############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data RVS ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘RVS/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘RVS’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘RVS.Rmd’ using rmarkdown 2024-05-21 16:19:41.206 R[73361:1892602647] XType: com.apple.fonts is not accessible. 2024-05-21 16:19:41.206 R[73361:1892602647] XType: XTFontStaticRegistry is enabled. Quitting from lines 385-388 [unnamed-chunk-24] (RVS.Rmd) Error: processing vignette 'RVS.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'VariantAnnotation' --- failed re-building ‘RVS.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘RVS.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted