############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r CNVRanger -R && D:\biocbuild\bbs-3.15-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data CNVRanger ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'CNVRanger/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'CNVRanger': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'CNVRanger.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 387-388 (CNVRanger.Rmd) Error: processing vignette 'CNVRanger.Rmd' failed with diagnostics: No method for subsetting an XMLInternalDocument with numeric --- failed re-building 'CNVRanger.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'CNVRanger.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted