############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data ChAMP ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘ChAMP/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘ChAMP’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes ----------------------------------- ERROR: dependencies ‘minfi’, ‘DMRcate’, ‘IlluminaHumanMethylationEPICmanifest’, ‘sva’, ‘IlluminaHumanMethylation450kmanifest’, ‘IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19’, ‘DNAcopy’, ‘preprocessCore’, ‘impute’, ‘wateRmelon’, ‘goseq’, ‘missMethyl’, ‘bumphunter’ are not available for package ‘ChAMP’ * removing ‘/private/tmp/RtmpOSSrQz/Rinst674165d16ec2/ChAMP’ ----------------------------------- ERROR: package installation failed