############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r epimutacions -R && F:\biocbuild\bbs-3.16-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data epimutacions ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'epimutacions/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'epimutacions': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'epimutacions.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 449-452 (epimutacions.Rmd) Error: processing vignette 'epimutacions.Rmd' failed with diagnostics: 'case_samples' must be of class 'GenomicRatioSet' --- failed re-building 'epimutacions.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'epimutacions.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted