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### Running command:
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###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data CNEr
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* checking for file ‘CNEr/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘CNEr’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* cleaning src
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘CNEr.Rmd’ using rmarkdown

Quitting from lines 223-235 [Bed] (CNEr.Rmd)
Error: processing vignette 'CNEr.Rmd' failed with diagnostics:
bad value
--- failed re-building ‘CNEr.Rmd’

--- re-building ‘PairwiseWholeGenomeAlignment.Rmd’ using rmarkdown
--- finished re-building ‘PairwiseWholeGenomeAlignment.Rmd’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘CNEr.Rmd’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted