############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data AnnotationDbi ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘AnnotationDbi/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘AnnotationDbi’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘AnnotationDbi.Rnw’ using knitr --- finished re-building ‘AnnotationDbi.Rnw’ --- re-building ‘IntroToAnnotationPackages.Rnw’ using knitr Quitting from lines 327-336 (IntroToAnnotationPackages.Rnw) Error: processing vignette 'IntroToAnnotationPackages.Rnw' failed with diagnostics: there is no package called 'TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene' --- failed re-building ‘IntroToAnnotationPackages.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘IntroToAnnotationPackages.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted