############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r brendaDb -R && F:\biocbuild\bbs-3.15-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data brendaDb ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'brendaDb/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'brendaDb': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'brendaDb.Rmd' using rmarkdown Loading required namespace: brendaDb Quitting from lines 136-137 (brendaDb.Rmd) Error: processing vignette 'brendaDb.Rmd' failed with diagnostics: invalid connection --- failed re-building 'brendaDb.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'brendaDb.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted