############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r Cepo -R && F:\biocbuild\bbs-3.20-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data Cepo ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'Cepo/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'Cepo': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'cepo.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 284-297 [gsea] (cepo.Rmd) Error: processing vignette 'cepo.Rmd' failed with diagnostics: unable to find an inherited method for function 'geneIds' for signature 'object = "list"' --- failed re-building 'cepo.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'cepo.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted