############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data sincell ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘sincell/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘sincell’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘sincell-vignette.Rnw’ using knitr Quitting from lines 137-139 [monocle_expression_matrix_filtering] (sincell-vignette.Rnw) Error: processing vignette 'sincell-vignette.Rnw' failed with diagnostics: there is no package called 'monocle' --- failed re-building ‘sincell-vignette.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘sincell-vignette.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted