############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.17-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data signatureSearch ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘signatureSearch/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘signatureSearch’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘signatureSearch.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 379-384 [gess_cmap] (signatureSearch.Rmd) Error: processing vignette 'signatureSearch.Rmd' failed with diagnostics: file is not a database --- failed re-building ‘signatureSearch.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘signatureSearch.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted