############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### rm -rf CAFE.buildbin-libdir && mkdir CAFE.buildbin-libdir && D:\biocbuild\bbs-3.15-bioc\R\bin\R.exe CMD INSTALL --build --library=CAFE.buildbin-libdir CAFE_1.31.0.tar.gz ### ############################################################################## ############################################################################## * installing *source* package 'CAFE' ... ** using staged installation ** R ** data ** inst ** byte-compile and prepare package for lazy loading ** help *** installing help indices converting help for package 'CAFE' finding HTML links ... done CAFE-package html CAFE html ProcessCels html armStats html bandStats html chromosomeStats html cliSubset html discontPlot html discontSmooth html facetPlot html fisher.method html guiSubset html rawPlot html slidPlot html slidSmooth html ** building package indices ** installing vignettes ** testing if installed package can be loaded from temporary location ** testing if installed package can be loaded from final location ** testing if installed package keeps a record of temporary installation path * MD5 sums packaged installation of 'CAFE' as CAFE_1.31.0.zip * DONE (CAFE)