############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r Rnits -R && C:\Users\biocbuild\bbs-3.13-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data Rnits ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'Rnits/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'Rnits': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'Rnits-vignette.Rnw' using knitr trying URL 'https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE4nnn/GSE4158/matrix/GSE4158_series_matrix.txt.gz' Content type 'application/x-gzip' length 514853 bytes (502 KB) ================================================== downloaded 502 KB Warning: One or more parsing issues, see `problems()` for details Quitting from lines 90-114 (Rnits-vignette.Rnw) Error: processing vignette 'Rnits-vignette.Rnw' failed with diagnostics: invalid 'row.names' length --- failed re-building 'Rnits-vignette.Rnw' SUMMARY: processing the following file failed: 'Rnits-vignette.Rnw' Error: Vignette re-building failed. Execution halted