############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r maEndToEnd -R && F:\biocbuild\bbs-3.16-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data maEndToEnd ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'maEndToEnd/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'maEndToEnd': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'MA-Workflow.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 256-257 (MA-Workflow.Rmd) Error: processing vignette 'MA-Workflow.Rmd' failed with diagnostics: 1: StartTag: invalid element name 2: Extra content at the end of the document --- failed re-building 'MA-Workflow.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'MA-Workflow.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted