr (40)
cliProfiler (40)
cliqueMS (92)
clisymbols (1)
clock (24)
Clomial (49)
Clonality (33)
clonotypeR (6)
clst (74)
clstutils (44)
clubSandwich (1)
clue (24)
CluMSID (48)
clustComp (55)
cluster (64)
clusterCrit (1)
clusterExperiment (345)
ClusterFoldSimilarity (1)
clusterGeneration (3)
ClusterJudge (51)
clustermq (3)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (16043)
clusterprofiler (1)
ClusterProfiler (1)
ClusterR (1)
clusterRepro (0)
clusterSeq (22)
ClusterSignificance (51)
clusterSim (1)
clusterStab (65)
clusthaplo (0)
clustifyr (120)
ClustIRR (6)
clustMixType (1)
clustree (1)
clv (1)
clValid (1)
CMA (100)
cmapR (348)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (44)
cn.mops (210)
CNAnorm (44)
CNAqc (0)
CNEr (2381)
CNORdt (38)
CNORfeeder (40)
CNORfuzzy (37)
cNORM (0)
CNORode (62)
CNPBayes (2)
CNTools (107)
cntools (0)
CNVfilteR (40)
CNVgears (43)
cnvGSA (47)
CNViz (36)
CNVMetrics (35)
CNVPanelizer (47)
CNVRanger (97)
CNVrd2 (36)
CNVtools (2)
cobalt (2)
cobindR (2)
cobs (1)
CoCiteStats (34)
COCOA (40)
coda (2)
coda.base (1)
codelink (51)
codetools (25)
CODEX (82)
coexnet (14)
CoGAPS (182)
cogena (74)
cogeqc (51)
Cogito (36)
coGPS (48)
COHCAP (59)
coin (1)
cola (119)
collapse (1)
collections (1)
CollessLike (0)
coloc (11)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (7)
colorspace (40)
colortools (1)
colourpicker (5)
colourvalues (1)
comapr (39)
combi (41)
combinat (1)
coMET (70)
coMethDMR (39)
ComICS (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (99)
compareDF (1)
compareGroups (1)
compartmap (36)
COMPASS (56)
compcodeR (66)
compEpiTools (47)
CompGO (3)
compiler (0)
ComplexHeatmap (12394)
complexheatmap (1)
compositions (2)
CompoundDb (354)
CompQuadForm (1)
ComPrAn (46)
compSPOT (6)
compute.es (1)
concaveman (1)
conclus (12)
concordexR (44)
condcomp (1)
condiments (56)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
CONFESS (37)
config (10)
confintr (1)
conflicted (10)
connectwidgets (1)
conquer (2)
consensus (50)
ConsensusClusterPlus (2754)
consensusDE (41)
consensusOV (72)
consensusSeekeR (84)
consICA (66)
consort (1)
ConsRank (1)
CONSTANd (49)
contfrac (1)
contiBAIT (36)
conumee (129)
convert (123)
coop (1)
copa (41)
COPDSexualDimorphism (1)
copula (1)
copykat (1)
copynumber (215)
CopyNumber450k (1)
CopyNumberPlots (114)
CopywriteR (24)
coRdon (153)
CoRegFlux (2)
CoRegNet (57)
CoreGx (220)
Cormotif (35)
CorMut (3)
coRNAi (3)
corncob (1)
coro (1)
corpcor (1)
corpora (1)
corral (64)
correlation (1)
CORREP (52)
corrplot (2)
corrr (1)
coseq (95)
COSG (1)
CoSIA (31)
cosmiq (38)
cosmo (2)
cosmoGUI (2)
cosmosR (58)
COSNet (54)
COTAN (55)
CountClust (5)
countrycode (8)
countsimQC (105)
covEB (35)
coveffectsplot (1)
CoverageView (51)
covr (63)
covRNA (37)
CovSel (0)
cowplot (5)
coxme (1)
coxphf (1)
cplm (1)
cpm (1)
cpp11 (114)
cpvSNP (38)
cqn (242)
cranlogs (1)
crayon (83)
crch (1)
createKEGGdb (1)
creatr (1)
credentials (21)
crew (1)
crew.cluster (1)
CRImage (50)
CRISPR.shinyapp (1)
CRISPRball (1)
crisprBase (114)
crisprBowtie (108)
crisprBwa (47)
crisprDesign (94)
crisprScore (117)
CRISPRseek (117)
crisprseekplus (28)
CrispRVariants (98)
crisprVerse (52)
crisprViz (88)
crlmm (164)
crop (1)
crossdes (1)
CrossICC (1)
crossmatch (1)
crossmeta (82)
crosstable (1)
crosstalk (76)
crrri (0)
crrry (0)
crul (6)
CSAR (64)
csaw (435)
csawBook (5)
csdR (38)
csSAM (0)
CSSP (47)
CSSQ (36)
csv (1)
ctc (266)
CTdata (28)
CTDquerier (39)
CTexploreR (1)
ctgGEM (2)
ctmle (0)
cTRAP (43)
ctree (0)
ctsGE (40)
CTSV (36)
cubature (1)
cubelyr (0)
Cubist (1)
cummeRbund (218)
cummerbund (1)
CuratedAtlasQueryR (12)
curatedMetagenomicData (0)
curl (198)
customCMPdb (38)
customProDB (55)
cvar (1)
cvAUC (1)
CVE (2)
cvms (1)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (0)
cyanoFilter (31)
cycle (36)
cyclocomp (9)
cydar (63)
CytoDx (40)
cytofast (3)
cytofit (1)
cytofkit (19)
CyTOFpower (36)
cytofQC (23)
CytoGLMM (75)
cytoKernel (32)
cytolib (2391)
cytomapper (245)
cytoMEM (62)
CytoML (489)
CytoPipeline (59)
CytoPipelineGUI (7)
CytoTRACE (1)
CytoTree (19)
cytoviewer (48)

D

D0.db (1)
D2C (1)
d3Network (0)
d3r (1)
dada2 (2126)
dae (1)
dagitty (1)
dagLogo (48)
DAISIE (1)
daMA (51)
DAMEfinder (38)
DaMiRseq (83)
DAPAR (108)
DART (56)
DASC (1)
DASiR (2)
dasnormalize.iomel (1)
dasper (29)
dastools (1)
data.table (86)
data.tree (5)
DatabaseConnector (1)
DataEditR (1)
datamods (5)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datapipeline (1)
datasets (0)
datawizard (3)
DAVIDQuery (3)
dbaccess (1)
dbarts (1)
DBChIP (5)
DBI (35)
DBItest (1)
dbplyr (91)
dbscan (3)
dbx (3)
dcanr (109)
DCATS (12)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
dce (44)
dcGSA (38)
DChIPRep (2)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (75)
ddgraph (2)
ddPCRclust (43)
deal (0)
dearseq (150)
debCAM (50)
debrowser (135)
debugme (1)
DECIPHER (2479)
deco (12)
DEComplexDisease (13)
decompTumor2Sig (91)
DeconRNASeq (196)
decontam (1466)
decontX (20)
deconvR (45)
decor (1)
decoupleR (839)
DEDS (2)
Deducer (1)
DeepBlueR (45)
DeepPINCS (65)
deepregression (1)
deepSNV (117)
DEFormats (232)
DegNorm (46)
DEGraph (41)
degraph (0)
DEGreport (497)
DEGseq (153)
degseq (0)
Delaporte (1)
DelayedArray (41505)
DelayedDataFrame (44)
DelayedMatrixStats (14900)
DelayedRandomArray (73)
DelayedTensor (35)
deldir (25)
DELocal (27)
deltaCaptureC (38)
deltaGseg (47)
DeMAND (51)
DeMixT (72)
demuxmix (170)
demuxSNP (13)
dendextend (52)
DendSer (1)
dendsort (0)
densEstBayes (4)
densityClust (0)
densvis (2865)
DEoptim (1)
DEoptimR (14)
DEP (451)
DepecheR (183)
DepInfeR (37)
DEqMS (197)
derfinder (495)
derfinderHelper (493)
derfinderPlot (114)
Deriv (1)
desc (81)
DEScan2 (39)
descr (1)
descsuppR (1)
DescTools (9)
DESeq (273)
deseq (0)
DESeq2 (19763)
deseq2 (1)
designmatch (1)
DEsingle (256)
deSolve (48)
DESpace (27)
destiny (688)
DEsubs (43)
devEMF (1)
devtools (60)
DEWSeq (45)
DEXICA (0)
DExMA (51)
DEXSeq (1361)
dexus (4)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (35)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (3)
DiagrammeRsvg (1)
DIAlignR (44)
dials (8)
DiceDesign (1)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (2)
did (1)
DiffBind (1004)
diffcoexp (120)
diffcyt (265)
diffdf (1)
DifferentialRegulation (40)
diffGeneAnalysis (45)
diffHic (91)
DiffLogo (62)
diffloop (33)
diffobj (2)
diffuStats (57)
diffUTR (34)
diffviewer (1)
digest (175)
diggit (39)
dimRed (1)
Dino (39)
diptest (1)
dir.expiry (3547)
directlabels (1)
Director (44)
DirichletMultinomial (3562)
discordant (67)
DiscoRhythm (51)
DiscriMiner (0)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distillery (0)
distinct (157)
distr (0)
distr6 (1)
distrEx (0)
distributional (9)
DistributionUtils (1)
distro (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1067)
divergence (33)
diveRsity (0)
djvdj (1)
dks (45)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DMCFB (31)
DMCHMM (37)
DMRcaller (64)
DMRcate (802)
DMRcatedata (0)
DMRforPairs (31)
DMRScan (35)
dmrseq (155)
DMwR (0)
DNABarcodeCompatibility (36)
DNABarcodes (167)
DNAcopy (4938)
dnacopy (1)
DNAfusion (36)
DNaseR (1)
DNAshapeR (61)
dndscv (0)
do (1)
DO.db (7)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (5)
DoE.base (1)
DoEstRare (1)
doFuture (1)
domainsignatures (2)
doMC (1)
DominoEffect (36)
doMPI (1)
doParallel (30)
doppelgangR (73)
DOQTL (3)
doRedis (1)
doRNG (2)
dorothea (1)
Doscheda (37)
DOSE (15562)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doseR (36)
doSNOW (1)
dotCall64 (4)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
doubletrouble (34)
downlit (24)
downloader (1)
downloadthis (1)
dparser (1)
DPClust (0)
dpclust3p (0)
dpeak (30)
dplyr (211)
dplyrb (1)
dqrng (17)
dr (0)
drake (6)
drat (1)
drawProteins (171)
drc (1)
DRDID (1)
dream (1)
dreamerr (1)
dreamlet (10)
drgee (1)
DRIMSeq (324)
DriverNet (53)
DropletUtils (2569)
drosophila2probe (1)
DRR (1)
drugTargetInteractions (47)
DrugVsDisease (45)
dSimer (2)
DSS (982)
dStruct (34)
DT (150)
DTA (79)
dtangle (0)
dtplyr (50)
DTRreg (0)
dttr2 (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (3)
duckdb (2)
duct.tape (1)
dummies (0)
Dune (36)
DupChecker (2)
dupRadar (87)
dyebias (37)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1172)
dynfeature (1)
dynlm (1)
dynplot (1)
dynpred (1)
dynwrap (1)

E

e1071 (16)
earth (2)
easier (106)
EasyABC (0)
EasyCellType (46)
easyENTIM (1)
easylift (8)
easypar (0)
EasyqpcR (4)
easyreporting (48)
easyRNASeq (108)
easystats (1)
ebal (1)
EBarrays (157)
EBcoexpress (54)
EBImage (2486)
ebimage (0)
EBSEA (38)
EBSeq (380)
EBSeqHMM (53)
Ecdat (1)
Ecfun (1)
echarts4r (8)
ecodist (1)
ecolitk (38)
ECOSolveR (1)
EDASeq (1640)
edd (2)
EDDA (2)
edge (82)
edgeR (20233)
edger (1)
EDIRquery (23)
eds (265)
eegc (57)
effects (1)
effectsize (2)
EGAD (49)
egg (5)
EGSEA (126)
eha (1)
eiR (41)
eisa (4)
eisaR (84)
elasticsearchr (1)
ELBOW (2)
ellipse (51)
ellipsis (11)
elliptic (1)
ELMER (162)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (4)
emdist (1)
EMDomics (54)
emmeans (76)
EMMREML (1)
EmpiricalBrownsMethod (110)
emulator (1)
enc (0)
encode (1)
ENCODExplorer (3)
encryptr (1)
energy (1)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (1)
english (1)
EnhancedVolcano (3888)
enhancedvolcano (1)
enhancerHomologSearch (37)
EnMCB (35)
ENmix (176)
EnrichedHeatmap (521)
EnrichmentBrowser (470)
enrichplot (16467)
enrichR (1)
enrichTF (60)
enrichViewNet (6)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (5)
EnsDb.Hsapiens.v79 (4)
EnsDb.Hsapiens.v86 (6)
EnsDb.Mmusculus.v79 (1)
ensembldb (9116)
ensemblVEP (126)
entropy (1)
ENVISIONQuery (2)
EnvStats (1)
Epi (1)
epialleleR (42)
EpiCluster (0)
EpiCompare (41)
epidecodeR (33)
EpiDISH (445)
epigenomix (37)
epigraHMM (41)
epihet (12)
EpiMix (32)
epimutacions (41)
epiNEM (83)
EpiNow2 (1)
epiR (2)
epistack (39)
epistasisGA (33)
EpiStats (1)
epitools (1)
EpiTxDb (55)
epivizr (75)
epivizrChart (40)
epivizrData (87)
epivizrServer (116)
epivizrStandalone (49)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
erccdashboard (49)
ergm (0)
ergm.count (0)
erify (1)
erma (62)
ERSSA (38)
esATAC (76)
escape (252)
escheR (54)
esetVis (55)
esquisse (1)
estimability (8)
estimatr (1)
estmeansd (1)
etm (1)
eudysbiome (33)
europepmc (1)
evaluate (205)
EValue (1)
evaluomeR (41)
evd (1)
EventPointer (45)
eventTrack (1)
EWCE (127)
ewfutils (1)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (2)
ExCluster (34)
ExiMiR (39)
exomeCopy (232)
ExomeDepth (1)
exomePeak (8)
exomePeak2 (93)
exonfindR (0)
exonmap (2)
ExperimentHub (6566)
ExperimentHubData (234)
ExperimentSubset (37)
expint (1)
explorase (5)
explore (1)
ExploreModelMatrix (129)
ExplorOMICS (1)
expm (10)
ExpressionAtlas (127)
ExpressionView (3)
exprExternal (1)
expsmooth (0)
expss (5)
externalVector (2)
extraChIPs (40)
extraDistr (5)
extrafont (1)
extrafontdb (1)
extraInserts (1)
extraoperators (1)
extraTrees (0)
extRemes (0)

F

faahKO (0)
fabia (157)
fabletools (1)
facets (0)
facopy (1)
factDesign (39)
factoextra (2)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (48)
Factoshiny (1)
factR (39)
fail (0)
fakepackage (1)
FamAgg (55)
famat (38)
fansi (143)
faraway (1)
farms (50)
farver (13)
fastcluster (1)
fastDummies (17)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (2)
fastLiquidAssociation (39)
fastmap (54)
fastmatch (13)
FastqCleaner (74)
fastreeR (66)
fastseg (687)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
fauxpas (1)
fBasics (2)
fbat (2)
FCBF (58)
fCCAC (33)
fCI (48)
fcoex (65)
fcScan (36)
FD (1)
fda (7)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (5)
fdrame (50)
fdrtool (1)
fds (5)
FEAST (89)
feather (1)
FeatSeekR (29)
feature (4)
FedData (1)
fedup (37)
feisr (1)
FELLA (121)
FEM (20)
fenr (7)
fExtremes (0)
ff (54)
ffbase (0)
FField (0)
ffpe (48)
fftw (0)
fftwtools (1)
fGarch (1)
fgga (33)
FGNet (101)
fgsea (15236)
fields (3)
filehash (1)
filelock (10)
filesstrings (1)
FilterFFPE (34)
finalfit (1)
FindIT2 (44)
FindMyFriends (4)
findpython (6)
finetune (1)
fingerprint (1)
FISHalyseR (36)
fishHook (0)
fishMod (0)
fishpond (308)
fit.models (1)
fitdistrplus (10)
FitHiC (61)
fixest (1)
flagme (40)
flair (1)
FLAMES (51)
flashClust (1)
flexclust (1)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (14)
flipflop (2)
float (1)
flock (1)
flowAI (504)
flowBeads (36)
flowBin (36)
flowcatchR (39)
flowCHIC (36)
flowCL (13)
flowClean (204)
flowClust (774)
flowclust (1)
flowCore (2312)
flowcore (1)
FlowCore (1)
flowCut (75)
flowCyBar (49)
flowDensity (199)
flower (1)
flowFit (4)
flowFlowJo (3)
flowFP (98)
flowGate (36)
flowGraph (50)
flowMap (47)
flowMatch (40)
flowMeans (114)
flowMerge (90)
flowPeaks (153)
flowPhyto (2)
flowPloidy (42)
flowPlots (38)
flowQ (2)
flowQB (2)
FlowRepositoryR (4)
FlowSOM (971)
FlowSorted.Blood.EPIC (9)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (9)
flowSpecs (46)
flowSpy (2)
flowStats (520)
flowTime (42)
flowTrans (52)
flowType (4)
flowUtils (35)
flowViz (948)
flowVS (82)
flowWorkspace (1140)
flowworkspace (0)
flowWorkspaceData (0)
flux (1)
fma (0)
fmcsR (236)
FME (1)
fmrs (118)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (9)
fobitools (36)
focalCall (2)
foghorn (0)
FoldGO (33)
fontawesome (97)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (16)
foreach (6)
forecast (3)
foreign (30)
forestplot (1)
forestploter (1)
fork (1)
formatR (22)
formattable (1)
formatters (1)
Formula (7)
formula.tools (1)
forrester.metadata (0)
fortunes (1)
fossil (0)
FourCSeq (4)
fpc (1)
fpp (0)
fracdiff (1)
FragPipeAnalystR (1)
FRASER (92)
frenchFISH (44)
fresh (5)
FrF2 (1)
FRGEpistasis (49)
frma (120)
frmaTools (52)
fs (185)
FScanR (38)
fst (1)
fstcore (1)
fTrading (1)
FunChIP (47)
FunciSNP (3)
fungible (1)
funtooNorm (34)
furrr (9)
FuseSOM (43)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (76)
future.apply (33)
future.batchtools (1)
future.callr (3)
fuzzyjoin (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (1)
GA4GHclient (70)
ga4ghclient (0)
GA4GHshiny (34)
gada (0)
gaga (75)
gage (829)
gaggle (34)
gaia (22)
gam (2)
gamboostLSS (1)
gamlss (1)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (2)
gamlss.tr (0)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapfill (0)
GAPGOM (3)
gapminder (1)
GAprediction (49)
garfield (53)
gargle (74)
GARS (35)
gaston (0)
GateFinder (35)
gatom (6)
gaucho (2)
gbm (1)
gbRd (1)
GBScleanR (35)
gbutils (1)
gcapc (44)
gcatest (39)
gclus (1)
gCMAP (4)
gCMAPWeb (3)
gCrisprTools (42)
gcrma (1334)
GCS (1)
GCSConnection (2)
GCSFilesystem (3)
GCSscore (31)
gdata (10)
GDCRNATools (244)
gdistance (0)
gDNAx (8)
gDR (9)
gDRcore (38)
gDRimport (38)
gDRstyle (12)
gDRutils (40)
GDSArray (100)
gdsfmt (2044)
gdtools (15)
gee (1)
geecc (2)
geepack (1)
geigen (1)
geiger (0)
GEM (52)
gemini (53)
gemma.R (47)
gemtc (1)
GenABEL (2)
GenABEL.data (2)
genArise (47)
genbankr (169)
GENE.E (3)
gene2pathway (2)
GeneAccord (12)
GeneAnswers (17)
geneAttribution (37)
GeneBreak (46)
geneClassifiers (37)
GeneExpressionSignature (45)
genefilter (13426)
genefu (367)
GeneGA (38)
GeneGeneInteR (40)
GeneGroupAnalysis (2)
geneLenDataBase (9)
GeneMeta (65)
GeneNet (0)
GeneNetworkBuilder (50)
GeneOverlap (331)
geneplast (78)
geneplotter (10914)
GeneR (2)
GeneralizedHyperbolic (1)
geneRecommender (37)
GeneRegionScan (41)
GeneRfold (1)
generics (15)
geneRxCluster (37)
GeneSelectMMD (79)
GeneSelector (3)
GENESIS (314)
genesis (1)
GeneSpring (2)
GeneStructureTools (56)
geNetClassifier (106)
GeneticsBase (2)
geneticsbase (0)
GeneticsDesign (3)
GeneticsPed (99)
GeneTonic (154)
GeneTraffic (2)
GeneTS (2)
geneXtendeR (67)
GENIE3 (1082)
genoCN (49)
GenoGAM (3)
genomation (566)
GenomAutomorphism (34)
GenomeBase (1)
GenomeGraphs (7)
GenomeInfoDb (50669)
GenomeInfoDB (0)
GenomeInfoDbData (19)
genomeIntervals (132)
GenomelnfoDb (0)
genomes (60)
GenomicAlignments (21389)
GenomicDataCommons (1178)
GenomicDistributions (73)
GenomicDistributionsData (1)
GenomicFeatures (17563)
genomicfeatures (0)
GenomicFiles (1073)
genomicInstability (37)
GenomicInteractionNodes (35)
GenomicInteractions (291)
GenomicOZone (36)
GenomicPlot (6)
GenomicRanges (37916)
genomicranges (0)
GenomicScores (494)
GenomicSuperSignature (42)
GenomicTools (1)
GenomicTuples (36)
Genominator (3)
genoset (10)
genotypeeval (17)
GenoView (1)
genphen (3)
GenProSeq (31)
GenRank (2)
GenSA (1)
GenVisR (338)
geodata (1)
GeoDiff (67)
geodiv (1)
GEOexplorer (52)
GEOfastq (61)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (4)
GEOmetadb (210)
geometadb (0)
geometries (5)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (308)
GEOquery (8443)
geoquery (1)
GEoquery (1)
geoR (1)
geos (1)
GEOsearch (2)
geosphere (8)
GEOsubmission (37)
GeoTcgaData (44)
gep2pep (41)
gert (35)
gespeR (51)
gestalt (4)
gestate (1)
getDEE2 (46)
getip (1)
getopt (16)
GetoptLong (2)
getPass (1)
getSVCNVperGene0.94 (0)
gettz (1)
geva (46)
GEWIST (43)
gff3Plotter (1)
gfonts (1)
gg4way (7)
ggalluvial (1)
GGally (4)
ggalt (1)
gganimate (1)
GGBase (6)
ggbeeswarm (3)
ggbio (2016)
ggbreak (1)
ggcorrplot (1)
ggcyto (855)
ggdag (1)
ggdendro (7)
ggdist (2)
gge (1)
ggeasy (1)
ggeffects (2)
ggExtra (2)
ggfittext (1)
ggforce (4)
ggforestplot (0)
ggformula (12)
ggfortify (2)
ggfun (20)
gggenes (1)
ggh4x (1)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (1)
ggkegg (40)
ggm (1)
ggmanh (83)
ggmap (43)
ggmosaic (1)
ggmsa (453)
ggnetwork (1)
ggnewscale (14)
ggnewscales (1)
ggokabeito (1)
GGPA (36)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (147)
ggplot2movies (1)
ggplotify (16)
ggpmisc (3)
ggPMX (1)
ggpointdensity (5)
ggpp (4)
ggprism (1)
ggpubr (13)
ggRandomForests (0)
ggraph (3)
ggrastr (6)
ggrepel (57)
ggridges (11)
ggsankey (0)
ggsc (13)
ggsci (54)
ggseqlogo (5)
ggside (1)
ggsignif (5)
ggspavis (85)
ggstance (1)
ggstats (1)
ggstatsplot (1)
ggsurvfir (1)
ggsurvfit (1)
ggtext (2)
ggthemes (6)
GGtools (5)
ggtree (17948)
ggtreeDendro (49)
ggtreeExtra (923)
ggvegan (0)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (1)
ggvis (0)
gh (59)
ghql (1)
gifski (1)
GIGSEA (51)
GillespieSSA (0)
Giotto (1)
girafe (70)
GISPA (40)
git2r (48)
gitcreds (13)
gitlabr (1)
GLAD (215)
GladiaTOX (37)
glasso (0)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
Glimma (1198)
gllvm (0)
glmGamPoi (2778)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (0)
glmmML (1)
glmmTMB (1)
glmnet (14)
glmnetUtils (3)
glmSparseNet (102)
glmx (1)
GlobalAncova (881)
GlobalOptions (1)
globals (12)
globals, (1)
globalSeq (49)
globaltest (1646)
GloScope (6)
glpgStyle (1)
glpgTesteR (1)
glpkAPI (1)
glue (17)
gmailr (1)
gmapR (114)
gMCP (1)
GmicR (48)
Gmisc (1)
gmm (1)
gmnl (1)
gmodels (1)
gmoviz (39)
gmp (10)
GMRP (36)
GNET2 (41)
gnm (1)
gnomAD (1)
GNOSIS (7)
GO.db (15)
goCluster (1)
GOexpress (78)
goftest (1)
GOfuncR (249)
GOFunction (3)
golem (3)
golubEsets (1)
gomms (0)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (64)
GoogleGenomics (2)
googlesheets4 (70)
googleVis (1)
GOplot (0)
GOpro (76)
goProfiles (94)
GOSemSim (14753)
goseq (1178)
goshawk (1)
GOSim (115)
goSorensen (32)
goSTAG (43)
GOstats (1635)
gostats (1)
GOsummaries (54)
GOTHiC (60)
goTools (48)
gower (9)
GPA (52)
GPArotation (44)
gpart (11)
GPfit (1)
gplots (4)
gpls (130)
gprege (4)
gprofiler2 (1)
gpuMagic (40)
gQTLBase (4)
gQTLstats (4)
gRain (1)
gramm4R (2)
GRaNIE (70)
granny (1)
granulator (127)
graper (51)
grapg (1)
graph (17404)
GraphAlignment (53)
GraphAT (37)
graphat (0)
graphics (0)
graphite (2695)
graphlayouts (15)
GraphPAC (55)
graphql (1)
gRbase (1)
grDevices (0)
Greg (1)
GRENITS (50)
greybox (1)
GreyListChIP (884)
grf (1)
grid (0)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (2)
grImport (1)
GRmetrics (70)
groHMM (53)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
GRridge (21)
GSA (0)
gsalib (0)
GSALightning (54)
GSAR (92)
gsbDesign (1)
GSCA (42)
gscounts (1)
gscreend (37)
gsDesign (1)
GSEABase (7985)
gseabase (0)
GSEABenchmarkeR (60)
GSEAlm (57)
GSEAmining (63)
gsean (42)
GSgalgoR (49)
gsignal (1)
gsl (2)
gsmoothr (5)
gson (3)
gsrc (0)
GSReg (40)
GSRI (38)
gss (2)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (5050)
GSVAdata (1)
gsw (0)
gt (4)
gtable (117)
gto (1)
gtools (21)
gtrellis (104)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (1)
GUIDEseq (49)
Guitar (118)
GUniFrac (2)
gupio (1)
gUtils (0)
GUTS (0)
Gviz (3675)
GWAS.BAYES (49)
gwascat (520)
GWASExactHW (5)
gwasrapidd (1)
GWASTools (620)
gwasurvivr (70)
GWENA (135)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)

H

h2o (1)
h5vc (54)
HAC (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
hapFabia (37)
HaploSim (1)
hardhat (51)
HardyWeinberg (1)
Harman (162)
HarmonizR (8)
harmony (3)
Harshlight (38)
hash (1)
haven (55)
hca (54)
HCABrowser (2)
HCAExplorer (1)
HCAMatrixBrowser (2)
HCsnip (2)
HDCytoData (1)
HDF5Array (10738)
hdf5r (1)
hdi (1)
HDInterval (8)
hdm (0)
HDO.db (4)
hdrcde (5)
HDTD (49)
heatmap.plus (0)
heatmap3 (0)
heatmaply (10)
heatmaps (232)
Heatplus (355)
heemod (1)
HelloRanges (99)
HELP (39)
helperMut (0)
HEM (36)
heplots (1)
here (1)
hermes (83)
HERON (7)
Herper (156)
hexbin (12)
hexSticker (1)
hexView (1)
HGC (59)
hgu133a.db (1)
hgu133plus2.db (7)
hgu133plus2cdf (0)
hgu219.db (1)
hgu95a.db (1)
hgu95av2.db (1)
hgug4112a.db (0)
hiAnnotator (85)
HIBAG (127)
HiCBricks (92)
hicbricks (0)
HiCcompare (228)
HiCDCPlus (61)
HiCDOC (76)
HiCExperiment (87)
HiClimR (1)
HiContacts (81)
HiCool (37)
hicrep (8)
hicVennDiagram (8)
hierfstat (0)
hierGWAS (53)
hierinf (47)
highcharter (1)
highlight (1)
highr (71)
highs (1)
HilbertCurve (73)
HilbertVis (165)
HilbertVisGUI (23)
HiLDA (49)
hipathia (85)
HIPPO (37)
hiReadsProcessor (42)
HIREewas (48)
HiTC (120)
hmdbQuery (64)
Hmisc (17)
HMMcopy (281)
hms (110)
Homo.sapiens (5)
hoodscanR (8)
Hoover (1)
hopach (233)
HPAanalyze (121)
hpar (247)
HPAStainR (34)
HPiP (49)
hrbrthemes (1)
HSAUR2 (1)
HSAUR3 (1)
hsm (1)
HSMMSingleCell (1)
htmlTable (12)
htmltools (239)
htmlwidgets (193)
HTqPCR (140)
HTSanalyzeR (4)
HTSeqGenie (33)
htSeqTools (5)
HTSFilter (200)
htslib (1)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (1)
httput (1)
httpuv (128)
httr (185)
httr2 (56)
HubPub (96)
huge (1)
HumanTranscriptomeCompendium (43)
hummingbird (36)
hunspell (2)
huxtable (1)
hwriter (2)
HWxtest (0)
HybridMTest (99)
hypeR (76)
hyperdraw (80)
hypergeo (1)
hypergraph (97)
hyperSpec (1)

I

IAPWS95 (1)
iASeq (45)
iasva (36)
iBBiG (118)
ibh (54)
iBMQ (30)
ica (2)
iCARE (78)
icenReg (1)
Icens (373)
icetea (34)
iCheck (34)
iChip (35)
ichorCNA (0)
iClusterPlus (307)
iCNV (37)
iCOBRA (148)
ICS (1)
ICSNP (1)
ICSOutlier (1)
ideal (98)
IdeoViz (54)
idiogram (38)
IdMappingAnalysis (2)
IdMappingRetrieval (2)
IDPmisc (1)
idpr (54)
idr (0)
idr2d (38)
ids (1)
ieugwasr (0)
IFAA (37)
iFlow (2)
iGasso (1)
iGC (47)
IgGeneUsage (38)
igraph (54)
igraphdata (1)
igvR (95)
igvShiny (1)
iheatmapr (3)
IHW (640)
ijtiff (1)
Illumina450ProbeVariants.db (0)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (7)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (5)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (5)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19 (5)
IlluminaHumanMethylationEPICmanifest (5)
illuminaio (2697)
ILoReg (34)
imageHTS (19)
imager (1)
imagerExtra (0)
IMAS (39)
imbalance (1)
imcRtools (151)
Imetagene (1)
iml (0)
IMMAN (41)
ImmuneSpaceR (45)
immunoClust (41)
immunotation (48)
IMPCdata (46)
import (1)
ImpulseDE (2)
ImpulseDE2 (7)
impute (10026)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
IncidencePrevalence (1)
INDEED (48)
ineq (0)
iNETgrate (16)
infer (9)
infercnv (1056)
inferCNV (1)
infinityFlow (45)
influenceR (3)
Informeasure (43)
infotheo (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (21)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
InPAS (38)
INPower (49)
insight (4)
inSilicoDb (6)
inSilicoMerging (6)
INSPEcT (49)
INTACT (28)
InTAD (37)
intamap (1)
intansv (45)
interacCircos (64)
InteractionSet (1568)
InteractiveComplexHeatmap (325)
interactiveDisplay (75)
interactiveDisplayBase (9546)
InterCellar (65)
IntEREst (42)
intergraph (1)
InterMineR (50)
interp (5)
interpretR (0)
interval (1)
intervals (3)
IntOMICS (28)
IntramiRExploreR (37)
inum (2)
inveRsion (4)
invgamma (1)
IONiseR (51)
iontree (3)
iPAC (71)
ipaddress (1)
iPath (36)
ipcwswitch (1)
ipdDb (64)
IPDfromKM (1)
ipmisc (0)
IPO (119)
IPPD (4)
ipred (51)
iq (1)
irace (0)
IRanges (46751)
iranges (1)
IRdisplay (1)
IRISFGM (56)
IrisSpatialFeatures (1)
IRkernel (1)
irlba (12)
irr (1)
ISAnalytics (41)
iSEE (366)
iSEEde (10)
iSEEhex (102)
iSEEhub (59)
iSEEindex (10)
iSEEpathways (7)
iSEEu (79)
iSeq (47)
ISLET (38)
ISLR (1)
iSNetwork (2)
Iso (1)
isoband (39)
isobar (63)
IsoBayes (7)
ISOcodes (1)
IsoCorrectoR (90)
IsoCorrectoRGUI (43)
IsoformSwitchAnalyzeR (242)
IsoGeneGUI (3)
ISoLDE (48)
isomiRs (76)
iSPlot (1)
isva (5)
ISwR (1)
ITALICS (41)
iterativeBMA (39)
iterativeBMAsurv (47)
iterativebmasurv (0)
iterators (6)
iterClust (41)
iteremoval (3)
itertools (1)
itsadug (1)
IVAS (60)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
ivygapSE (35)
IWTomics (36)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (1)
janitor (3)
JASPAR2016 (1)
JASPAR2018 (1)
JASPAR2020 (5)
JavaGD (1)
JBTools (0)
jcolors (1)
JGR (1)
jiebaR (0)
jiebaRD (0)
JM (1)
JMbayes (1)
jmosaics (2)
jnjtemplates (1)
joda (3)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (7)
jqr (5)
jquerylib (1)
js (1)
jsonify (1)
jsonlite (192)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)
JunctionSeq (9)

K

kableExtra (1)
kangar00 (1)
karyoploteR (862)
KaryoploteR (0)
katdetectr (43)
katex (1)
KBoost (48)
KCsmart (37)
kebabs (123)
kedd (0)
KEGG.db (2)
KEGGgraph (5297)
kegggraph (0)
KEGGlincs (45)
keggorth (1)
keggorthology (94)
KEGGprofile (12)
KEGGREST (33305)
keggrest (1)
KEGGSOAP (3)
keggsvg (1)
Kendall (1)
keras (5)
KernelKnn (1)
kernlab (2)
KernSmooth (28)
keyring (1)
KFAS (1)
khroma (1)
kimod (2)
KinSwingR (40)
kissDE (31)
kit (1)
kknn (1)
klaR (1)
km.ci (2)
kmed (1)
kmknn (0)
kml (1)
kml3d (1)
KMsurv (1)
knitr (190)
knitrdata (1)
knockoff (1)
KnowSeq (41)
KODAMA (0)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (3)
kSamples (1)
ktplots (1)

L

labdsv (1)
labeling (66)
labelled (2)
LACE (67)
laeken (1)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (1)
lamW (2)
landscapemetrics (1)
languageserver (1)
LaplacesDemon (1)
lapmix (34)
lars (1)
lasso2 (1)
lastdose (1)
later (151)
latex2exp (1)
lattice (77)
latticeExtra (7)
lava (19)
lavaan (51)
lavaSearch2 (1)
lazy (0)
lazyeval (34)
LBE (268)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
lda (0)
ldap (1)
ldblock (53)
LDheatmap (1)
LDlinkR (1)
LDplots (1)
LEA (496)
leafcutter (0)
leafem (1)
leaflet (3)
leaflet.minicharts (1)
leaflet.providers (2)
leafpop (1)
leaps (1)
LearnBayes (1)
learnr (3)
LedPred (46)
lefser (493)
leiden (12)
leidenAlg (1)
leidenbase (8)
lemon (1)
lemur (7)
les (81)
levi (46)
lfa (325)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (8)
liana (1)
libcoin (2)
libgeos (1)
LiblineaR (8)
libr (1)
lifecycle (65)
lightgbm (1)
limma (31459)
limmaGUI (49)
limmia (1)
limSolve (1)
LINC (2)
LineagePulse (38)
lineagespot (31)
LinkHD (37)
Linnorm (157)
linprog (1)
LinTInd (38)
lintr (22)
lionessR (43)
lipidr (144)
LiquidAssociation (58)
liquidSVM (0)
lisaClust (115)
listenv (11)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lle (0)
lm.beta (1)
lmdme (37)
lme4 (96)
lmerTest (1)
LMGene (4)
lmodel2 (1)
lmom (8)
lmomco (1)
Lmoments (0)
lmtest (3)
LOBSTAHS (45)
lobstr (2)
locfdr (0)
locfit (36)
loci2path (33)
log4r (1)
logcondens (1)
logger (1)
logging (1)
logicFS (77)
LogicReg (1)
logistf (5)
logitnorm (1)
logitr (1)
logitT (32)
logitt (0)
Logolas (3)
logolas (1)
logr (1)
logspline (1)
lokern (1)
lol (2)
LOLA (199)
longitudinal (0)
longitudinalData (1)
longmemo (0)
loo (6)
LoomExperiment (553)
lotri (1)
loupeR (0)
LowMACA (16)
LowRankQP (1)
LPE (77)
LPEadj (36)
lpNet (44)
lpSolve (8)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1225)
lqa (0)
lqmm (1)
LRBaseDbi (71)
LRcell (43)
lsa (7)
LSAF (1)
lsei (1)
lsmeans (1)
lubridate (45)
lumi (1099)
Luminescence (1)
lute (1)
lvec (1)
LVSmiRNA (3)
lwgeom (1)
LymphoSeq (47)

M

m03modeldevelopment (1)
M3C (789)
M3D (2)
M3Drop (502)
m6Aboost (33)
maanova (22)
Maaslin2 (784)
maboost (1)
Macarron (32)
macat (43)
maCorrPlot (48)
MACPET (3)
MACSQuantifyR (44)
MACSr (88)
maDB (2)
made4 (217)
madness (1)
MADSEQ (32)
maftools (2530)
MAGAR (70)
MAGeCKFlute (330)
magic (1)
magick (8)
magpie (25)
magrene (34)
magrittr (28)
MAI (39)
maic (1)
maicChecks (1)
maigesPack (37)
mailR (0)
MAIT (48)
makecdfenv (125)
makePlatformDesign (1)
maketools (1)
MALDIquant (2)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
MANOR (39)
manta (4)
MantelCorr (44)
mantelcorr (0)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mAPKL (15)
mapplots (1)
mapproj (1)
maPredictDSC (36)
maps (5)
mapscape (48)
maptools (13)
maptree (1)
mapview (1)
marginaleffects (1)
margins (1)
mariner (30)
Markdown (0)
markdown (92)
marqLevAlg (1)
marr (33)
marray (1674)
martini (41)
maser (100)
maSigPro (236)
maskBAD (36)
MASS (138)
MassArray (51)
massdataset (1)
massiR (38)
MassSpecWavelet (1727)
masstools (1)
MAST (1959)
mastR (54)
matchBox (47)
Matching (1)
MatchIt (2)
matchprobes (2)
MatchThem (1)
mathjaxr (3)
matlib (1)
Matrix (190)
Matrix.utils (1)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixGenerics (36143)
MatrixModels (59)
MatrixQCvis (82)
MatrixRider (35)
matrixStats (78)
matrixTests (1)
matter (165)
MaxContrastProjection (3)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (4)
MBAmethyl (44)
MBASED (45)
MBCB (37)
MBECS (44)
mbend (1)
mbkmeans (425)
mbOmic (27)
mboost (1)
mBPCR (40)
MBQN (37)
mbQTL (25)
MBttest (46)
mc2d (1)
mcaGUI (3)
MCbiclust (37)
mclogit (1)
mclust (6)
mclustcomp (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (1)
MCPcounter (0)
mcr (3)
MCRestimate (3)
mCSEA (80)
mda (1)
mdgsa (5)
mdp (55)
mdqc (90)
MDTS (40)
MEAL (64)
MeasurementError.cor (47)
measurements (1)
measures (1)
MEAT (35)
MEB (32)
medflex (0)
mediation (1)
MEDIPS (90)
MEDME (38)
megadepth (111)
MEIGOR (46)
Melissa (37)
memes (172)
memisc (1)
memoise (17)
MEMSS (1)
memuse (1)
merDeriv (1)
MergeMaid (5)
Mergeomics (58)
merTools (1)
MeSHDbi (199)
meshes (121)
meshr (100)
MeSHSim (1)
MesKit (54)
MESS (1)
messina (50)
meta (1)
metaArray (3)
Metab (33)
metabaser (1)
metabCombiner (38)
metabinR (44)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
MetaboAnalystR (1)
MetaboAnnotation (322)
MetaboCoreUtils (659)
metabolomics (1)
metabolomicsWorkbenchR (58)
metabomxtr (39)
MetaboReport (1)
MetaboSignal (87)
metaCCA (192)
metacore (1)
MetaCyto (47)
metadat (1)
metafor (1)
metagene (40)
metagene2 (55)
metagenomeFeatures (2)
metagenomeSeq (1394)
MetaGxOvarian (1)
metahdep (51)
metaMA (7)
metaMS (88)
MetaNeighbor (74)
metap (8)
MetaPhOR (34)
metaplot (1)
metaplus (1)
metapod (4014)
metapone (51)
metaSeq (49)
metaseqR (5)
metaseqR2 (27)
MetaSKAT (0)
metatools (1)
MetaUtility (1)
metavizr (10)
MetaVolcanoR (64)
metaX (2)
MetCirc (41)
MethCP (13)
methimpute (48)
methInheritSim (43)
methods (0)
MethPed (37)
MethReg (57)
methrix (61)
MethTargetedNGS (38)
methVisual (3)
methyAnalysis (8)
MethylAid (61)
methylCC (55)
methylclock (124)
methylclockData (1)
methylGSA (95)
methylInheritance (46)
methylKit (578)
MethylMix (89)
methylMnM (50)
methylPipe (83)
methylscaper (35)
MethylSeekR (123)
methylSig (47)
methylumi (1368)
methyvim (3)
MetID (41)
metid (1)
MetNet (40)
metpath (0)
metR (1)
mets (1)
mev (1)
mfa (68)
mFilter (1)
Mfuzz (1018)
mfuzz (0)
mfx (1)
mg14 (0)
mgcv (130)
MGFM (39)
MGFR (41)
mgm (1)
mgsa (103)
mhurdle (1)
mi (0)
mia (1270)
miaSim (84)
miaViz (206)
mice (10)
miceadds (1)
MiChip (34)
microbenchmark (1)
microbiome (1567)
microbiomeDASim (37)
microbiomeExplorer (55)
microbiomeMarker (330)
MicrobiomeProfiler (79)
MicrobiotaProcess (437)
micromap (1)
microRNA (134)
microseq (1)
Microsoft365R (1)
microSTASIS (28)
MICSQTL (11)
midasHLA (48)
MIGSA (14)
MIIVsem (0)
miloR (223)
mimager (36)
mime (45)
MIMOSA (33)
mimosa (1)
mina (43)
MineICA (49)
minerva (0)
minet (595)
minfi (2129)
MinimumDistance (36)
miniUI (1)
minpack.lm (2)
minqa (43)
MiPP (35)
miQC (96)
MIRA (84)
MiRaGE (41)
mirai (1)
miRBaseConverter (146)
miRcomp (37)
mirIntegrator (37)
miRLAB (41)
miRmine (29)
miRNAmeConverter (44)
miRNApath (61)
miRNAtap (116)
miRSM (30)
miRsponge (1)
miRspongeR (46)
Mirsynergy (2)
mirt (14)
mirTarRnaSeq (60)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (1)
missMethyl (985)
missRanger (1)
missRows (40)
mistyR (91)
mitch (65)
mitml (1)
mitoClone2 (31)
mitoODE (2)
mitools (1)
mixOmics (2954)
mixsqp (13)
mixtools (1)
mlbench (6)
MLEcens (1)
mlegp (1)
mlfa (1)
mlflow (1)
MLInterfaces (288)
mlm4omics (1)
MLmetrics (1)
mlmm.gwas (1)
mlmRev (1)
mlogit (1)
MLP (94)
mlpack (1)
mlr (0)
mlr3 (1)
mlr3cluster (1)
mlr3data (1)
mlr3filters (1)
mlr3fselect (1)
mlr3hyperband (1)
mlr3learners (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (1)
mlr3tuning (1)
mlr3verse (1)
MLSeq (127)
mlt (1)
mltools (0)
MMAPPR2 (23)
MMDiff (2)
MMDiff2 (36)
mmgmos (1)
mmnet (1)
MmPalateMiRNA (2)
mmrm (17)
MMUPHin (80)
mnem (89)
mnormt (10)
MNP (1)
moanin (88)
MobilityTransformR (32)
mobster (0)
mockery (2)
mockr (1)
MODA (43)
ModCon (43)
modelbased (1)
modeldata (9)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (50)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltools (1)
MODIStsp (1)
Modstrings (110)
modules (5)
MOFA (5)
MOFA2 (383)
MOGAMUN (37)
mogsa (132)
moleculaR (1)
MoleculeExperiment (34)
MOMA (47)
moments (1)
Momocs (1)
monaLisa (89)
mondate (1)
monocle (2812)
Moonlight2R (7)
MoonlightR (44)
MoPS (2)
morpheus (0)
Morpho (1)
mosaicCore (12)
mosaics (101)
mosbi (40)
MOSim (38)
Motif2Site (35)
motifbreakR (124)
motifcounter (45)
MotifDb (576)
motifmatchr (1110)
motifRG (4)
motifStack (611)
MotIV (23)
mouse4302.db (0)
MouseFM (60)
MPA (1)
mpath (0)
MPFE (45)
MplusAutomation (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (1)
mpra (42)
MPRAnalyze (53)
MPV (1)
MQmetrics (47)
mQTL.NMR (1)
mratios (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (0)
mrgvalprep (0)
msa (1407)
MSA2dist (103)
MsBackendMassbank (55)
MsBackendMgf (458)
MsBackendMsp (133)
MsBackendRawFileReader (38)
MsBackendSql (29)
MsCoreUtils (3101)
msdata (1)
MsDataHub (33)
MSEADbi (1)
MsExperiment (350)
MsFeatures (1476)
msgbsR (43)
MSGFgui (4)
MSGFplus (9)
msigdb (1)
msigdbr (1)
msImpute (58)
mslp (34)
msm (2)
msmsEDA (226)
msmsTests (216)
MSnbase (2960)
msnbase (0)
MSnID (192)
MSPrep (66)
msPurity (63)
msQC (0)
msqrob2 (93)
MsQuality (34)
MSstats (439)
MSstatsBig (6)
MSstatsConvert (409)
MSstatsLiP (45)
MSstatsLOBD (47)
MSstatsPTM (144)
MSstatsQC (56)
MSstatsQCgui (31)
MSstatsSampleSize (27)
MSstatsShiny (74)
MSstatsTMT (233)
MSstatsTMTPTM (1)
MSstatsTMTs (1)
mstate (1)
MSwM (1)
mtbls2 (0)
MTseeker (2)
MuData (40)
muhaz (1)
Mulcom (59)
mulcom (0)
multcomp (3)
multcompView (44)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (4056)
MultiBaC (47)
multiClust (52)
multicool (2)
multicrispr (41)
multicross (1)
MultiDataSet (989)
multidplyr (1)
multiGSEA (102)
multiHiCcompare (144)
MultiMed (53)
multiMiR (218)
MultimodalExperiment (25)
multimode (1)
multinichenetr (1)
multinma (1)
multiOmicsViz (41)
multipanelfigure (1)
MultiRNAflow (7)
multiscan (36)
multiSight (55)
multiwayvcov (1)
multiWGCNA (16)
multtest (11333)
MuMIn (1)
mumosa (53)
MungeSumstats (711)
munsell (1)
muscat (330)
muscData (1)
muscle (273)
musicatk (53)
MutationalPatterns (315)
MutationTimeR (0)
mutoss (7)
mutSigExtractor (0)
mvabund (1)
MVCClass (82)
mvGST (1)
mvna (1)
mvnfast (1)
mvnormtest (1)
mvtnorm (63)
MWASTools (108)
mygene (360)
myphd (1)
myvariant (61)
mzID (2756)
mzR (3015)

N

n1qn1 (1)
N2R (0)
nabor (1)
NADA (5)
NADfinder (33)
naniar (1)
NanoMethViz (58)
nanonext (1)
NanoPyx (1)
NanoStringDiff (84)
NanoStringNCTools (324)
NanoStringQCPro (58)
nanostringr (1)
nanotatoR (69)
nanotime (1)
NanoTube (69)
narray (1)
NarrowPeaks (3)
nasapower (1)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NBAMSeq (65)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
NBSplice (14)
ncappc (1)
ncar (1)
ncbit (0)
ncdf4 (4)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1040)
ncGTW (31)
NCIgraph (77)
ncRNAtools (38)
ncvreg (1)
ndexr (58)
ndjson (0)
neaGUI (2)
nearBynding (33)
Nebulosa (847)
NeighborNet (26)
nem (8)
NEMO (0)
nempi (33)
NEONiso (1)
neonUtilities (1)
nephro (1)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
NetActivity (39)
netbenchmark (2)
netbiov (39)
netboost (31)
netboxr (14)
NetCRG (0)
netDx (38)
nethet (37)
netmeta (1)
netOmics (39)
NetPathMiner (62)
netprioR (46)
netrankr (1)
netReg (2)
netresponse (46)
NetSAM (43)
netSmooth (50)
NetSwan (1)
network (1)
networkBMA (5)
networkD3 (1)
networkDynamic (1)
netZooR (45)
NeuCA (27)
neuralnet (1)
NeuralNetTools (1)
neuRosim (0)
NewWave (69)
nFactors (1)
NGScopy (1)
ngsReports (68)
NHANES (1)
nhanesA (1)
nimble (1)
nipals (1)
nipalsMCIA (7)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (1)
nlme (142)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (1)
nloptr (56)
NLP (0)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (8)
NMproject (0)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (76)
NNLM (1)
nnls (2)
nnNorm (38)
nnSVG (64)
noctua (0)
NoiseFiltersR (0)
NOISeq (551)
NonCompart (1)
nondetects (48)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (1)
NoRCE (43)
norm (1)
normalize450K (35)
NormalizerDE (1)
NormalyzerDE (119)
NormqPCR (175)
normr (123)
nortest (1)
Nozzle.R1 (1)
np (0)
NPARC (45)
npde (1)
npGSEA (44)
nphRCT (1)
npsurv (1)
NTW (47)
nucleoSim (43)
nucleR (56)
nuCpos (48)
nudge (2)
nullranges (98)
numbat (5)
numbers (1)
numDeriv (1)
NuPoP (63)
NxtIRFcore (29)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
occugene (43)
OceanView (0)
OCplus (67)
octad (35)
odbc (12)
oddsratio (0)
ODER (23)
odseq (58)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (13)
OGRE (39)
OGSA (2)
oligo (1572)
oligoClasses (1573)
OLIN (61)
OLINgui (34)
omada (28)
OmaDB (140)
omicade4 (114)
OmicCircos (174)
omicplotR (43)
omicRexposome (37)
omicsbase (1)
OmicsLonDA (29)
OmicsMarkeR (2)
omicsmarker (0)
OMICsPCA (38)
omicsPrint (39)
omicsViewer (43)
Omixer (49)
OmnipathR (443)
ompBAM (79)
ompr (1)
ompr.roi (1)
Onassis (2)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oncomix (35)
oncoscanR (34)
OncoScore (38)
OncoSimulR (47)
oneChannelGUI (4)
onechannelgui (0)
oneSENSE (17)
onlineFDR (49)
ontoCAT (4)
ontologyIndex (14)
ontoProc (154)
ontoTools (2)
oompaBase (2)
oompaData (2)
opdisDownsampling (1)
openCyto (661)
OpenMx (1)
openPrimeR (106)
openPrimeRui (46)
openssl (222)
OpenStats (46)
openxlsx (19)
openxlsx2 (1)
OperaMate (1)
operator.tools (1)
oposSOM (55)
oppar (35)
oppti (33)
optextras (1)
OptiLCMS (0)
optimalFlow (34)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (11)
optmatch (1)
optparse (53)
optpart (1)
optweight (1)
OPWeight (37)
orca (1)
OrderedList (71)
ordinal (1)
ORFhunteR (39)
ORFik (170)
org.Ag.eg.db (1)
org.At.tair.db (1)
org.Bt.eg.db (1)
org.Ce.eg.db (1)
org.Cf.eg.db (1)
org.Dm.eg.db (1)
org.Dr.eg.db (1)
org.Gg.eg.db (0)
org.Hs.eg.db (14)
org.Hs.eg.db.html (1)
org.Mm.eg.db (11)
org.Mmu.eg.db (1)
org.Pt.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (9)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (1)
org.Xl.eg.db (1)
Organism.dplyr (371)
OrganismDbi (2992)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (282)
Orthology.eg.db (1)
orthopolynom (1)
orthos (9)
OSAT (54)
OSCA (5)
OSCA.advanced (19)
OSCA.basic (22)
OSCA.intro (121)
OSCA.multisample (18)
OSCA.workflows (33)
Oscope (70)
oskeyring (1)
osmdata (33)
osprey (1)
osqp (2)
OTUbase (37)
OutlierD (4)
OUTRIDER (176)
OutSplice (21)
overlapping (1)
OVESEG (36)

P

PAA (47)
PACKAGE (1)
packer (1)
packFinder (39)
packrat (31)
pacman (1)
padma (38)
PADOG (193)
padr (0)
pagedown (1)
pageRank (35)
pagoda2 (1)
PAIRADISE (73)
paircompviz (40)
PairedData (1)
pairedGSEA (19)
pairkat (31)
pairseqsim (1)
pairwiseComparisons (0)
pak (2)
paletteer (1)
Palimpsest (0)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (1)
pammtools (1)
pamr (3)
pan (1)
pandaR (110)
pander (2)
pandoc (1)
panelcn.mops (60)
panelr (1)
PAnnBuilder (2)
PanomiR (42)
panp (36)
PANR (37)
PanViz (44)
PanVizGenerator (4)
PAPi (5)
paradox (1)
parallel (0)
parallelly (69)
parallelMap (1)
param6 (1)
parameters (3)
ParamHelpers (0)
pareg (27)
parglms (35)
parody (85)
parsedate (2)
parsnip (9)
partCNV (10)
partitions (1)
party (1)
partykit (2)
PAST (36)
pastecs (0)
PASWR (1)
patchwork (25)
Path2PPI (57)
pathfindR.data (1)
pathifier (133)
PathInterpolatR (0)
pathlinkR (1)
PathNet (59)
PathoStat (50)
pathprint (2)
pathRender (35)
pathVar (39)
pathview (4133)
pathwayPCA (81)
PathwaySplice (2)
PatientGeneSets (1)
patrick (1)
paws (8)
paws.analytics (8)
paws.application.integration (9)
paws.common (10)
paws.compute (8)
paws.cost.management (8)
paws.customer.engagement (8)
paws.database (8)
paws.developer.tools (8)
paws.end.user.computing (8)
paws.machine.learning (8)
paws.management (8)
paws.networking (8)
paws.security.identity (8)
paws.storage (8)
paxtoolsr (85)
pbapply (30)
Pbase (1)
pbcmc (2)
pbdZMQ (1)
PBIR (1)
pbivnorm (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (69)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
PBSmapping (1)
pcaExplorer (406)
pcaGoPromoter (5)
pcalg (1)
pcaMethods (4718)
PCAN (43)
pcaPP (10)
PCAtools (1085)
PCDimension (1)
pch (1)
PCICt (1)
pcot2 (4)
PCpheno (2)
pcse (1)
pctGCdata (0)
pcxn (43)
pd.atdschip.tiling (0)
pd.clariom.s.human (1)
pd.hg.u133.plus.2 (0)
pd.mouse430.2 (0)
PDATK (40)
pdfCluster (1)
pdftools (5)
pdInfoBuilder (92)
pdmclass (3)
pdp (1)
PeacoQC (159)
peakPantheR (42)
peakPick (0)
pec (1)
PECA (42)
peco (33)
pedigree (1)
pegas (0)
pegboard (1)
PEIP (1)
penalized (1)
pengls (33)
peperr (0)
PepsNMR (106)
pepStat (38)
Peptides (1)
pepXMLTab (58)
PERFect (43)
performance (3)
PerformanceAnalytics (1)
periodicDNA (40)
perm (7)
permimp (1)
permute (2)
perturbatr (2)
PFAM.db (9)
pfamAnalyzeR (147)
PFIM (1)
PFP (25)
PGA (4)
pga (0)
pgca (46)
pgirmess (1)
PGSEA (34)
pgUtils (2)
pgxRpi (1)
phangorn (2)
phantasus (106)
phantasusLite (6)
PharmacoGx (184)
pharmaRTF (1)
pharmaversesdtm (1)
pheatmap (1)
phemd (30)
phenoDist (2)
PhenoGeneRanker (45)
phenomis (40)
phenopath (77)
phenoTest (95)
PhenStat (39)
PheWAS (0)
philentropy (2)
philr (185)
PhIPData (78)
phonTools (1)
phosphonormalizer (44)
phosphoricons (4)
PhosR (85)
phyclust (2)
phylobase (1)
phylocanvas (1)
phylogram (1)
phylolm (1)
PhyloProfile (50)
phyloseq (4960)
phylosignal (1)
phylotools (1)
phyr (1)
phytools (3)
Pi (62)
piano (327)
pickgene (45)
PICS (83)
Pigengene (94)
pillar (147)
pim (0)
pimeta (1)
PING (39)
pingr (3)
pins (35)
pint (3)
pio (0)
pipeComp (37)
pipeFrame (137)
pipeR (1)
pixmap (2)
PK (1)
pkgbuild (82)
pkgcache (1)
pkgconfig (3)
pkgdepends (1)
pkgDepTools (20)
pkgdeptools (0)
pkgdown (10)
pkgKitten (1)
pkgload (132)
pkgmaker (1)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDmodels (1)
planet (163)
planttfhunter (25)
plasmut (5)
plateCore (3)
plethy (15)
plgem (84)
plier (102)
plm (1)
PloGO2 (52)
plogr (1)
plot3D (1)
plot3Drgl (0)
plotfunctions (1)
plotgardener (265)
plotGrouper (48)
plotly (73)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (1)
plotmo (1)
plotrix (5)
plotROC (1)
PLPE (37)
plpe (0)
plrs (2)
pls (1)
PLSDAbatch (1)
plumber (1)
plw (2)
plyinteractions (9)
plyr (76)
plyranges (1051)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmm (43)
pmml (1)
pmp (109)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (24)
PoDCall (46)
podkat (41)
pogos (42)
pointblank (1)
PoissonSeq (0)
poLCA (1)
polspline (2)
Polychrome (1)
polyclip (33)
polycor (1)
polyester (108)
Polyfit (2)
polynom (3)
PolynomF (1)
polysat (0)
POMA (65)
pool (1)
poolfstat (1)
poorman (1)
PopED (1)
poppr (0)
PossibilityCurves (1)
POST (2)
posterior (8)
PoTRA (7)
PowerExplorer (3)
poweRlaw (5)
powerTCR (367)
PowerTOST (1)
POWSC (39)
ppcor (1)
ppcseq (38)
PPInfer (95)
ppiStats (4)
pqsfinder (66)
prabclus (1)
pracma (14)
prada (11)
praise (1)
pram (33)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebs (39)
PreciseSums (1)
preciseTAD (34)
PrecisionTrialDrawer (3)
precommit (0)
PREDA (74)
prediction (1)
predictionet (3)
predint (1)
PReMiuM (1)
preprocessCore (14204)
preprocesscore (1)
PreprocessCore (1)
PresenceAbsence (0)
preseqR (0)
presto (1)
prestor (0)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettyunits (83)
primirTSS (40)
PrInCE (39)
princurve (1)
printr (1)
prioritylasso (1)
prismatic (1)
Prize (2)
proActiv (50)
proBAMr (39)
proBatch (55)
pROC (39)
PROcess (73)
processCore (1)
processx (188)
procoil (38)
ProCoNA (2)
proDA (191)
prodlim (56)
productplots (1)
proffer (1)
proFIA (13)
profile (0)
profileModel (1)
profileplyr (203)
profileScoreDist (33)
profmem (1)
profvis (28)
progeny (368)
progress (11)
progressr (27)
proj (1)
PROJ (2)
proj4 (11)
ProjecTILs (1)
projectR (88)
projpred (1)
pRoloc (223)
pRolocdata (9)
pRolocGUI (67)
PROMISE (68)
promise (1)
promises (106)
prompt (1)
PROPER (68)
propr (1)
PROPS (33)
PROreg (1)
Prostar (60)
prostar (0)
prot2D (2)
proteasy (32)
proteinProfiles (44)
ProteoDisco (35)
ProteomicsAnnotationHubData (2)
ProteoMM (62)
proteoQC (2)
protGear (38)
ProtGenerics (10674)
proto (1)
protolite (1)
protr (6)
proxy (2)
proxyC (1)
PRROC (5)
pryr (8)
ps (175)
PSCBS (6)
pscl (1)
PSEA (39)
psichomics (52)
PSICQUIC (7)
PSMatch (111)
PsNR (1)
pspline (1)
psych (50)
psychometric (2)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
psygenet2r (42)
ptairMS (31)
Publish (1)
PubScore (2)
PullReadAnalysisData (1)
pulsar (0)
pulsedSilac (3)
puma (81)
PureCN (138)
purr (0)
purrr (127)
purrrlyr (1)
pvac (35)
pvca (234)
pvclust (1)
Pviz (52)
PWMEnrich (113)
pwOmics (64)
pwr (1)
pwrEWAS (39)
pxr (0)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (7)
qcc (1)
qckitfastq (53)
qcmetrics (62)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq (336)
QDNAseq.hg19 (1)
QDNAseq.mm10 (1)
QFeatures (839)
qgam (1)
qgraph (1)
qlcMatrix (5)
qmtools (37)
qpcR (1)
qpcrNorm (40)
qpdf (1)
qpgraph (142)
qPLEXanalyzer (54)
qqconf (6)
qqman (1)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qrqc (35)
qs (3)
QSARdata (1)
qsea (53)
qsmooth (85)
QSutils (41)
qsvaR (61)
qtl (1)
qtl2 (1)
QTLExperiment (7)
Qtlizer (36)
quadprog (2)
QUALIFIER (2)
qualifier (0)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantiseqr (442)
quantmod (7)
quantreg (68)
quantro (297)
quantsmooth (666)
quarto (3)
QuartPAC (33)
QuasR (312)
QuaternaryProd (69)
QUBIC (136)
questionr (1)
QuickJSR (1)
qusage (372)
qvalue (15759)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)

R

r (1)
r-limma (1)
R.cache (1)
R.devices (7)
R.filesets (7)
R.huge (5)
R.matlab (0)
R.methodsS3 (4)
R.oo (4)
R.rsp (1)
R.utils (45)
r2d2 (1)
r2d3 (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (1)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R3CPET (34)
r3Cseq (73)
R453Plus1Toolbox (40)
R4RNA (582)
R6 (63)
rAccess (1)
radarchart (1)
radiator (1)
RadioGx (39)
raer (7)
ragg (46)
RaggedExperiment (853)
RAIDS (6)
rain (73)
rainbow (7)
rama (28)
rAmCharts (1)
RamiGO (5)
ramr (35)
ramwas (89)
randomcoloR (5)
RandomFields (0)
RandomFieldsUtils (0)
randomForest (2)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randomNames (1)
RandomWalkRestartMH (105)
randPack (39)
randRotation (45)
randtoolbox (1)
ranger (6)
RankAggreg (1)
RankProd (259)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (2)
rappdirs (4)
rapportools (1)
RAREsim (42)
RareVariantVis (37)
Rariant (2)
rARPACK (5)
Rarr (81)
raster (51)
ratelimitr (1)
RAthena (8)
rawrr (200)
RbcBook1 (57)
Rbec (34)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (9014)
rbgl (0)
rbibutils (20)
rbioapi (2)
RBioFormats (55)
RBioinf (45)
rBiopaxParser (160)
rBLAST (1)
RBM (43)
rbmi (1)
Rbowtie (441)
Rbowtie2 (291)
rbsurv (44)
Rbwa (101)
Rcade (20)
rcartocolor (1)
RCAS (79)
RCASPAR (45)
rcdk (8)
RCdk (1)
rcdklibs (8)
rcellminer (53)
rCGH (77)
Rcgmin (1)
Rchemcpp (2)
Rchoice (1)
RchyOptimyx (3)
RCircos (0)
RcisTarget (918)
RClickhouse (1)
rclipboard (2)
RCM (40)
rcmdcheck (49)
RcmdrMisc (1)
Rcollectl (19)
RColorBrewer (11)
rcompanion (1)
rcorpora (1)
Rcpi (101)
Rcpp (146)
RcppAnnoy (24)
RcppArmadillo (128)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (50)
RcppGSL (2)
RcppHNSW (12)
RcppML (4)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (12)
RcppProgress (1)
RcppRoll (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (1)
RcppTOML (12)
RcppZiggurat (6)
Rcsdp (1)
RCSL (43)
RCurl (55)
RCurl.back (0)
Rcwl (61)
RcwlPipelines (57)
RCX (87)
RCy3 (744)
RCyjs (57)
RCytoscape (6)
Rd2roxygen (0)
rda (0)
RDAVIDWebService (27)
Rdbi (2)
RdbiPgSQL (1)
RDCOMClient (0)
rdd (1)
rdflib (1)
rDGIdb (77)
Rdimtools (1)
Rdisop (463)
rdocx (1)
Rdpack (21)
RDRToolbox (104)
Rdsdp (1)
reactable (2)
reactlog (1)
reactome.db (6)
ReactomeContentService4R (93)
ReactomeGraph4R (34)
ReactomeGSA (221)
ReactomePA (2151)
reactR (6)
readat (3)
readbitmap (1)
readODS (1)
ReadqPCR (204)
readr (59)
readstata13 (1)
readxl (59)
reb (3)
REBayes (1)
REBET (35)
rebook (227)
receptLoss (30)
recipes (50)
reclin (1)
recommenderlab (7)
reconsi (33)
recosystem (12)
recount (398)
recount3 (319)
recountmethylation (39)
recoup (37)
reda (1)
REddyProc (1)
RedeR (272)
RedisParam (33)
redoc (1)
REDseq (58)
redux (1)
refinr (0)
RefManageR (1)
RefNet (2)
RefPlus (42)
RegEnrich (72)
regionalpcs (6)
RegionalST (7)
regioneR (1921)
regioneReloaded (32)
regionReport (92)
registry (1)
RegParallel (1)
regsplice (31)
regutools (40)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (6)
relimp (1)
remaCor (3)
rematch (37)
rematch2 (1)
remotes (76)
REMP (47)
rentrez (1)
renv (130)
Repitools (319)
report (1)
reporter (1)
reporting (1)
ReportingTools (694)
reposTools (1)
repr (1)
reprex (11)
repurrrsive (1)
RepViz (65)
ReQON (32)
reReg (1)
resample (0)
reshape (2)
reshape2 (8)
ResidualMatrix (3171)
RESOLVE (37)
Resourcerer (2)
restfulr (6)
restfulSE (89)
reticulate (33)
retrofit (26)
ReUseData (15)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (49)
rexposome (87)
rfaRm (33)
Rfast (11)
Rfastp (127)
rfcdmin (1)
Rfit (1)
rflowcyt (2)
RFOC (4)
rfPred (40)
rGADEM (267)
RGalaxy (4)
rgbif (1)
RGCCA (1)
rgdal (8)
rGenomeTracks (35)
rgenoud (1)
rgeos (10)
rgexf (1)
Rgin (3)
rgl (2)
Rglpk (2)
RGMQL (27)
RgnTX (29)
RgoogleMaps (2)
rgoslin (62)
RGraph2js (36)
Rgraphviz (9336)
rgraphviz (1)
rGREAT (644)
RGSEA (55)
rgsepd (35)
rhandsontable (2)
rhdf5 (18264)
rhdf5client (88)
rhdf5filters (17820)
Rhdf5lib (20232)
rhino (4)
Rhisat2 (186)
RhpcBLASctl (1)
Rhtslib (21127)
rhub (1)
rHVDM (2)
rhvdm (0)
RiboCrypt (31)
RiboDiPA (41)
RiboProfiling (58)
ribor (37)
riboSeq (0)
riboSeqR (28)
ribosomeProfilingQC (54)
rice (1)
RIdeogram (1)
ridigbio (1)
rifi (29)
rifiComparative (20)
RImmPort (46)
Ringo (349)
RInside (0)
Rintact (1)
rintrojs (1)
rio (6)
RIPAT (29)
RIPSeeker (16)
Risa (44)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
RITAN (41)
ritis (1)
RItools (1)
RIVER (34)
riverplot (1)
rj (0)
rj.gd (0)
rjags (1)
rJava (2)
RJDBC (1)
RJMCMCNucleosomes (34)
rjson (17)
rjsoncons (1)
RJSONIO (9)
Rlab (1)
rlang (186)
RLassoCox (55)
rle (0)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
rlist (1)
RLMM (50)
RLRsim (1)
RLSeq (31)
rly (0)
RMAGEML (1)
Rmagic (1)
Rmagpie (33)
RMAPPER (3)
RMariaDB (2)
rmarkdown (183)
RMassBank (75)
rMAT (4)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rmelting (66)
rmeta (1)
rminer (1)
rmio (1)
RmiR (4)
Rmisc (1)
Rmmquant (35)
Rmpfr (9)
Rmpi (1)
rms (2)
rmsb (1)
rmspc (41)
RMTstat (1)
rmutil (0)
rMVP (1)
RMySQL (2)
RNAAgeCalc (58)
RNAdecay (39)
rnaEditr (33)
RNAi (1)
RNAinteract (52)
RNAither (3)
RNAmodR (70)
RNAmodR.AlkAnilineSeq (39)
RNAmodR.ML (31)
RNAmodR.RiboMethSeq (34)
RNAprobR (2)
RNAsense (32)
rnaseqcomp (59)
RNAseqCovarImpute (6)
RnaSeqGeneEdgeRQL (1)
rnaSeqMap (4)
RNASeqPower (124)
RNASeqR (14)
RnaSeqSampleSize (76)
rnaturalearth (1)
RnBeads (232)
RnBeads.hg19 (3)
RnBeads.hg38 (3)
RnBeads.mm10 (3)
RnBeads.mm9 (2)
RnBeads.rn5 (2)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (1)
rngWELL (1)
Rnits (27)
RNOmni (1)
roar (38)
roastgsa (7)
robfilter (1)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (4)
robustbase (11)
robustlmm (1)
ROC (1043)
ROCpAI (34)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
RolDE (35)
Roleswitch (3)
Rolexa (2)
roll (1)
rols (328)
roma (1)
ROntoTools (151)
Rook (1)
rootSolve (8)
ropls (990)
roptim (1)
ROracle (1)
ROSeq (33)
rosettR (1)
rotl (1)
ROTS (179)
round (1)
roxygen (1)
roxygen2 (59)
RPA (55)
rpact (1)
rpart (64)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (5)
RPostgres (14)
RPostgreSQL (1)
rprimer (57)
rprintf (1)
rprojroot (101)
RProtoBufLib (2246)
rpsftm (1)
RpsiXML (6)
RPtests (1)
RPushbullet (1)
rpx (239)
Rqc (250)
rqt (38)
rqubic (59)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
rrcov (9)
rRDP (53)
Rredland (1)
rredlist (1)
RRHO (98)
RRPP (1)
rrvgo (365)
rsample (11)
Rsamtools (20926)
rsamtools (0)
rsbml (119)
RSclient (1)
rsconnect (64)
rScudo (37)
RSEIS (5)
RSelenium (1)
rsemmed (45)
RSeqAn (86)
Rserve (0)
rSFFreader (2)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
RSNPper (1)
rsnps (1)
Rsolnp (3)
RSpectra (4)
RSQLite (118)
Rssa (0)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (0)
rstan (9)
rstanarm (1)
rstantools (7)
rstatix (13)
rstpm2 (1)
rstudio (0)
rstudioapi (123)
Rsubread (2228)
rsvd (8)
rsvg (2)
RSVSim (44)
rSWeeP (44)
Rsymphony (1)
rtables (1)
rTANDEM (6)
RTCA (39)
RTCGA (528)
RTCGAToolbox (583)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
RTN (129)
RTNduals (64)
RTNsurvival (52)
RTools4TB (1)
RTopper (35)
Rtpca (34)
rtracklayer (19187)
Rtreemix (38)
rTRM (84)
rTRMui (37)
Rtsne (3)
Rttf2pt1 (1)
rtweet (4)
rubasic (0)
Ruchardet (1)
rugarch (1)
runibic (67)
RUnit (1)
runjags (1)
runonce (1)
Runuran (1)
rusinglecell (0)
Ruuid (3)
ruv (0)
RUVcorr (44)
RUVnormalize (49)
RUVSeq (895)
RUVseq (1)
RVAideMemoire (1)
Rvcg (1)
rvcheck (1)
RVenn (1)
rversions (58)
rvest (12)
rvg (1)
Rvisdiff (6)
Rvmmin (1)
RVS (36)
RVtests (1)
Rwave (5)
RWebServices (2)
RWiener (1)
rWikiPathways (369)
rworldmap (1)
RxODE (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (45)
S4Arrays (21001)
S4Vectors (51058)
s4vectors (1)
saemix (1)
safe (519)
safetyData (1)
safetyexploreR (1)
safetyMarginCalculation (1)
SAGElyzer (2)
sagenhaft (34)
SAGx (6)
SAIGEgds (52)
samExploreR (2)
sampleClassifier (38)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (5)
SamSPECTRAL (114)
sandwich (3)
sangeranalyseR (162)
sangerseqR (720)
SANTA (56)
sapFinder (2)
saps (1)
SARC (7)
sarks (33)
sas7bdat (1)
saseR (1)
SASmixed (1)
sass (142)
satellite (1)
satuRn (212)
savR (43)
SBGNview (112)
SBGNview.data (1)
sbgr (1)
SBMLR (57)
SC3 (424)
sc3 (0)
scagnostics (1)
Scale4C (35)
ScaledMatrix (10938)
scales (35)
scAlign (21)
scalreg (1)
scam (1)
SCAN.UPC (85)
scanMiR (54)
scanMiRApp (44)
scAnnotatR (97)
SCANVIS (51)
SCArray (58)
SCArray.sat (24)
SCATE (62)
scater (6107)
scatterD3 (1)
scatterHatch (44)
scattermore (17)
scatterpie (9)
scatterplot3d (49)
scBFA (39)
SCBN (72)
scBubbletree (38)
scCB2 (36)
scClassifR (2)
scClassify (66)
scclusteval (1)
sccomp (64)
sccore (1)
sccs (1)
scCustomize (1)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
scDataviz (58)
scDblFinder (1163)
ScDblFinder (1)
scDC (1)
scDD (122)
scDDboost (33)
scde (321)
scDesign3 (9)
scds (457)
SCENIC (0)
SCFA (36)
scFeatureFilter (48)
scFeatures (35)
scfind (2)
scGate (1)
scGPS (42)
scGSVA (0)
schex (159)
scHOT (55)
scico (1)
scidb (1)
scider (6)
scifer (34)
Scillus (1)
ScISI (7)
scistreer (5)
scLinear (1)
scMAGeCK (26)
scmap (290)
scMerge (418)
scMET (39)
scmeth (47)
SCnorm (82)
scone (85)
Sconify (33)
SCOPE (47)
SCopeLoomR (0)
scoreInvHap (33)
scoringRules (1)
scp (102)
SCP (1)
scPCA (73)
scPipe (96)
scplot (0)
scran (4270)
scReClassify (34)
scRecover (46)
screenCounter (23)
ScreenR (32)
scRepertoire (326)
scrime (5)
scRNAseq (1)
scRNASeq.spatial (1)
scRNAseqApp (31)
scruff (47)
scry (188)
scrypt (2)
scs (1)
scShapes (34)
scsR (2)
scTensor (74)
scTGIF (90)
scTHI (33)
sctransform (15)
scTreeViz (38)
scuttle (9269)
scviewer (1)
scviR (26)
sda (1)
SDAMS (38)
SDMTools (1)
sdtmchecks (0)
sechm (132)
secrets (1)
see (1)
seewave (0)
segmented (3)
segmenter (33)
segmentSeq (34)
selectKSigs (30)
selectr (1)
SELEX (38)
sem (0)
SemDist (38)
semEff (1)
semisup (44)
SemSim (2)
semsim (1)
semTools (1)
sen2r (1)
sendmailR (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
SEPA (2)
SEPIRA (26)
seq.hotSPOT (21)
seq2pathway (75)
seqArchR (62)
seqArchRplus (24)
SeqArray (778)
seqbias (58)
seqCAT (35)
seqCNA (48)
seqcombo (49)
SeqGate (31)
SeqGSEA (87)
seqinr (2)
seqLogo (2724)
seqlogo (0)
seqmagick (0)
seqminer (8)
Seqnames (0)
seqPattern (571)
seqplots (7)
seqsetvis (48)
SeqSQC (73)
seqTools (109)
sequenza (1)
SeqVarTools (429)
seriation (14)
servr (2)
sesame (560)
sesameData (1)
sessioninfo (48)
set6 (1)
SEtools (90)
setRNG (1)
sets (1)
settings (1)
seurat (1)
Seurat (28)
SeuratData (0)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (21)
SeuratWrappers (1)
sevenbridges (51)
sevenC (36)
sf (52)
sfheaders (5)
sfsmisc (2)
sftime (1)
SGCP (54)
sgeostat (1)
SGP (1)
SGSeq (261)
shadowtext (1)
shape (3)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (1)
SharedObject (95)
ShatterSeek (0)
SHELF (1)
shiny (120)
shiny.gosling (1)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyAce (1)
shinyalert (1)
shinyauth (1)
shinyBS (8)
shinybusy (3)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (7)
shinydisconnect (1)
shinyEffects (1)
shinyepico (44)
shinyfeedback (1)
shinyFeedback (1)
shinyFiles (11)
shinyglide (1)
shinyhelper (5)
ShinyItemAnalysis (24)
shinyjqui (1)
shinyjs (3)
shinyloadtest (1)
shinyLP (1)
shinymanager (1)
shinyMatrix (1)
shinyMethyl (77)
shinyMobile (0)
shinypanel (6)
shinyscreenshot (3)
shinySelect (0)
shinystan (1)
shinyTANDEM (2)
shinytest (2)
shinytest2 (2)
shinythemes (1)
shinytoastr (1)
shinyTree (2)
shinyvalidate (24)
shinyWidgets (40)
ShortRead (5842)
shortread (0)
showimage (1)
showtext (1)
showtextdb (1)
SIAMCAT (94)
SICtools (30)
SID (1)
sidap (0)
sigaR (5)
SigCheck (37)
sigclust (1)
sigFeature (166)
Sigfried (1)
SigFuge (35)
siggenes (2921)
sights (40)
Signac (9)
signal (1)
signature.tools.lib (0)
signature.tools.lib.back (0)
signature.tools.lib.v2.1 (0)
signature.tools.lib.v2.1.2 (0)
signatureSearch (148)
signeR (59)
signet (2)
signifinder (43)
SignifReg (0)
sigPathway (56)
sigpathway (0)
SigsPack (33)
sigsquared (35)
SIM (39)
SIMAT (36)
SimBindProfiles (34)
SimBu (44)
SimComp (1)
SIMD (32)
simex (1)
SimFFPE (36)
similaRpeak (56)
SimInf (0)
SIMLR (239)
simona (8)
simpar (1)
simpleaffy (100)
simplermarkdown (1)
simpleSeg (51)
simpleSingleCell (0)
simplifyEnrichment (550)
simputation (1)
SimSeq (0)
simsurv (1)
simulatorAPMS (2)
simulatorZ (2)
sincell (53)
single (36)
SingleCellExperiment (13657)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellSignalR (206)
singleCellTK (208)
SingleMoleculeFootprinting (34)
SingleR (3399)
singleR (1)
SingleRBook (3)
singscore (1131)
SiPSiC (24)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
SISPA (34)
sitadela (34)
sitePath (40)
sitmo (7)
sizepower (57)
SJava (2)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (8)
SkewHyperbolic (1)
skewr (30)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (1)
slalom (65)
slam (2)
SLGI (3)
slickR (0)
slider (10)
slingshot (1254)
slinky (3)
sloop (1)
SLqPCR (53)
sm (0)
smacof (1)
SMAD (46)
SMAP (48)
smartdata (0)
smcfcs (1)
smfishHmrf (1)
SMITE (41)
smldesign (1)
smooth (1)
smoother (0)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (7)
sn (8)
sna (1)
SNAData (1)
SNAGEE (49)
snakecase (12)
SnapATAC (1)
snapCGH (78)
snapcount (46)
snifter (113)
snm (158)
snow (9)
SnowballC (1)
snowfall (1)
SNPchip (10)
SNPediaR (43)
SNPhood (37)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
snpMatrix (8)
snpmatrix (0)
SNPRelate (1487)
snpStats (2066)
SOAR (0)
sodium (7)
softImpute (1)
soGGi (279)
soilDB (1)
sojourner (11)
solrium (1)
som (1)
SomaDataIO (0)
SomatiCA (2)
SomaticSignatures (142)
SomaVarDB (1)
SOMbrero (1)
sommer (1)
SOMNiBUS (43)
sortable (2)
sos (1)
soundecology (0)
SoupX (1)
sourcetools (36)
sp (52)
spacefillr (1)
SpacePAC (52)
spacetime (1)
SPACox (0)
spacrt (1)
spade (5)
spam (3)
spam64 (1)
spaMM (1)
Spaniel (59)
sparkline (1)
sparklyr (8)
SPARQL (1)
sparrow (113)
SparseArray (7062)
sparsebn (1)
sparseDOSSA (47)
SparseGrid (1)
SparseM (2)
sparseMatrixStats (14081)
sparsenetgls (46)
sparsepca (1)
SparseSignatures (41)
sparsesvd (14)
spaSim (39)
spatial (22)
SpatialCPie (62)
spatialDE (83)
SpatialDecon (142)
SpatialExperiment (1155)
SpatialFeatureExperiment (116)
spatialHeatmap (87)
SpatialOmicsOverlay (32)
spatialreg (1)
spatstat (2)
spatstat.core (9)
spatstat.data (11)
spatstat.explore (12)
spatstat.geom (19)
spatstat.linnet (1)
spatstat.model (1)
spatstat.random (19)
spatstat.sparse (16)
spatstat.utils (16)
spatzie (33)
spd (1)
spData (6)
spdep (2)
spec (1)
speckle (80)
specL (53)
SpeCond (54)
spectacles (1)
Spectra (960)
SpectralTAD (73)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (1)
SPEM (49)
spgs (1)
SPIA (558)
SPIAT (77)
spicyR (152)
SpidermiR (66)
spikeLI (43)
spiky (36)
spillR (1)
spkTools (34)
splancs (5)
splatter (401)
splicegear (2)
spliceR (5)
spliceSites (3)
SpliceWiz (56)
SplicingFactory (33)
SplicingGraphs (63)
splines (0)
splines2 (1)
splineTCDiffExpr (1)
splineTimeR (55)
SPLINTER (33)
splitTools (1)
splots (157)
spls (1)
splus2R (1)
SPONGE (65)
SpotClean (69)
SPOTlight (187)
spotSegmentation (2)
spqn (40)
spsComps (1)
SPsimSeq (86)
SQLDataFrame (35)
sqldf (1)
SQUADD (43)
SQUAREM (1)
sRACIPE (51)
SRAdb (345)
sRAP (4)
SRGnet (2)
srnadiff (22)
sROC (0)
ssanv (1)
sscore (31)
sscu (36)
sSeq (147)
ssh.utils (0)
ssize (82)
sSNAPPY (76)
SSPA (62)
ssPATHS (31)
ssrch (76)
ssviz (43)
stabledist (1)
stabs (1)
stageR (173)
stam (1)
STAN (17)
standR (77)
StanHeaders (6)
staRank (32)
StarBioTrek (40)
stargazer (1)
Starr (3)
stars (2)
starter (1)
startup (1)
startupmsg (0)
STATegRa (42)
Statial (47)
statmod (2)
statnet (1)
statnet.common (2)
stats (0)
stats4 (0)
statsExpressions (1)
statTarget (89)
STdeconvolve (90)
stdmchecks (0)
stdReg (1)
stepNorm (34)
stepwiseCM (2)
stevedore (1)
sticky (1)
stinepack (1)
stJoincount (43)
stopwords (1)
storr (1)
strandCheckR (36)
Streamer (38)
strex (1)
string (1)
STRINGdb (970)
stringdist (12)
stringfish (2)
stringi (86)
stringr (90)
striprtf (1)
STROMA4 (29)
strucchange (1)
struct (115)
Structstrings (95)
structToolbox (83)
StructuralVariantAnnotation (160)
styler (37)
SubCellBarCode (38)
subplex (1)
subselect (1)
subSeq (56)
SUITOR (32)
SummarizedBenchmark (40)
SummarizedExperiment (34874)
summarizedExperiment (1)
summarytools (1)
Summix (45)
sunburstR (1)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
supersigs (36)
SuppDists (1)
supraHex (403)
surfaltr (39)
survcomp (950)
survey (1)
survival (99)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (2)
survPen (1)
survPresmooth (1)
survtype (42)
Sushi (69)
susieR (14)
sva (6619)
svaNUMT (35)
SVAPLSseq (2)
svaRetro (35)
svd (2)
svDialogs (1)
svglite (15)
svGUI (1)
SVM2CRM (1)
SVMDO (52)
svUnit (1)
swagger (1)
SWATH2stats (47)
SwathXtend (55)
swfdr (49)
Swiffer (1)
SwimR (2)
swirl (1)
switchBox (109)
switchde (39)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (1)
synapser (0)
synapsis (34)
synapter (64)
synergyfinder (172)
SynExtend (38)
synlet (36)
SynMut (35)
syntenet (93)
sys (149)
sysfonts (1)
systemfit (1)
systemfonts (59)
systemPipeR (1124)
systemPipeRdata (0)
systemPipeShiny (58)
systemPipeTools (41)
syuzhet (1)

T

table1 (1)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
tadar (6)
TADCompare (64)
TailRank (2)
tanggle (51)
TAPseq (44)
tarchetypes (4)
target (35)
TargetDecoy (34)
targets (4)
TargetScore (55)
TargetSearch (63)
targetsearch (0)
TarSeqQC (15)
taxize (1)
TBSignatureProfiler (44)
TCC (171)
TCGAbiolinks (3179)
TCGAbiolinksGUI (40)
TCGAbiolinksGUI.data (1)
TCGAutils (772)
tcltk (0)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TCseq (127)
TDARACNE (12)
TDbasedUFE (47)
TDbasedUFEadv (35)
TeachingDemos (1)
teal (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.widgets (1)
TEKRABber (66)
templater (0)
tensor (1)
tensorA (1)
tensorflow (12)
TENxIO (40)
TENxPBMCData (1)
tenXplore (33)
TEQC (48)
tergm (1)
tern (1)
ternarynet (36)
terra (53)
terraTCGAdata (34)
tesseract (1)
testit (1)
testthat (207)
texreg (1)
textshaping (37)
TFARM (31)
tfautograph (1)
TFBSTools (2345)
tfbstools (1)
tfdatasets (1)
TFEA.ChIP (52)
TFHAZ (29)
TFisher (1)
TFMPvalue (7)
tfrmt (1)
tfruns (8)
TFutils (61)
tgp (1)
tgxWebservices (1)
TH.data (2)
thematic (2)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
ThresholdROC (1)
tibble (146)
tictoc (3)
tidybayes (1)
tidybulk (174)
tidycensus (18)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidygraph (5)
tidyjson (0)
tidylog (1)
tidymodels (6)
tidyposterior (1)
tidyr (32)
tidyrules (1)
tidyselect (21)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySingleCellExperiment (157)
tidySummarizedExperiment (263)
tidyterra (1)
tidytext (1)
tidytlg (1)
tidytree (22)
tidyTree (1)
tidyverse (12)
tidyvpc (1)
tidyxl (1)
tiff (1)
tigre (41)
tigris (14)
tikzDevice (1)
TileDBArray (37)
tilingArray (97)
timechange (3)
timecourse (51)
timeDate (11)
timeOmics (58)
timereg (1)
TimerQuant (0)
timescape (74)
timeSeries (2)
TimeSeriesExperiment (5)
timetk (1)
TimiRGeN (49)
Timma (1)
TIN (37)
TINC (0)
tinkr (1)
tinysnapshot (1)
tinytest (1)
tinytex (167)
tippy (1)
tis (1)
TissueEnrich (117)
TitanCNA (57)
titanic (1)
tkrgl (0)
tkrplot (1)
tkWidgets (1155)
tkwidgets (0)
tLOH (31)
tm (1)
tmap (1)
TMB (14)
TMixClust (48)
tmle (1)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (1)
TNBC.CMS (37)
TNO (1)
TnT (35)
TOAST (321)
toastui (1)
tofsims (2)
tokenizers (1)
tokupika (1)
tolerance (1)
tomoda (30)
tomoseqr (32)
tools (0)
toOrdinal (1)
TOP (22)
ToPASeq (4)
topconfects (165)
topdownr (52)
topGO (2835)
topgo (0)
topicmodels (0)
torch (1)
ToxicoGx (39)
Tplyr (1)
TPP (75)
TPP2D (40)
tracee (1)
tracktables (101)
trackViewer (378)
trackviewer (1)
tradeSeq (427)
TrajectoryGeometry (42)
TrajectoryUtils (1507)
tram (1)
TraMineR (0)
transcriptogramer (45)
transcriptR (40)
transformGamPoi (45)
transformr (1)
transite (40)
tRanslatome (72)
transomics2cytoscape (34)
transport (1)
TransView (36)
TraRe (10)
traseR (35)
Travel (8)
traviz (37)
tree (1)
TreeAndLeaf (105)
treeio (18248)
treekoR (36)
treemap (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1276)
TREG (37)
trena (39)
TReNA (1)
Trendy (46)
TRESS (73)
triangle (1)
tricycle (150)
triebeard (2)
triform (3)
trigger (36)
trimcluster (0)
trio (71)
tripack (1)
triplex (37)
tripr (50)
tRNA (87)
tRNAdbImport (73)
tRNAscanImport (51)
TRONCO (52)
trtf (1)
truncdist (1)
truncnorm (4)
truncreg (1)
trust (0)
TSAR (6)
TSCAN (507)
tscR (35)
tseries (2)
tseriesChaos (0)
tsfeatures (2)
tsModel (1)
tsna (0)
tsne (1)
TSP (14)
tspair (4)
TSRchitect (4)
TSSi (2)
ttdo (1)
ttgsea (77)
TTMap (31)
TTR (1)
ttservice (1)
tufte (1)
tune (9)
tuneR (0)
TurboNorm (35)
TVTB (36)
twang (1)
twangContinuous (1)
tweeDEseq (115)
tweedie (1)
tweenr (4)
twilight (95)
twoddpcr (39)
TwoSampleMR (0)
twosamples (1)
txcutr (33)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (6)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene (0)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene (5)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene (1)
tximeta (1116)
tximport (3315)
tximportDat (1)
tximportData (1)
TxRegInfra (2)
txtq (1)
TypeInfo (45)
tzdb (64)

U

uatools (1)
UCell (1008)
uchardet (1)
ucminf (1)
udunits2 (1)
Ularcirc (36)
umap (8)
UMI4Cats (41)
unbalanced (0)
uncoverappLib (33)
UNDO (57)
unifiedWMWqPCR (36)
UniProt.ws (378)
uniqueAtomMat (0)
Uniquorn (36)
unitizer (1)
units (50)
universalmotif (430)
unmarked (1)
updateObject (34)
UpSetR (1)
urca (1)
urlchecker (1)
urltools (1)
uroot (0)
useful (1)
usethis (74)
usmap (1)
usmapdata (1)
uSORT (34)
UTAR (0)
utf8 (137)
utils (0)
utilsRmd (1)
uuid (37)
uwot (25)

V

V8 (11)
VAExprs (35)
validate (1)
VanillaICE (116)
vaplot (1)
vapour (0)
VarCon (35)
variables (1)
variancePartition (753)
VariantAnnotation (8573)
VariantExperiment (40)
VariantFiltering (50)
VariantTools (132)
varImp (1)
vars (1)
vasp (1)
VaSP (35)
vaultr (1)
vbmp (59)
VBsparsePCA (1)
vcd (1)
VCFArray (35)
vcfR (0)
vcr (1)
vctrs (226)
vdbR (1)
vdiffr (2)
VDJdive (37)
Vega (2)
VegaMC (37)
vegan (3)
vegawidget (1)
velociraptor (100)
velocyto.R (0)
veloviz (52)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (7)
VennDetail (194)
VennDiagram (1)
venneuler (1)
VERSO (45)
VGAM (7)
VGAMextra (1)
vhydeg (1)
VIBER (0)
vidger (84)
VIM (1)
VineCopula (1)
vioplot (0)
vip (1)
viper (640)
vipor (2)
viridis (65)
viridisLite (91)
viridislite (0)
virtualArray (3)
visdat (1)
ViSEAGO (109)
visNetwork (3)
visR (1)
vissE (82)
vistime (13)
Voyager (73)
vpc (1)
VplotR (48)
vroom (94)
vscDebugger (1)
vsclust (39)
vsn (4851)
vtpnet (42)
vulcan (37)

W

waddR (42)
waffle (1)
waiter (7)
wakefield (1)
waldo (109)
warp (3)
wateRmelon (735)
wavClusteR (41)
waveslim (0)
waveTiling (3)
wdm (1)
wdman (1)
weaver (53)
webbioc (39)
webchem (1)
webdriver (1)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (20)
webshot2 (1)
websocket (1)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (2)
WeightSVM (0)
weitrix (37)
WES.1KG.WUGSC (1)
wesanderson (1)
WGCNA (8)
WGScan (1)
WGSmapp (0)
whereami (1)
whisker (78)
whitening (1)
whoami (1)
widgetInvoke (1)
widgetTools (1169)
widgettools (0)
wiggleplotr (145)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (1)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (116)
wk (64)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (8)
workflowsets (5)
worrms (1)
wpm (45)
wppi (37)
Wrench (1376)
writexl (2)
WriteXLS (1)
WRS2 (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xbioc (1)
XBSeq (2)
XCIR (1)
xcms (1583)
xcore (38)
XDE (37)
xdg-utils (1)
Xeva (35)
xfun (226)
xgboost (7)
xgxr (1)
XINA (35)
XLConnect (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
xmapbridge (45)
xmapcore (2)
XML (42)
xml2 (149)
xmlparsedata (1)
XNAString (38)
xopen (1)
xpose (1)
xpose.nlmixr2 (1)
xpose4 (1)
xps (5)
xrf (1)
xslt (1)
xtable (2)
xts (4)
XVector (43096)
XVectorb (0)

Y

y2hStat (1)
yaImpute (1)
yaml (99)
yamss (42)
YAPSA (57)
yaqcaffy (3)
yardstick (9)
yarn (114)
ylab.utils (1)
ymlthis (0)
yspec (1)
yulab.utils (24)

Z

zCompositions (7)
zeallot (1)
zellkonverter (889)
zen4R (1)
zenith (98)
zFPKM (106)
zinbwave (752)
zip (100)
Ziploc (1)
zlibbioc (44003)
zoo (20)
ZygosityPredictor (20)