############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### rm -rf TOAST.buildbin-libdir && mkdir TOAST.buildbin-libdir && D:\biocbuild\bbs-3.15-bioc\R\bin\R.exe CMD INSTALL --build --library=TOAST.buildbin-libdir TOAST_1.9.5.tar.gz ### ############################################################################## ############################################################################## * installing *source* package 'TOAST' ... ** using staged installation ** R ** data ** inst ** byte-compile and prepare package for lazy loading ** help *** installing help indices converting help for package 'TOAST' finding HTML links ... done CBS_PBMC_array html ChooseMarker html DEVarSelect html GetPrior html MDeconv html RA_100samples html Tsisal html assignCellType html beta_emp html cedar html csDeconv html csTest html findRefinx html fitModel html makeDesign html myRefFreeCellMix html myRefFreeCellMixInitialize html myprojectMix html plotCorr html ** building package indices ** installing vignettes ** testing if installed package can be loaded from temporary location ** testing if installed package can be loaded from final location ** testing if installed package keeps a record of temporary installation path * MD5 sums packaged installation of 'TOAST' as TOAST_1.9.5.zip * DONE (TOAST)