### R code from vignette source 'pvac.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: install (eval = FALSE) ################################################### ## if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE)) ## install.packages("BiocManager") ## BiocManager::install("pvac") ################################################### ### code chunk number 2: steps (eval = FALSE) ################################################### ## library(affy) ## abatch <- ReadAffy(celfile.path="/my/directory/celfiles") ################################################### ### code chunk number 3: steps (eval = FALSE) ################################################### ## myeset <- rma(abatch) ################################################### ### code chunk number 4: steps (eval = FALSE) ################################################### ## library(pvac) ## ft <- pvacFilter(abatch) ## myeset <- eset[ft$aset,] ################################################### ### code chunk number 5: