############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data SAIGEgds ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘SAIGEgds/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘SAIGEgds’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘SAIGEgds.Rmd’ using rmarkdown Loading required package: gdsfmt Loading required package: Rcpp Quitting from lines 68-76 (SAIGEgds.Rmd) Error: processing vignette 'SAIGEgds.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'SNPRelate' --- failed re-building ‘SAIGEgds.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SAIGEgds.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted