############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data stageR ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘stageR/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘stageR’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘stageRVignette.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 44-45 (stageRVignette.Rmd) Error: processing vignette 'stageRVignette.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'edgeR' --- failed re-building ‘stageRVignette.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘stageRVignette.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted