############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### C:\cygwin\bin\curl.exe -O http://155.52.207.165/BBS/3.13/bioc/src/contrib/sitadela_1.0.31.tar.gz && rm -rf sitadela.buildbin-libdir && mkdir sitadela.buildbin-libdir && C:\Users\biocbuild\bbs-3.13-bioc\R\bin\R.exe CMD INSTALL --merge-multiarch --build --library=sitadela.buildbin-libdir sitadela_1.0.31.tar.gz && C:\Users\biocbuild\bbs-3.13-bioc\R\bin\R.exe CMD INSTALL sitadela_1.0.31.zip && rm sitadela_1.0.31.tar.gz sitadela_1.0.31.zip ### ############################################################################## ############################################################################## % Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current Dload Upload Total Spent Left Speed 0 0 0 0 0 0 0 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 0 25 182k 25 47187 0 0 231k 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 231k 100 182k 100 182k 0 0 307k 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 307k install for i386 * installing *source* package 'sitadela' ... ** using staged installation ** R Error in parse(outFile) : C:/Users/biocbuild/bbs-3.13-bioc/tmpdir/RtmpY3RYEe/R.INSTALL26c03cd5793/sitadela/R/query-utils.R:992:9: unexpected symbol 991: host="genome-mysql.soe.ucsc.edu" 992: user ^ ERROR: unable to collate and parse R files for package 'sitadela' * removing 'C:/Users/biocbuild/bbs-3.13-bioc/meat/sitadela.buildbin-libdir/sitadela'