############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### rm -rf APAlyzer.buildbin-libdir && mkdir APAlyzer.buildbin-libdir && D:\biocbuild\bbs-3.15-bioc\R\bin\R.exe CMD INSTALL --build --library=APAlyzer.buildbin-libdir APAlyzer_1.9.4.tar.gz ### ############################################################################## ############################################################################## * installing *source* package 'APAlyzer' ... ** using staged installation ** R ** inst ** byte-compile and prepare package for lazy loading ** help *** installing help indices converting help for package 'APAlyzer' finding HTML links ... done APABox html APAVolcano html APAdiff html GENEXP_CDS html PAS2GEF html PASEXP_3UTR html PASEXP_IPA html REF3UTR html REF4PAS html REFCDS html ThreeMostPairBam html download_testbam html ** building package indices ** installing vignettes ** testing if installed package can be loaded from temporary location ** testing if installed package can be loaded from final location ** testing if installed package keeps a record of temporary installation path * MD5 sums packaged installation of 'APAlyzer' as APAlyzer_1.9.4.zip * DONE (APAlyzer)