See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2023-03-24 20:41:28 -0400 (Fri, 24 Mar 2023).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 15

1ALL (3110)
2TCGAbiolinksGUI.data (2601)
3HSMMSingleCell (2237)
4celldex (1941)
5airway (1694)
6geneLenDataBase (1427)
7scRNAseq (1350)
8pasilla (853)
9tximportData (715)
10ChAMPdata (561)
11bladderbatch (523)
12Illumina450ProbeVariants.db (498)
13GSVAdata (484)
14msdata (448)
15sesameData (422)

All experiment packages

All experiment package stats in one file: experiment_pkg_stats.tab

All experiment package download scores in one file: experiment_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor experiment repository (all packages combined)

A

a4Core (0)
a4Reporting (0)
ABAData (18)
abind (1)
adabag (1)
adductData (35)
ade4 (1)
adegenet (1)
ADGofTest (1)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (3)
AER (1)
affxparser (0)
affy (1)
affycompData (24)
affycoretools (1)
affydata (324)
Affyhgu133A2Expr (25)
Affyhgu133aExpr (30)
Affyhgu133Plus2Expr (37)
affyio (1)
AffymetrixDataTestFiles (70)
Affymoe4302Expr (27)
Affymoe430Expr (1)
affyPLM (0)
AgiMicroRna (1)
agricolae (2)
AIMS (0)
airway (1694)
ALDEx2 (1)
aldvmm (1)
ALL (3110)
all (0)
allenpvc (1)
ALLMLL (117)
alphashape3d (1)
alpineData (28)
AMARETTO (0)
Amelia (1)
amgen.okta.client (1)
AmpAffyExample (24)
ANCOMBC (0)
AneuFinderData (66)
annaffy (1)
annotate (1)
AnnotationDbi (2)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (1)
antiProfilesData (38)
AnVIL (1)
apcluster (1)
ape (1)
apeglm (1)
apexcharter (1)
aplot (2)
aqp (1)
aracne.networks (54)
argparse (2)
arm (1)
aroma.affymetrix (2)
aroma.apd (2)
aroma.core (2)
aroma.light (0)
arrayhelpers (1)
arrayQualityMetrics (0)
ARRmData (37)
arrow (3)
arsenal (1)
asciicast (1)
ASExtras4 (1)
ash (2)
AshkenazimSonChr21 (14)
ashr (0)
asht (1)
ASICSdata (25)
AsioHeaders (1)
askpass (1)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive.properties (1)
assertr (1)
assertthat (1)
AssessORFData (21)
ASSET (0)
ATE (1)
AUCell (1)
av (1)
aws.s3 (2)
aws.signature (2)

B

babelgene (1)
babelmixr2 (1)
backports (9)
BADER (0)
badger (1)
baguette (1)
ballgown (1)
BART (1)
base64enc (1)
base64url (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
BayesFactor (0)
bayesmeta (1)
bayesplot (2)
bayestestR (1)
baySeq (1)
BB (1)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbr (1)
bcellViper (411)
bdsmatrix (1)
beachmat (1)
beadarray (0)
beadarrayExampleData (43)
BeadArrayUseCases (24)
BeadDataPackR (0)
BeadSorted.Saliva.EPIC (16)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkfdrData2019 (16)
benchmarkme (1)
BentoBoxData (0)
beta7 (19)
bezier (1)
BH (13)
BiasedUrn (2)
bibtex (1)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
biglm (1)
bigmemory (1)
bigparallelr (1)
bigreadr (1)
bigrquery (2)
bigutilsr (1)
binom (1)
binr (1)
Biobase (2)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (1)
BiocGenerics (2)
BiocInstaller (1)
BiocIO (1)
BiocManager (8)
BiocNeighbors (1)
Bioconductor (1)
BiocParallel (3)
BiocSingular (1)
BiocStyle (0)
BiocVersion (5)
biocViews (1)
BioImageDbs (16)
biomaRt (1)
biomartr (1)
biomformat (1)
BioPlex (11)
biostatUtil (1)
Biostrings (4)
biotmleData (27)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
BiRewire (0)
birta (0)
biscuiteerData (43)
bit (4)
bit64 (2)
bitops (1)
bizdays (0)
bladderbatch (523)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blimaTestingData (25)
blme (2)
blob (4)
blockcluster (1)
blogdown (1)
BloodCancerMultiOmics2017 (35)
BMA (1)
bnlearn (1)
bodymapRat (25)
BOIN (1)
bookdown (6)
boot (1)
bootstrap (1)
bpcp (1)
brainImageRdata (4)
brave (1)
breakpointRdata (41)
breastCancerMAINZ (63)
breastCancerMKI (1)
breastCancerNKI (69)
breastCancerTRANSBIG (53)
breastcancertransbig (0)
breastCancerUNT (44)
breastCancerUPP (51)
breastCancerVDX (90)
brew (11)
brgedata (31)
brglm (1)
brglm2 (0)
bridgesampling (1)
brio (1)
brms (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
bronchialIL13 (15)
broom (4)
broom.helpers (1)
broom.mixed (1)
bs4Dash (1)
BSgenome (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (1)
bslib (5)
bsplus (1)
bsseqData (57)
bumphunter (1)
butcher (1)
bvls (1)

C

C50 (1)
cache (1)
cachem (1)
Cairo (1)
callr (13)
CAMERA (1)
campsismod (1)
cancerdata (25)
car (3)
carData (1)
CardinalWorkflows (32)
caret (3)
castor (1)
Category (1)
caTools (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (54)
CCl4 (51)
ccTutorial (15)
celarefData (21)
celldex (1941)
CellMapperData (20)
cellranger (1)
cem (1)
ceu1kg (2)
ceu1kgv (2)
ceuhm3 (2)
cgdsr (0)
cgdv17 (3)
CGHbase (1)
cghMCR (0)
ChAMP (1)
ChAMPdata (561)
changepoint (1)
charmData (1)
checkmate (1)
cheung2010 (1)
ChIC.data (36)
chimera (0)
ChimpHumanBrainData (16)
ChIPComp (0)
chipenrich (0)
chipenrich.data (73)
ChIPexoQualExample (23)
ChIPQC (0)
ChIPseeker (1)
chipseq (0)
chipseqDBData (29)
ChIPseqR (0)
ChIPsim (0)
ChIPXpressData (30)
chopsticks (0)
chroGPS (0)
chromDraw (0)
ChromHeatMap (0)
chromstaRData (66)
chron (1)
circlesize (0)
circlize (1)
cisPath (0)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (5)
classInt (2)
cleanUpdTSeq (0)
cleaver (0)
cli (6)
clinfun (0)
clinPK (1)
clippda (0)
clipper (0)
clipr (6)
CLL (223)
CLLmethylation (17)
clock (1)
Clomial (0)
Clonality (0)
clonotypeR (0)
clst (0)
clstutils (0)
clue (3)
CluMSIDdata (29)
cluster (5)
clusterCrit (1)
clustermq (1)
clusterprofielr (1)
clusterProfiler (1)
ClusterR (1)
clusterStab (0)
clusthaplo (1)
clustifyrdatahub (24)
CMA (0)
cMap2data (36)
cmdstanr (1)
cmprsk (1)
cn.farms (0)
cn.mops (0)
CNAnorm (0)
CNEr (0)
CNORdt (0)
CNORfeeder (0)
CNORfuzzy (0)
CNORode (0)
CNPBayes (0)
CNTools (0)
cnvGSA (0)
cnvGSAdata (18)
cnvgsadata (0)
CNVPanelizer (0)
CNVrd2 (0)
CNVtools (0)
cobalt (1)
cobindR (0)
CoCiteStats (0)
coda (1)
codelink (0)
codetools (5)
CODEX (0)
CoGAPS (0)
cogena (0)
coGPS (0)
COHCAP (0)
COHCAPanno (38)
coin (1)
collapse (1)
collections (1)
coloc (3)
colonCA (27)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (2)
colorspace (5)
colourpicker (1)
colourvalues (1)
coMET (0)
commentr (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (12)
COMPASS (0)
compcodeR (0)
CompGO (0)
ComplexHeatmap (3)
compositions (1)
CompQuadForm (1)
CONFESSdata (20)
config (1)
conflicted (2)
ConnectivityMap (21)
connectwidgets (1)
conquer (1)
ConsensusClusterPlus (0)
consort (1)
conumee (0)
convert (0)
copa (0)
COPDSexualDimorphism.data (40)
copula (1)
CopyhelpeR (57)
CopyNeutralIMA (18)
copynumber (0)
CopyNumber450k (0)
CopyNumber450kData (1)
CopywriteR (0)
CoRegNet (0)
Cormotif (0)
CorMut (0)
coRNAi (0)
coro (1)
corpcor (1)
CORREP (0)
corrplot (1)
corrr (1)
COSMIC.67 (38)
cosmiq (0)
cosmosR (0)
COSNet (0)
covr (9)
cowplot (1)
cpp11 (5)
cpvSNP (0)
cqn (0)
crayon (7)
CRCL18 (11)
creatr (1)
credentials (1)
CRImage (0)
crisprScoreData (62)
crlmm (0)
crosstalk (10)
crrri (1)
crrry (1)
crul (1)
csaw (0)
CSSP (0)
csv (1)
ctc (0)
cubature (1)
cubelyr (1)
Cubist (1)
cummeRbund (1)
curatedAdipoArray (16)
curatedAdipoChIP (17)
curatedAdipoRNA (15)
curatedBladderData (25)
curatedBreastData (30)
curatedCRCData (20)
curatedMetagenomicData (232)
curatedOvarianData (48)
curatedTBData (15)
curatedTCGAData (207)
curl (11)
customProDB (0)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (1)
cycle (0)
cyclocomp (1)
cytofkit (0)
cytolib (1)

D

d3r (0)
dada2 (1)
dae (1)
dagLogo (0)
daMA (0)
DAPAR (0)
DAPARdata (99)
DART (0)
DASiR (0)
data.table (10)
data.tree (1)
datamods (1)
datapipeline (1)
datawizard (1)
DAVIDQuery (0)
davidTiling (18)
dbarts (1)
DBChIP (0)
DBI (4)
DBItest (1)
dbplyr (3)
dbscan (1)
ddalpha (1)
ddCt (0)
ddgraph (0)
DECIPHER (0)
DeconRNASeq (1)
decoupleR (1)
DEDS (0)
deepSNV (0)
DEGraph (0)
DEGseq (1)
DelayedArray (1)
DelayedMatrixStats (2)
deldir (1)
dendextend (2)
dendsort (1)
densityClust (1)
DEoptim (1)
DEoptimR (1)
depmap (313)
derfinder (1)
derfinderData (42)
derfinderHelper (1)
Deriv (1)
desc (11)
DescTools (1)
DESeq (0)
DESeq2 (1)
deSolve (1)
DeSousa2013 (16)
destiny (0)
devtools (11)
DExMAdata (26)
DEXSeq (1)
dexus (0)
dfidx (1)
DFP (0)
DHARMa (1)
DiagrammeR (1)
dials (2)
DiceDesign (1)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (1)
DiffBind (0)
diffGeneAnalysis (0)
diffHic (0)
DiffLogo (0)
diffloopdata (21)
diffobj (1)
digest (13)
diggit (0)
diggitdata (21)
dimRed (1)
directlabels (1)
DirichletMultinomial (1)
disk.frame (0)
distill (1)
distr (1)
distributional (2)
dittodb (1)
dittoSeq (1)
dks (0)
DLBCL (91)
dlstats (1)
dm (1)
DmelSGI (16)
DMRcaller (0)
DMRcate (1)
DMRcatedata (202)
DMRforPairs (0)
DNABarcodes (0)
DNAcopy (1)
DNAZooData (0)
DO.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (2)
domainsignatures (0)
doMC (1)
DonaPLLP2013 (13)
donapllp2013 (0)
doParallel (6)
DOQTL (0)
doRNG (1)
dorothea (356)
DOSE (1)
DoseFinding (1)
dotCall64 (1)
downlit (1)
downloader (1)
dparser (1)
dplyr (9)
dqrng (2)
drake (1)
drc (1)
dream (0)
DREAM4 (13)
dressCheck (13)
DriverNet (0)
DropletTestFiles (128)
DropletUtils (1)
DRR (1)
DrugVsDisease (0)
DrugVsDiseasedata (34)
dspNgs (1)
dsQTL (2)
DSS (0)
DT (14)
DTA (0)
dtplyr (3)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (0)
duckdb (1)
DuoClustering2018 (55)
DupChecker (0)
dupRadar (1)
DvDdata (12)
dyebias (0)
dyebiasexamples (20)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1)

E

e1071 (3)
earth (1)
easierData (67)
EasyqpcR (0)
EatonEtAlChIPseq (14)
eatonetalchipseq (0)
EBarrays (0)
EBcoexpress (0)
EBImage (1)
EBSeq (0)
EBSeqHMM (0)
ecoliLeucine (28)
ecolitk (0)
ECOSolveR (1)
EDASeq (0)
EDDA (0)
edge (0)
edgeR (3)
egg (2)
EGSEAdata (149)
eha (1)
eisa (0)
ELBOW (0)
ellipse (1)
ellipsis (4)
ELMER (0)
ELMER.data (219)
emayili (1)
embed (1)
emdbook (1)
EMDomics (0)
emmeans (3)
EMMREML (1)
emtdata (27)
enc (1)
ENCODEFig4Band4D (1)
encoDnaseI (2)
encodnasei (0)
EnhancedVolcano (1)
enhancedvolcano (1)
EnrichedHeatmap (0)
enrichplot (1)
enrichR (1)
ensembldb (1)
ensemblVEP (0)
ENVISIONQuery (0)
Epi (1)
epigenomix (0)
EpiMix.data (11)
epimutacionsData (27)
epiR (1)
epitools (1)
erccdashboard (0)
ergm (1)
erma (0)
ESNSTCC (0)
esquisse (1)
estimability (3)
estrogen (83)
etec16s (18)
eudysbiome (0)
evaluate (14)
evd (1)
ewceData (89)
Exact (1)
exactRankTests (1)
ExiMiR (0)
exomeCopy (0)
ExomeDepth (1)
explorase (0)
ExploreModelMatrix (1)
expm (1)
ExpressionView (0)
expss (1)
extraDistr (2)
extrafont (1)
extrafontdb (1)
extraTrees (1)

F

faahKO (212)
fabia (0)
fabiaData (14)
facopy.annot (1)
facsDorit (5)
factDesign (0)
FactoMineR (1)
fansi (9)
FANTOM3and4CAGE (23)
farms (0)
farver (3)
fastcluster (1)
fastDummies (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (1)
fastmap (1)
fastmatch (1)
fastseg (0)
fasttime (0)
fBasics (1)
fCI (0)
fda (3)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (1)
fdrame (0)
fds (2)
FEM (0)
ff (7)
ffpe (0)
ffpeExampleData (19)
FGNet (0)
fgsea (1)
fibroEset (49)
FieldEffectCrc (17)
fields (1)
filehash (0)
filelock (2)
filesstrings (0)
finalfit (1)
FindMyFriends (0)
findpython (1)
FIs (47)
FISHalyseR (0)
fission (236)
fit.models (1)
fitdistrplus (1)
fixest (1)
flagme (0)
flashClust (1)
Fletcher2013a (32)
Fletcher2013b (29)
flexclust (1)
flexdashboard (1)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flextable (3)
flipflop (0)
flowBeads (0)
flowBin (0)
flowcatchR (0)
flowCHIC (0)
flowCL (0)
flowClean (0)
flowClust (0)
flowCore (0)
flowCyBar (0)
flowDensity (0)
flowFit (0)
flowFitExampleData (2)
flowFP (0)
flowMap (0)
flowMatch (0)
flowMeans (0)
flowMerge (0)
flowPeaks (0)
flowPloidyData (26)
flowPlots (0)
flowQB (0)
flowQBData (1)
FlowRepositoryR (0)
FlowSOM (0)
FlowSorted.Blood.450k (245)
FlowSorted.Blood.EPIC (142)
FlowSorted.CordBlood.450k (31)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (41)
FlowSorted.CordBloodNorway.450k (19)
FlowSorted.DLPFC.450k (89)
flowStats (0)
flowTrans (0)
flowType (0)
flowUtils (0)
flowViz (0)
flowVS (1)
flowWorkspace (0)
flowWorkspaceData (113)
fmcsR (0)
fmsb (1)
FNN (1)
focalCall (0)
foghorn (1)
fontawesome (3)
forcats (4)
foreach (5)
forecast (1)
foreign (3)
forestplot (1)
fork (1)
formatR (5)
formatters (1)
Formula (1)
formula.tools (1)
forrester.metadata (1)
FourCSeq (0)
fourDNData (0)
fpc (1)
fracdiff (1)
FRASER (1)
fresh (2)
FRGEpistasis (0)
frma (0)
frmaExampleData (23)
frmaTools (0)
fs (12)
fstcore (1)
fucci (0)
FunciSNP (0)
FunciSNP.data (2)
furrowSeg (13)
furrr (3)
future (4)
future.apply (3)
future.callr (1)
fuzzyjoin (1)

G

g3viz (0)
GA (1)
gaga (0)
gage (0)
gageData (306)
gaggle (0)
gaia (0)
gam (1)
gamlss (1)
gamlss.dist (1)
gamm4 (1)
gap (1)
gargle (3)
gaschYHS (14)
gaston (1)
gatingMLData (21)
gaucho (0)
gbm (1)
gcatest (0)
gclus (1)
gCMAP (0)
gCMAPWeb (0)
gcrma (1)
gcspikelite (41)
gdata (1)
gdsfmt (1)
gdtools (2)
gee (1)
geecc (0)
geepack (1)
geigen (1)
gemma.R (1)
gemtc (1)
GenABEL (2)
GenABEL.data (2)
genArise (0)
GENE.E (0)
GeneAnswers (0)
GeneBreak (0)
GeneExpressionSignature (0)
genefilter (1)
genefu (1)
geneLenDataBase (1427)
genelendatabase (1)
GeneMeta (0)
GeneNetworkBuilder (0)
GeneOverlap (0)
geneplotter (1)
geneRecommender (0)
GeneRegionScan (0)
generics (4)
geneRxCluster (0)
GeneSelectMMD (0)
GeneSelector (0)
GENESIS (1)
geNetClassifier (0)
GeneticsDesign (0)
GeneticsPed (1)
GENIE3 (1)
genoCN (0)
genomationData (53)
GenomeGraphs (1)
GenomeInfoDb (5)
GenomeInfoDbData (2)
genomeIntervals (0)
GenomicAlignments (1)
GenomicDistributionsData (42)
GenomicFeatures (3)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (1)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (1)
GenomicFiles (1)
GenomicRanges (1)
GenomicTuples (0)
Genominator (0)
genoset (1)
genotypeeval (0)
GenoView (0)
GenSA (0)
GEOmetadb (0)
geometries (0)
geometry (1)
GeomxTools (1)
GEOquery (1)
geoR (1)
geosphere (2)
GEOsubmission (0)
gert (3)
gespeR (0)
GetoptLong (1)
gettz (1)
GeuvadisTranscriptExpr (30)
geuvPack (2)
geuvStore (1)
geuvStore2 (2)
GEWIST (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (1)
gganimate (1)
GGBase (0)
ggbeeswarm (1)
ggbio (1)
ggbreak (0)
ggcorrplot (1)
ggdag (1)
GGdata (5)
ggdendro (2)
ggdist (1)
ggeasy (0)
ggeffects (1)
ggExtra (1)
ggforce (1)
ggfortify (1)
ggfun (2)
ggh4x (0)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggm (1)
ggnewscale (2)
ggplot2 (6)
ggplotify (1)
ggPMX (1)
ggpointdensity (2)
ggpubr (2)
ggRandomForests (1)
ggraph (1)
ggrastr (1)
ggrepel (3)
ggridges (2)
ggsci (1)
ggseqlogo (2)
ggsignif (1)
ggstance (1)
ggstatsplot (1)
ggtext (1)
ggthemes (2)
ggtree (3)
ggtut (1)
ggVennDiagram (0)
gh (10)
ghql (1)
GIGSEAdata (11)
git2r (8)
gitcreds (3)
GLAD (1)
gld (1)
glmmADMB (1)
glmmTMB (1)
glmnet (2)
glmnetUtils (1)
GlobalAncova (1)
GlobalOptions (1)
globals (4)
globaltest (1)
glpkAPI (1)
glue (5)
gMCP (1)
GMD (1)
gmm (1)
gmodels (1)
gmp (3)
gnm (1)
GO.db (1)
goftest (1)
GOFunction (0)
golem (1)
golubEsets (238)
googledrive (1)
googlesheets4 (3)
GOSemSim (1)
goseq (1)
GOstats (1)
gower (2)
gpaExample (18)
GPArotation (1)
GPfit (1)
gplots (1)
graph (1)
graphite (0)
graphlayouts (1)
graphql (1)
grf (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridtext (1)
grndata (35)
GSBenchMark (20)
gscounts (1)
gsDesign (1)
GSE103322 (28)
GSE13015 (26)
GSE159526 (11)
GSE62944 (46)
GSEABase (0)
gskb (5)
gsl (1)
gsmoothr (2)
gsrc (1)
gss (1)
GSVA (1)
GSVAdata (484)
gsvadata (0)
gt (1)
gtable (3)
gtools (4)
gtsummary (1)
gtx (1)
Gviz (1)
GWASdata (59)
GWASExactHW (2)
gwasrapidd (1)
GWASTools (1)
gWidgets2tcltk (1)

H

h2o (1)
h5vcData (73)
HandTill2001 (1)
hapmap100khind (14)
hapmap100kxba (30)
hapmap500knsp (14)
hapmap500ksty (14)
hapmapsnp5 (24)
hapmapsnp6 (32)
harbChIP (19)
hardhat (1)
HarmanData (23)
HarmonizedTCGAData (19)
haven (4)
HCAData (58)
HD2013SGI (21)
HDCytoData (134)
HDF5Array (3)
hdf5r (1)
HDInterval (2)
hdrcde (2)
healthyControlsPresenceChecker (9)
healthyFlowData (19)
heatmaply (4)
HEEBOdata (19)
heemod (0)
HelloRangesData (32)
here (1)
hexbin (1)
hgu133abarcodevecs (12)
hgu133afrmavecs (1)
hgu133plus2.db (1)
hgu133plus2barcodevecs (12)
hgu133plus2CellScore (18)
hgu133plus2frmavecs (1)
hgu2beta7 (12)
HiCBricks (1)
HiCDataHumanIMR90 (25)
HiCDataLymphoblast (19)
HiContactsData (26)
hierfstat (1)
highlight (1)
HighlyReplicatedRNASeq (13)
highr (11)
Hiiragi2013 (92)
HIVcDNAvantWout03 (13)
Hmisc (2)
HMP16SData (42)
HMP2Data (25)
hms (4)
hmyriB36 (2)
Homo.sapiens (1)
HSMMSinglecel1 (1)
HSMMSingleCell (2237)
htmlTable (2)
htmltools (12)
htmlwidgets (11)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (1)
httpuv (5)
httr (13)
httr2 (1)
HumanAffyData (22)
humanStemCell (74)
hunspell (1)
huxtable (1)
hwriter (1)

I

ica (1)
idr (1)
ids (1)
igraph (3)
IHW (1)
IHWpaper (16)
Illumina450ProbeVariants.db (498)
IlluminaDataTestFiles (54)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (1)
illuminaio (1)
imcdatasets (35)
imcRtools (1)
iml (1)
impute (1)
ind1KG (1)
infer (3)
infercnv (1)
influenceR (1)
ini (1)
INLA (1)
inline (1)
insight (1)
intansv (0)
interactiveDisplayBase (1)
interp (1)
inum (1)
iontreeData (1)
ipaddress (1)
ipred (1)
IRanges (3)
IRkernel (1)
irlba (2)
irr (1)
Iso (1)
isoband (4)
isva (2)
ISwR (1)
ITALICSData (34)
iterators (5)
itertools (1)
ivpack (1)
Iyer517 (14)

J

JADE (1)
janitor (1)
JASPAR2014 (47)
JASPAR2016 (119)
JavaGD (1)
JctSeqData (3)
jctseqdata (0)
JM (1)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (1)
jquerylib (1)
jsonlite (13)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (1)

K

kableExtra (1)
KaryoploteR (0)
karyoploteR (1)
KEGG.db (1)
KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (36)
KEGGdzPathwaysGEO (170)
KEGGgraph (1)
keggorthology (0)
KEGGprofile (1)
KEGGREST (1)
keras (1)
kernlab (1)
KernSmooth (1)
keyring (1)
kidpack (17)
kknn (1)
klaR (1)
km.ci (1)
KMsurv (1)
knitr (13)
knockoff (1)
KOdata (37)
kohonen (1)
kpmt (1)
ks (1)
kSamples (1)

L

labdsv (1)
labeling (1)
labelled (1)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
languageserver (1)
lares (1)
later (9)
latex2exp (1)
lattice (3)
latticeExtra (2)
lava (2)
lavaan (2)
lazyeval (5)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
leaflet (0)
leaps (1)
learnr (1)
leeBamViews (48)
leiden (2)
leidenbase (2)
lemon (1)
leukemiasEset (105)
lfe (0)
lgr (1)
lhs (2)
liana (1)
libcoin (1)
LiblineaR (2)
LiebermanAidenHiC2009 (14)
lifecycle (6)
lightgbm (1)
limma (3)
limmaGUI (1)
lintr (2)
listenv (2)
ListerEtAlBSseq (13)
lixoftConnectors (1)
lixoftConnectors.1 (1)
lixoftConnectors.2 (1)
lm.beta (1)
lme4 (3)
lmerTest (1)
lmom (1)
lmomco (1)
lmtest (1)
lobstr (1)
locfit (4)
log4r (1)
logger (0)
logistf (1)
loo (1)
lotri (1)
lpSolve (1)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1)
LRcellTypeMarkers (22)
lsa (2)
lsei (1)
lubridate (3)
lumi (1)
lumiBarnes (36)
LungCancerACvsSCCGEO (29)
LungCancerLines (26)
lungExpression (38)
lydata (27)
lymphoma (1)

M

M3DExampleData (47)
macrophage (139)
MACSdata (20)
MACSr (1)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (1)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (1)
magic (1)
magick (1)
magrittr (7)
maic (1)
mailR (1)
MAIT (0)
makecdfenv (0)
MALDIquant (1)
mammaPrintData (15)
manipulateWidget (1)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mAPKLData (19)
mapproj (1)
maps (1)
maptools (3)
maptree (1)
maqcExpression4plex (32)
MAQCsubset (18)
MAQCsubsetAFX (3)
MAQCsubsetILM (12)
Markdown (1)
markdown (11)
marray (1)
maSigPro (1)
MASS (11)
MassSpecWavelet (1)
Matching (1)
MatchIt (1)
mathjaxr (3)
Matrix (6)
matrixcalc (1)
MatrixGenerics (1)
MatrixModels (3)
matrixStats (4)
mboost (1)
mc2d (1)
mclogit (1)
mclust (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (1)
MCPcounter (1)
mCSEAdata (49)
mcsurvdata (17)
mda (1)
MEALData (1)
MEDIPSData (35)
MEEBOdata (21)
memisc (1)
memoise (7)
MerfishData (7)
MeSHDbi (1)
meta (1)
Metab (0)
metafor (1)
metagenomeSeq (1)
MetaGxBreast (26)
MetaGxOvarian (20)
MetaGxPancreas (22)
metaMA (2)
metaMS (0)
metaMSdata (41)
metap (3)
MetaScope (1)
methyAnalysis (0)
MethylAidData (20)
methylclockData (76)
MethylMix (0)
MethylSeqData (15)
methylumi (1)
methyvimData (2)
mets (1)
Mfuzz (1)
mgcv (5)
mice (3)
microbenchmark (1)
MicrobiomeBenchmarkData (5)
microbiomeDataSets (66)
microRNAome (16)
MIGSAdata (23)
mime (11)
minet (0)
minfi (1)
minfiData (347)
minfiDataEPIC (69)
minionSummaryData (28)
miniUI (1)
minpack.lm (1)
minqa (3)
miRcompData (28)
miRNATarget (19)
mitml (1)
mitoODEdata (2)
mixOmics (1)
mixsqp (3)
mixtools (1)
mlbench (1)
mlegp (1)
mlr (1)
mlr3 (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
MMAPPR2data (28)
MMDiffBamSubset (19)
mmrm (1)
mnormt (3)
MNP (1)
mockr (0)
modeldata (2)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (3)
modeltools (1)
MOFA2 (1)
MOFAdata (76)
morpheus (1)
mosaicsExample (69)
motifmatchr (1)
mouse4302barcodevecs (11)
mouse4302frmavecs (1)
MouseGastrulationData (112)
MouseThymusAgeing (50)
mrgda (1)
mrggsave (0)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
MSBdata (1)
MsCoreUtils (1)
msd16s (22)
msdata (448)
MsFeatures (1)
msigdb (240)
msigdbr (1)
msm (1)
MSMB (62)
MSnbase (1)
msPurityData (40)
msqc1 (12)
MSstatsBioData (2)
MSstatsQC (0)
mstate (1)
mtbls2 (52)
MTseekerData (1)
MUGAExampleData (13)
muhaz (1)
Mulder2012 (1)
multcomp (1)
MultiAssayExperiment (1)
multidplyr (1)
multinma (1)
multtest (1)
munsell (1)
muscData (98)
muscle (1)
MutationalPatterns (1)
mutoss (2)
mvnfast (0)
mvoutData (17)
mvtnorm (1)
mygene (0)
mzID (1)
mzR (1)

N

n1qn1 (1)
nabor (1)
NADA (2)
naniar (0)
NanoporeRNASeq (53)
NanoStringNCTools (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
nanotubes (20)
narray (1)
nasapower (1)
naturalsort (1)
ncdf4 (1)
ncdf4.1 (1)
ncdfFlow (0)
NCIgraphData (13)
ndexr (1)
ndjson (1)
NestLink (15)
NetActivityData (11)
netDx.examples (1)
network (1)
NeuralNetTools (1)
Neve2006 (14)
neve2006 (0)
NGScopyData (31)
nhanesA (1)
nleqslv (1)
nlme (10)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nloptr (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (2)
NMproject (1)
nnet (3)
nnls (1)
NOISeq (1)
NonCompart (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
npde (1)
npsurv (1)
nullrangesData (62)
numDeriv (1)
NxtIRFdata (56)

O

ObMiTi (14)
oct4 (11)
octad.db (10)
odbc (1)
officedown (1)
officer (3)
oligo (1)
oligoClasses (1)
OmicCircos (0)
OMICsPCAdata (28)
OnassisJavaLibs (15)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oneChannelGUI (0)
ontologyIndex (4)
openssl (13)
openxlsx (3)
operator.tools (1)
optextras (1)
optimalFlowData (24)
optimx (1)
optmatch (1)
optparse (6)
OrderedList (0)
ordinal (1)
org.Dm.eg.db (1)
org.Hs.eg.db (1)
org.Mm.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (1)
org.Ss.eg.db (1)
OrganismDbi (1)
orientlib (1)
osqp (1)
overlapping (1)

P

PAA (0)
packrat (2)
padr (1)
pagedown (1)
pak (1)
paletteer (1)
palmerpenguins (1)
pamr (1)
pander (1)
paradox (1)
parallelly (3)
parameters (1)
ParamHelpers (1)
parathyroid (4)
parathyroidSE (206)
parsedate (1)
parsnip (3)
partitions (1)
party (1)
partykit (1)
pasilla (853)
pasillaBamSubset (260)
PasillaTranscriptExpr (36)
patchwork (3)
pathifier (0)
PathNetData (19)
pathprintGEOData (2)
paws (1)
paws.analytics (1)
paws.application.integration (2)
paws.common (3)
paws.compute (2)
paws.cost.management (1)
paws.customer.engagement (1)
paws.database (1)
paws.developer.tools (1)
paws.end.user.computing (1)
paws.machine.learning (1)
paws.management (1)
paws.networking (1)
paws.security.identity (1)
paws.storage (1)
pbapply (3)
PBIR (1)
pbivnorm (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (2)
pbmcapply (1)
pcaExplorer (1)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (3)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (3)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (2)
pcaMethods (1)
pcaPP (2)
PCHiCdata (27)
pcxnData (23)
pd.atdschip.tiling (14)
pdftools (1)
pdist (1)
pegas (1)
pepDat (23)
PepsNMRData (28)
Peptides (1)
performance (1)
PerformanceAnalytics (1)
perm (2)
permute (1)
PFAM.db (1)
PFIM (0)
PGPC (1)
PGSEA (0)
phastCons100way.UCSC.hg19 (1)
pheatmap (1)
philentropy (1)
PhosR (1)
phyclust (1)
PhyloProfileData (12)
phyloseq (1)
pillar (10)
pingr (1)
pins (1)
pkgbuild (11)
pkgcache (1)
pkgconfig (2)
pkgdepends (1)
pkgdown (2)
pkgKitten (0)
pkgload (11)
pkgmaker (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
plasFIA (16)
plier (0)
plm (1)
plogr (1)
plotgardener (1)
plotgardenerData (46)
plotly (4)
plotmo (1)
plotrix (1)
pls (1)
plumber (1)
plyr (5)
pmforest (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (2)
pointblank (1)
polspline (1)
polyclip (2)
polyester (1)
polynom (1)
PolynomF (1)
polysat (1)
pool (1)
poppr (1)
posterior (3)
poweRlaw (2)
ppiData (15)
pracma (2)
praise (1)
prebsdata (18)
PreciseSums (1)
preciseTADhub (11)
precommit (1)
PREDAsampledata (43)
preprocessCore (1)
prettydoc (1)
prettyunits (2)
prismatic (1)
pROC (1)
processCore (1)
processx (13)
ProData (17)
prodlim (1)
proffer (0)
profile (1)
profileModel (1)
progress (1)
progressr (2)
PROJ (0)
proj (0)
proj4 (1)
projpred (1)
pRolocdata (191)
promises (9)
prostateCancerCamcap (15)
prostateCancerGrasso (12)
prostateCancerStockholm (13)
prostateCancerTaylor (12)
prostateCancerVarambally (12)
ProtGenerics (1)
protolite (1)
protr (0)
proxy (1)
PRROC (2)
pryr (2)
ps (13)
PSCBS (2)
pscl (1)
PsNR (1)
pspline (1)
psych (1)
ptairData (22)
PtH2O2lipids (24)
Publish (1)
pumadata (21)
PureCN (1)
purrr (11)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (23)
PWMEnrich.Hsapiens.background (26)
PWMEnrich.Mmusculus.background (19)
pwr (1)
pwrEWAS.data (41)

Q

qap (3)
qcNvs (1)
QDNAseq.hg19 (97)
QDNAseq.mm10 (49)
qlcMatrix (2)
qpcR (1)
qpdf (1)
qPLEXdata (26)
qqconf (1)
qs (1)
qtl (1)
qtl2 (1)
quadprog (1)
quantmod (0)
quantreg (1)
quantsmooth (1)
quarto (1)
QUBICdata (35)
questionr (1)
qvalue (1)
qvcalc (1)

R

R.cache (1)
R.devices (2)
R.filesets (2)
R.huge (2)
R.methodsS3 (1)
R.oo (1)
R.rsp (1)
R.utils (3)
r2d3 (1)
R6 (6)
ragg (3)
rainbow (2)
RamiGO (0)
randomcoloR (2)
RandomFields (1)
RandomFieldsUtils (1)
randomForest (1)
randomForestSRC (1)
randtoolbox (1)
ranger (1)
RankProd (0)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
RApiSerialize (1)
rappdirs (1)
rapportools (1)
rARPACK (2)
raster (1)
RAthena (2)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (1)
rcdk (2)
rcdklibs (2)
rcellminerData (54)
Rcgmin (1)
Rchoice (0)
RCircos (1)
RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp (42)
RClickhouse (1)
rclipboard (1)
rcmdcheck (8)
RColorBrewer (3)
Rcpp (8)
RcppAnnoy (4)
RcppArmadillo (5)
RcppCCTZ (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (3)
RcppGSL (1)
RcppHNSW (2)
RcppNumerical (0)
RcppParallel (3)
RcppProgress (1)
RcppTOML (2)
RcppZiggurat (2)
Rcsdp (1)
RCurl (5)
Rd2roxygen (1)
RDAVIDWebService (0)
Rdpack (1)
Rdsdp (1)
reactable (1)
reactlog (1)
reactome.db (1)
ReactomeGSA.data (60)
readODS (0)
readr (9)
readxl (4)
recipes (3)
reda (1)
RefManageR (1)
registry (1)
RegParallel (64)
reldist (2)
rematch (1)
rematch2 (1)
remotes (9)
renv (4)
ReportingTools (1)
repr (1)
reprex (3)
repurrrsive (1)
reshape (1)
reshape2 (1)
restfulr (2)
restfulSEData (21)
reticulate (4)
review (0)
rex (9)
Rfast (3)
rfcdmin (2)
RforProteomics (135)
rgeos (2)
rgl (1)
Rglpk (1)
RGMQLlib (23)
Rgraphviz (1)
rhdf5 (1)
rhdf5filters (1)
Rhdf5lib (1)
rheumaticConditionWOLLBOLD (13)
RhpcBLASctl (1)
Rhtslib (1)
rhub (1)
RIdeogram (1)
rio (1)
RIPSeekerData (5)
riskRegression (1)
RITANdata (33)
RItools (1)
rj (1)
rj.gd (1)
rjags (1)
rJava (1)
rjson (1)
RJSONIO (2)
rlang (7)
rlemon (0)
RLHub (39)
rly (1)
RMariaDB (1)
rmarkdown (6)
RMassBankData (23)
rmdformats (1)
rmio (1)
Rmpfr (2)
rms (1)
rmutil (1)
RMySQL (1)
RNAinteractMAPK (13)
rnainteractmapk (0)
RNAmodR.Data (47)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (1)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (287)
RNASeqDataSubset (1)
RNASeqPower (1)
RNASeqRData (22)
RnaSeqSampleSizeData (71)
RnaSeqTutorial (2)
rnaturalearth (1)
RnBeads (1)
RnBeads.hg19 (111)
RnBeads.hg38 (92)
RnBeads.mm10 (73)
rnbeads.mm10 (0)
RnBeads.mm9 (59)
RnBeads.rn5 (13)
rngtools (1)
rngWELL (1)
robust (1)
robustbase (1)
RobustRankAggreg (1)
ROC (0)
ROCR (1)
RODBC (1)
rols (1)
Rook (1)
rootSolve (1)
roxygen2 (11)
rpact (1)
rpart (3)
rpart.plot (1)
RPostgres (2)
RPostgreSQL (1)
rprojroot (10)
RPushbullet (1)
Rqc (0)
rrBLUP (1)
RRBSdata (12)
rrcov (2)
rRDPData (23)
rsample (3)
Rsamtools (1)
rsbml (0)
rsconnect (3)
RSEIS (1)
RSiena (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (1)
Rsmlx.2 (1)
RSNNS (1)
Rsolnp (2)
RSpectra (3)
RSQLite (7)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (1)
rstan (2)
rstanarm (1)
rstantools (1)
rstatix (2)
rstpm2 (1)
rstudioapi (12)
Rsubread (1)
rsvd (2)
rsvg (1)
rtables (1)
RTCGA.clinical (294)
RTCGA.CNV (43)
RTCGA.methylation (47)
RTCGA.miRNASeq (83)
RTCGA.mRNA (164)
RTCGA.mutations (72)
RTCGA.PANCAN12 (40)
RTCGA.rnaseq (131)
RTCGA.RPPA (41)
RTCGAToolbox (0)
rticles (1)
rtkore (1)
rtracklayer (1)
Rtsne (1)
Rttf2pt1 (1)
RUnit (1)
Runuran (1)
ruv (1)
RUVnormalizeData (36)
RUVseq (1)
rvcheck (1)
RVenn (0)
rversions (10)
rvest (3)
rvg (1)
Rvmmin (1)
Rwave (1)
RWiener (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)

S

s2 (2)
S4Vectors (2)
saemix (1)
safetyexploreR (1)
sampleClassifierData (17)
samr (2)
sandwich (1)
sass (5)
SBGNview.data (68)
SC3 (1)
ScaledMatrix (1)
scales (5)
scam (1)
scanMiRData (23)
scATAC.Explorer (14)
SCATE (0)
SCATEData (30)
scater (1)
scattermore (3)
scatterpie (1)
scatterplot3d (1)
scico (1)
scidb (1)
SCLCBam (29)
scpdata (25)
scPipe (1)
scran (1)
scrime (2)
scRNAseq (1350)
scs (1)
scTHI.data (22)
sctransform (4)
scuttle (2)
SDMTools (1)
segmented (1)
selectr (1)
sendmailR (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
seq2pathway (0)
seq2pathway.data (31)
SeqArray (1)
seqc (19)
seqCNA.annot (36)
seqinr (1)
seqLogo (0)
seqminer (2)
SeqVarTools (1)
seriation (4)
serumStimulation (11)
servr (1)
sesameData (422)
sessioninfo (9)
sets (0)
Seurat (5)
SeuratObject (4)
seventyGeneData (15)
sf (1)
SFEData (30)
sfsmisc (1)
shadowtext (1)
shape (1)
shapes (1)
shapr (0)
shiny (5)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyalert (1)
shinyBS (4)
shinybusy (1)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (2)
shinyFeedback (0)
shinyfeedback (0)
shinyFiles (3)
shinyglide (0)
shinyhelper (2)
shinyjqui (1)
shinyjs (1)
shinyMethylData (24)
shinyMobile (1)
shinypanel (2)
shinySelect (1)
shinystan (1)
shinytest (1)
shinythemes (1)
shinyWidgets (5)
ShortRead (1)
sigaR (1)
siggenes (1)
Signac (3)
signatureSearchData (62)
sigPathway (0)
SimBenchData (18)
simpar (0)
simpIntLists (38)
simpleaffy (0)
Single.mTEC.Transcriptomes (12)
SingleCelLExperiment (1)
SingleCellExperiment (2)
SingleCellMultiModal (46)
singleCellTK (1)
SingleMoleculeFootprintingData (22)
SingleR (1)
sitmo (3)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (2)
skimr (1)
slackr (0)
slam (1)
slickR (1)
slider (2)
sm (1)
smoothHR (1)
SMVar (2)
sn (3)
sna (1)
SNAData (20)
snadata (0)
SNAGEEdata (28)
snakecase (1)
snow (2)
SnowballC (1)
snowfall (1)
SNPhoodData (16)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
SNPRelate (1)
snpStats (0)
soilDB (1)
SomatiCAData (10)
SomaticCancerAlterations (53)
sortable (1)
sourcetools (2)
sp (3)
spacetime (1)
spade (0)
spam (1)
spaMM (1)
sparklyr (2)
SPARQL (1)
SparseM (1)
sparsesvd (4)
spatial (1)
spatialDmelxsim (13)
spatialLIBD (120)
spatialreg (1)
spatstat (1)
spatstat.core (2)
spatstat.data (2)
spatstat.geom (2)
spatstat.random (2)
spatstat.sparse (2)
spatstat.utils (2)
spData (1)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (1)
SPIA (1)
SpikeIn (31)
SpikeInSubset (112)
splancs (1)
spliceR (0)
splines2 (1)
spls (1)
spqnData (22)
SQUAREM (1)
ssh (1)
SSPA (1)
stabledist (1)
stabs (1)
StanHeaders (1)
statmod (1)
statnet.common (1)
stemHypoxia (39)
STexampleData (58)
sticky (1)
stjudem (19)
storr (1)
strex (0)
stringdist (2)
stringfish (1)
stringi (10)
stringr (8)
strucchange (1)
styler (1)
subselect (1)
SummarizedExperiment (1)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
supraHex (0)
survcomp (1)
survival (5)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (1)
susieR (3)
sva (1)
svd (1)
svglite (2)
SVM2CRMdata (11)
svMisc (1)
svUnit (1)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
synapterdata (20)
sys (11)
systemfit (1)
systemfonts (1)
systemPipeRdata (211)

T

table1 (1)
tables (1)
TabulaMurisData (46)
TabulaMurisSenisData (59)
tarchetypes (1)
targets (1)
TargetScoreData (19)
TargetSearchData (27)
tartare (31)
TBX20BamSubset (38)
TCGAbiolinksGUI.data (2601)
TCGAcrcmiRNA (12)
TCGAcrcmRNA (14)
TCGAMethylation450k (36)
tcgaWGBSData.hg19 (4)
TCGAWorkflowData (97)
TeachingDemos (1)
templater (1)
tensorA (1)
tensorflow (2)
TENxBrainData (75)
TENxBUSData (29)
TENxPBMCData (412)
TENxVisiumData (69)
terra (1)
testthat (11)
textshaping (1)
tfautograph (1)
TFBSTools (0)
TFMPvalue (2)
tfrmt (1)
tfruns (2)
tgp (1)
TH.data (1)
threejs (1)
tibble (7)
tictoc (1)
tidybayes (0)
tidygraph (1)
tidymodels (1)
tidyposterior (1)
tidyr (7)
tidyselect (5)
tidytree (3)
tidyverse (2)
tidyvpc (1)
tikzDevice (0)
timechange (1)
timecoursedata (33)
timeDate (3)
timereg (1)
TimerQuant (11)
timeSeries (1)
tinesath1cdf (13)
tinesath1probe (12)
tinytest (0)
tinytex (5)
tissueTreg (29)
TitanCNA (0)
tkWidgets (1)
TMB (1)
TMExplorer (23)
tmvnsim (1)
tofsimsData (15)
topdownrdata (24)
topGO (0)
torch (0)
Tplyr (1)
tracee (1)
tradeSeq (1)
transformr (1)
tree (1)
treeio (3)
TreeSummarizedExperiment (1)
Trendy (0)
triebeard (1)
trimcluster (1)
truncdist (1)
truncnorm (2)
tseries (1)
tsne (1)
TSP (4)
TSSi (0)
ttdo (0)
tuberculosis (11)
tune (2)
tweeDEseqCountData (97)
tweenr (1)
twilight (0)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
tximport (1)
tximportData (715)
tzdb (1)

U

uatools (0)
ucminf (1)
umap (2)
units (2)
urca (1)
urltools (1)
usethis (9)
utf8 (7)
uuid (1)
uwot (5)

V

V8 (1)
VAM (1)
vaplot (1)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
VariantToolsData (13)
vaultr (1)
vcd (0)
vcr (1)
vctrs (12)
vdiffr (1)
VectraPolarisData (14)
vegan (1)
vegawidget (1)
venn (2)
VennDiagram (1)
VGAM (1)
vhydeg (1)
vioplot (1)
viridis (3)
viridisLite (5)
viridislite (1)
visdat (0)
visNetwork (1)
vpc (1)
vroom (3)
vsn (1)
vulcandata (18)

W

waiter (2)
waldo (1)
warp (1)
wateRmelon (0)
waveTilingData (2)
weaver (0)
webdriver (1)
WeberDivechaLCdata (7)
webfakes (1)
webmockr (1)
webshot (4)
WeightIt (1)
weights (1)
WES.1KG.WUGSC (36)
WGCNA (2)
WGSmapp (26)
whereami (1)
whisker (10)
widgetTools (1)
withr (7)
wk (2)
workflows (2)
workflowsets (1)
Wrench (1)
writexl (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xcms (1)
xcoredata (18)
xfun (14)
xgboost (2)
xgxr (1)
XhybCasneuf (12)
XLConnect (1)
xlsxjars (1)
XML (5)
xml2 (9)
xmlparsedata (1)
xopen (1)
xpose (1)
xslt (0)
xtable (1)
xts (1)
XVector (1)

Y

yaImpute (1)
yaml (13)
yardstick (2)
yeastCC (45)
yeastExpData (60)
yeastGSData (11)
yeastNagalakshmi (44)
yeastRNASeq (56)
ymlthis (1)
yri1kgv (2)
yriMulti (2)
yulab.utils (2)

Z

zCompositions (2)
zeallot (1)
zebrafishRNASeq (140)
zip (4)
zlibbioc (1)
zoo (3)