############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data iSEEhex ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘iSEEhex/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘iSEEhex’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘iSEEhex.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 65-79 [unnamed-chunk-4] (iSEEhex.Rmd) Error: processing vignette 'iSEEhex.Rmd' failed with diagnostics: failed to open file at '~/Library/Caches/gypsum/bucket/scRNAseq/legacy/2023-12-18/allen/other_data/list_contents.json.gz' --- failed re-building ‘iSEEhex.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘iSEEhex.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted