############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.13-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data MoonlightR ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘MoonlightR/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘MoonlightR’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘Moonlight.Rmd’ using rmarkdown ℹ Loading MoonlightR Loading required package: doParallel Loading required package: foreach Loading required package: iterators Loading required package: parallel Setting options('download.file.method.GEOquery'='auto') Setting options('GEOquery.inmemory.gpl'=FALSE) Quitting from lines 668-671 (Moonlight.Rmd) Error: processing vignette 'Moonlight.Rmd' failed with diagnostics: attempt to use zero-length variable name --- failed re-building ‘Moonlight.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘Moonlight.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted