############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data TimiRGeN ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘TimiRGeN/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘TimiRGeN’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘TimiRGeN_tutorial.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines at lines 290-292 [wikiMatrix_Real] (TimiRGeN_tutorial.Rmd) Error: processing vignette 'TimiRGeN_tutorial.Rmd' failed with diagnostics: subscript contains invalid names --- failed re-building ‘TimiRGeN_tutorial.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘TimiRGeN_tutorial.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted