############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### D:\biocbuild\bbs-3.15-bioc\R\bin\R.exe CMD INSTALL RTCGA ### ############################################################################## ############################################################################## * installing to library 'D:/biocbuild/bbs-3.15-bioc/R/library' * installing *source* package 'RTCGA' ... ** using staged installation ** R ** byte-compile and prepare package for lazy loading ** help *** installing help indices converting help for package 'RTCGA' finding HTML links ... done RTCGA-package html boxplotTCGA html finding level-2 HTML links ... done checkTCGA html convertTCGA html datasetsTCGA html downloadTCGA html expressionsTCGA html heatmapTCGA html infoTCGA html installTCGA html kmTCGA html mutationsTCGA html pcaTCGA html readTCGA html survivalTCGA html theme_RTCGA html ** building package indices ** installing vignettes ** testing if installed package can be loaded from temporary location ** testing if installed package can be loaded from final location ** testing if installed package keeps a record of temporary installation path * DONE (RTCGA) Making 'packages.html' ... done