############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.15-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data spatialDE ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘spatialDE/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘spatialDE’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘spatialDE.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 123-125 (spatialDE.Rmd) Error: processing vignette 'spatialDE.Rmd' failed with diagnostics: ImportError: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.30' not found (required by /home/biocbuild/.cache/R/basilisk/1.8.1/spatialDE/1.2.0/env/lib/python3.8/site-packages/scipy/optimize/_highs/_highs_wrapper.cpython-38-x86_64-linux-gnu.so) --- failed re-building ‘spatialDE.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘spatialDE.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted