############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data tidySingleCellExperiment ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘tidySingleCellExperiment/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘tidySingleCellExperiment’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to process help pages * building the PDF package manual * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘introduction.Rmd’ using knitr Quitting from lines 61-74 (introduction.Rmd) Error: processing vignette 'introduction.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'scater' --- failed re-building ‘introduction.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘introduction.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted