############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data TraRe ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘TraRe/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘TraRe’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘TraRe.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 137-187 (TraRe.Rmd) Error: processing vignette 'TraRe.Rmd' failed with diagnostics: unused argument (lognorm_est_counts = SeObject) --- failed re-building ‘TraRe.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘TraRe.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted