############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.13-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data ENVISIONQuery ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘ENVISIONQuery/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘ENVISIONQuery’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘ENVISIONQuery.Rnw’ using Sweave Loading required package: rJava Loading required package: XML Warning in getService("ID Conversion") : ENVISIONQuery: Invalid service name Warning in getService("Reactome") : ENVISIONQuery: Invalid service name Error: processing vignette 'ENVISIONQuery.Rnw' failed with diagnostics: chunk 1 (label = chunk1) Error in if (!(toolName %in% toolNames)) { : argument is of length zero --- failed re-building ‘ENVISIONQuery.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘ENVISIONQuery.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted