############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.15-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data cellxgenedp ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘cellxgenedp/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘cellxgenedp’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘using_cellxgenedp.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 156-159 (using_cellxgenedp.Rmd) Error: processing vignette 'using_cellxgenedp.Rmd' failed with diagnostics: Must group by variables found in `.data`. Column `label` is not found. Column `ontology_term_id` is not found. --- failed re-building ‘using_cellxgenedp.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘using_cellxgenedp.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted