############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R-beta-2024-04-15_r86425/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data GEOmetadb ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘GEOmetadb/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘GEOmetadb’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘GEOmetadb.Rmd’ using rmarkdown trying URL 'https://gbnci.cancer.gov/geo/GEOmetadb_demo.sqlite.gz' Quitting from lines at lines 89-98 [unnamed-chunk-3] (GEOmetadb.Rmd) Error: processing vignette 'GEOmetadb.Rmd' failed with diagnostics: cannot open URL 'https://gbnci.cancer.gov/geo/GEOmetadb_demo.sqlite.gz' --- failed re-building ‘GEOmetadb.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘GEOmetadb.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted