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                                                 Version Built
a4Base                                            1.14.0 3.1.3
a4Classif                                         1.14.0 3.1.3
a4Core                                            1.14.0 3.1.3
a4Preproc                                         1.14.0 3.1.3
a4Reporting                                       1.14.0 3.1.3
abind                                              1.4-3 3.1.3
acepack                                          1.3-3.3 3.1.2
aCGH                                              1.44.0 3.1.3
actuar                                             1.1-8 3.1.2
ada                                                2.0-3 3.1.2
ade4                                               1.6-2 3.1.2
adehabitatLT                                      0.3.19 3.1.3
adehabitatMA                                       0.3.9 3.1.3
affxparser                                        1.38.0 3.1.3
affy                                              1.44.0 3.1.3
affycomp                                          1.42.0 3.1.3
AffyCompatible                                    1.26.0 3.1.3
affycompData                                       1.3.1 3.1.1
affyContam                                        1.24.0 3.1.3
affycoretools                                     1.38.0 3.1.3
affydata                                          1.13.1 3.1.1
Affyhgu133A2Expr                                   1.1.1 3.1.1
Affyhgu133aExpr                                    1.3.1 3.1.1
Affyhgu133Plus2Expr                                1.0.1 3.1.1
affyio                                            1.34.0 3.1.3
affylmGUI                                         1.40.2 3.1.3
AffymetrixDataTestFiles                            0.3.1 3.1.1
Affymoe4302Expr                                    1.3.1 3.1.1
affyPLM                                           1.42.0 3.1.3
affyQCReport                                      1.44.0 3.1.3
agricolae                                          1.2-1 3.1.2
airway                                             1.0.0 3.1.2
akima                                             0.5-11 3.1.2
ALL                                                1.7.1 3.1.3
ALLMLL                                             1.5.1 3.1.1
ALS                                                0.0.5 3.1.2
altcdfenvs                                        2.28.0 3.1.3
amap                                              0.8-14 3.1.2
AmpAffyExample                                     1.5.1 3.1.1
annaffy                                           1.38.0 3.1.3
annotate                                          1.44.0 3.1.3
AnnotationDbi                                     1.28.2 3.1.3
AnnotationForge                                    1.8.2 3.1.3
AnnotationHub                                      1.6.0 3.1.3
annotationTools                                   1.40.0 3.1.3
anota                                             1.14.0 3.1.3
antiProfilesData                                   1.1.1 3.1.1
aod                                                  1.3 3.1.2
apcluster                                          1.4.1 3.1.2
apComplex                                         2.32.0 3.1.3
ape                                                  3.2 3.1.2
aplpack                                            1.3.0 3.1.2
aroma.affymetrix                                  2.13.0 3.1.2
aroma.apd                                          0.6.0 3.1.2
aroma.core                                        2.13.0 3.1.2
aroma.light                                        2.2.1 3.1.3
ArrayExpress                                      1.26.0 3.1.3
ArrayTV                                            1.4.0 3.1.3
ARRmData                                           1.1.1 3.1.1
arules                                             1.1-6 3.1.2
assertthat                                           0.1 3.1.2
ath1121501cdf                                     2.15.0 3.1.0
aws                                                1.9-4 3.1.2
awsMethods                                         1.0-3 3.1.2
ballgown                                           1.0.4 3.1.3
base                                               3.1.3 3.1.3
base64                                               1.1 3.1.2
base64enc                                          0.1-2 3.1.2
BatchJobs                                            1.6 3.1.3
baySeq                                            2.0.50 3.1.3
BB                                             2014.10-1 3.1.2
BBmisc                                               1.9 3.1.2
bcellViper                                         1.1.1 3.1.1
bdsmatrix                                          1.3-2 3.1.2
beadarray                                         2.16.0 3.1.3
beadarrayExampleData                               1.3.1 3.1.1
BeadDataPackR                                     1.18.0 3.1.3
beanplot                                             1.2 3.1.2
beeswarm                                           0.1.6 3.1.2
betareg                                            3.0-5 3.1.2
bgmm                                                 1.7 3.1.2
BH                                              1.55.0-3 3.1.2
BiasedUrn                                         1.06.1 3.1.2
bibtex                                             0.4.0 3.1.2
biclust                                            1.1.0 3.1.3
biglm                                              0.9-1 3.1.2
binom                                              1.1-1 3.1.2
Biobase                                           2.26.0 3.1.3
BiocGenerics                                      0.12.1 3.1.3
biocGraph                                         1.28.0 3.1.3
BiocInstaller                                     1.16.2 3.1.3
BiocParallel                                       1.0.3 3.1.3
BiocStyle                                          1.4.1 3.1.3
biocViews                                         1.34.1 3.1.3
bioDist                                           1.38.0 3.1.3
biom                                              0.3.12 3.1.2
biomaRt                                           2.22.0 3.1.3
BioNet                                            1.26.1 3.1.3
bionetdata                                         1.0.1 3.1.2
Biostrings                                        2.34.1 3.1.3
biovizBase                                        1.14.1 3.1.3
BiSeq                                              1.6.0 3.1.3
bit                                               1.1-12 3.1.2
bit64                                              0.9-4 3.1.2
bitops                                             1.0-6 3.1.2
bladderbatch                                       1.3.1 3.1.1
blima                                              1.0.0 3.1.1
blimaTestingData                                   1.0.0 3.1.2
blockmodeling                                      0.1.8 3.1.2
BMA                                               3.18.1 3.1.2
bnlearn                                            3.7.1 3.1.2
boot                                              1.3-15 3.1.3
bootstrap                                         2015.2 3.1.2
bpca                                               1.2-2 3.1.2
BradleyTerry2                                      1.0-6 3.1.2
BRAIN                                             1.12.0 3.1.3
breastCancerMAINZ                                  1.3.1 3.1.1
breastCancerNKI                                    1.3.1 3.1.3
breastCancerTRANSBIG                               1.3.1 3.1.1
breastCancerUNT                                    1.3.1 3.1.1
breastCancerUPP                                    1.3.1 3.1.1
breastCancerVDX                                    1.3.1 3.1.1
brew                                               1.0-6 3.1.2
brglm                                              0.5-9 3.1.2
BSgenome                                          1.34.1 3.1.3
BSgenome.Athaliana.TAIR.TAIR9                   1.3.1000 3.1.0
BSgenome.Celegans.UCSC.ce10                        1.4.0 3.1.0
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2                         1.4.0 3.1.0
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3                    1.4.0 3.1.0
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7                       1.4.0 3.1.0
BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805                    1.3.1000 3.1.0
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38                   1.3.1000 3.1.0
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18                     1.3.1000 3.1.0
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked                1.3.99 3.1.0
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19                        1.4.0 3.1.0
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked                1.3.99 3.1.0
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10                       1.4.0 3.1.0
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8                        1.4.0 3.1.0
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked                1.3.99 3.1.0
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9                        1.4.0 3.1.0
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked                1.3.99 3.1.0
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4                      1.4.0 3.1.0
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5                      1.4.0 3.1.0
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2                  1.4.0 3.1.0
bsseq                                              1.2.0 3.1.3
bsseqData                                          0.3.1 3.1.1
BufferedMatrix                                    1.30.0 3.1.3
bumphunter                                         1.6.0 3.1.3
ca                                                  0.58 3.1.2
Cairo                                              1.5-6 3.1.2
cairoDevice                                         2.22 3.1.2
calibrate                                          1.7.2 3.1.2
CAMERA                                            1.22.0 3.1.3
cancerdata                                         1.3.1 3.1.1
car                                               2.0-25 3.1.2
caret                                             6.0-41 3.1.2
caroline                                           0.7.6 3.1.2
Category                                          2.32.0 3.1.3
catnet                                            1.14.8 3.1.2
caTools                                           1.17.1 3.1.2
CCl4                                               1.3.1 3.1.1
cellHTS                                           1.36.0 3.1.3
cellHTS2                                          2.30.0 3.1.3
CellNOptR                                         1.12.0 3.1.3
cgdsr                                             1.1.33 3.1.2
CGHbase                                           1.26.0 3.1.3
CGHcall                                           2.28.0 3.1.3
CGHregions                                        1.24.0 3.1.3
ChAMPdata                                          1.1.2 3.1.1
changepoint                                        1.1.5 3.1.2
charm                                             2.12.0 3.1.3
charmData                                          1.1.1 3.1.1
checkmate                                          1.5.2 3.1.3
ChemmineDrugs                                     0.99.3 3.1.3
ChemmineOB                                         1.4.1 3.1.3
ChemmineR                                         2.18.1 3.1.3
cheung2010                                         0.3.2 3.1.3
chimera                                            1.8.5 3.1.3
chipenrich.data                                    1.1.8 3.1.1
ChIPpeakAnno                                      2.16.4 3.1.3
ChIPseeker                                         1.2.6 3.1.3
chipseq                                           1.16.0 3.1.3
chopsticks                                        1.30.1 3.1.2
chron                                             2.3-45 3.1.2
CircStats                                          0.2-4 3.1.2
class                                             7.3-12 3.1.3
cleaver                                            1.4.0 3.1.3
clinfun                                            1.0.9 3.1.2
clipper                                            1.6.2 3.1.3
CLL                                                1.5.1 3.1.1
clst                                              1.14.0 3.1.3
clue                                              0.3-49 3.1.2
cluster                                            2.0.1 3.1.3
clusterProfiler                                    2.0.1 3.1.3
clusterRepro                                     0.5-1.1 3.1.2
clValid                                            0.6-6 3.1.2
cMAP                                              1.15.1 3.0.0
cMap2data                                          1.1.1 3.1.1
CNEr                                               1.2.0 3.1.3
CNORode                                            1.8.1 3.1.3
CNTools                                           1.22.0 3.1.3
cnvGSA                                            1.10.0 3.1.3
cnvGSAdata                                         1.1.1 3.1.1
coda                                              0.17-1 3.1.2
codelink                                          1.34.0 3.1.3
codetools                                         0.2-11 3.1.3
COHCAPanno                                         1.1.1 3.1.1
coin                                              1.0-24 3.1.2
colonCA                                            1.7.1 3.1.1
colorRamps                                           2.3 3.1.2
colorspace                                         1.2-6 3.1.3
combinat                                           0.0-8 3.1.2
compiler                                           3.1.3 3.1.3
ConsensusClusterPlus                              1.20.0 3.1.1
convert                                           1.42.0 3.1.3
COPDSexualDimorphism.data                          1.1.1 3.1.1
CopyNumber450kData                                 1.1.1 3.1.1
corpcor                                            1.6.7 3.1.2
corrgram                                             1.7 3.1.3
corrplot                                            0.73 3.1.2
COSMIC.67                                          1.1.1 3.1.1
CoxBoost                                             1.4 3.1.2
CPE                                                1.4.4 3.1.2
cqn                                               1.12.0 3.1.3
crlmm                                             1.24.0 3.1.3
CSAR                                              1.18.0 3.1.3
cubature                                           1.1-2 3.1.2
cummeRbund                                         2.8.2 3.1.3
curatedOvarianData                                 1.3.5 3.1.3
d3Network                                        0.5.2.1 3.1.2
data.table                                         1.9.4 3.1.2
datasets                                           3.1.3 3.1.3
DAVIDQuery                                        1.26.0 3.1.3
DBI                                                0.3.1 3.1.2
deepSNV                                           1.12.0 3.1.3
DEGraph                                           1.18.0 3.1.3
deldir                                             0.1-9 3.1.3
DEoptimR                                           1.0-2 3.1.2
derfinder                                         1.0.10 3.1.3
derfinderData                                      1.0.0 3.1.2
derfinderHelper                                    1.0.4 3.1.3
derfinderPlot                                      1.0.3 3.1.3
DESeq                                             1.18.0 3.1.3
DESeq2                                             1.6.3 3.1.3
deSolve                                             1.11 3.1.2
devtools                                           1.7.0 3.1.2
DEXSeq                                            1.12.2 3.1.3
dfoptim                                         2011.8-1 3.1.2
diagram                                            1.6.3 3.1.2
dichromat                                          2.0-0 3.1.2
DiffBind                                          1.12.3 3.1.3
digest                                             0.6.8 3.1.2
diptest                                           0.75-6 3.1.2
DirichletMultinomial                               1.8.0 3.1.3
distr                                              2.5.3 3.1.2
DLBCL                                              1.5.1 3.1.1
DMRcatedata                                        1.1.1 3.1.1
dmt                                               0.8.20 3.1.2
DNAcopy                                           1.40.0 3.1.3
DO.db                                              2.8.0 3.1.0
doBy                                              4.5-13 3.1.2
doParallel                                         1.0.8 3.1.2
doRNG                                                1.6 3.1.2
DOSE                                               2.4.0 3.1.3
doSNOW                                            1.0.12 3.1.2
downloader                                           0.3 3.1.2
dplyr                                              0.4.1 3.1.2
DPpackage                                          1.1-6 3.1.2
drc                                               2.3-96 3.1.2
drosgenome1.db                                     3.0.0 3.1.0
drosophila2probe                                  2.15.0 3.1.0
DrugVsDiseasedata                                  1.1.1 3.1.1
DSS                                                2.4.1 3.1.3
dyebias                                           1.24.0 3.1.1
dyebiasexamples                                    1.3.1 3.1.1
dynamicTreeCut                                      1.62 3.1.2
DynDoc                                            1.44.0 3.1.3
e1071                                              1.6-4 3.1.2
earth                                              4.2.0 3.1.2
easyRNASeq                                         2.2.1 3.1.3
EBarrays                                          2.30.0 3.1.3
EBImage                                            4.8.3 3.1.3
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feature                                           1.2.11 3.1.2
ff                                                2.2-13 3.1.2
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fpc                                                2.1-9 3.1.2
frma                                              1.18.0 3.1.3
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FunciSNP.data                                      1.1.0 3.1.0
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GA                                                   2.2 3.1.2
gaga                                              2.12.0 3.1.3
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geneLenDataBase                                    1.1.1 3.1.1
GeneMeta                                          1.38.0 3.1.3
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GenKern                                           1.2-60 3.1.2
GenomeGraphs                                      1.26.0 3.1.3
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GenomicFeatures                                   1.18.7 3.1.3
GenomicFiles                                       1.2.1 3.1.3
GenomicRanges                                     1.18.4 3.1.3
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HiCDataLymphoblast                                 1.1.1 3.1.1
highr                                              0.4.1 3.1.3
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HiTC                                              1.10.0 3.1.1
Hmisc                                             3.15-0 3.1.2
hmyriB36                                           1.1.1 3.1.3
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Homo.sapiens                                       1.1.2 3.0.2
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Icens                                             1.38.0 3.1.3
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KEGGdzPathwaysGEO                                  1.3.1 3.1.1
KEGGgraph                                         1.24.0 3.1.3
keggorthology                                     2.18.0 3.1.3
KEGGprofile                                        1.8.0 3.1.3
KEGGREST                                           1.6.4 3.1.3
kernlab                                           0.9-20 3.1.2
KernSmooth                                       2.23-14 3.1.3
klaR                                              0.6-12 3.1.2
Kmisc                                              0.5.0 3.1.2
knitcitations                                      1.0.5 3.1.2
knitr                                                1.9 3.1.2
knitrBootstrap                                     0.9.0 3.1.2
kohonen                                           2.0.18 3.1.3
ks                                                 1.9.4 3.1.2
kza                                                3.0.0 3.1.2
labeling                                             0.3 3.1.2
lambda.r                                           1.1.7 3.1.3
lars                                                 1.2 3.1.2
lattice                                          0.20-31 3.1.3
latticeExtra                                      0.6-26 3.1.2
lava                                               1.4.0 3.1.2
lavaan                                            0.5-18 3.1.3
lazyeval                                          0.1.10 3.1.2
leaps                                                2.9 3.1.2
LearnBayes                                          2.15 3.1.2
leeBamViews                                        1.1.1 3.1.1
les                                               1.16.0 3.1.3
leukemiasEset                                      1.1.1 3.1.1
LiblineaR                                         1.94-2 3.1.2
LIM                                                1.4.6 3.1.2
limma                                             3.22.7 3.1.3
limSolve                                         1.5.5.1 3.1.2
LiquidAssociation                                 1.20.0 3.1.3
lme4                                               1.1-7 3.1.2
lmtest                                            0.9-33 3.1.2
locfit                                           1.5-9.1 3.1.2
log4r                                                0.2 3.1.2
logging                                          0.7-103 3.1.3
logicFS                                           1.36.0 3.1.3
LogicReg                                           1.5.6 3.1.2
lokern                                             1.1-6 3.1.2
LPE                                               1.40.0 3.1.3
lpSolve                                           5.6.11 3.1.3
LSD                                                  3.0 3.1.2
lubridate                                          1.3.3 3.1.2
lumi                                              2.18.0 3.1.3
lumiBarnes                                         1.5.1 3.1.1
lumiHumanAll.db                                   1.22.0 3.0.2
lumiHumanIDMapping                                1.10.0 3.0.0
LungCancerACvsSCCGEO                               1.1.1 3.1.1
lungExpression                                     0.3.1 3.1.1
MAclinical                                         1.0-5 3.1.2
MADAM                                              1.2.2 3.1.2
made4                                             1.40.0 3.1.3
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123           3.0.0 3.2.0
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138                 3.0.0 3.2.0
magic                                              1.5-6 3.1.2
magrittr                                             1.5 3.1.2
makecdfenv                                        1.42.0 3.1.3
MALDIquant                                          1.11 3.1.2
MALDIquantForeign                                    0.9 3.1.3
maps                                               2.3-9 3.1.2
maqcExpression4plex                                1.9.1 3.1.1
MAQCsubset                                         1.3.1 3.1.1
MAQCsubsetAFX                                      1.3.1 3.1.1
markdown                                           0.7.4 3.1.2
marray                                            1.44.0 3.1.3
maSigPro                                          1.38.0 3.1.3
MASS                                              7.3-40 3.1.3
MassSpecWavelet                                   1.32.0 3.1.3
matlab                                             1.0.2 3.1.2
Matrix                                             1.2-0 3.1.3
matrixcalc                                         1.0-3 3.1.2
matrixStats                                       0.14.0 3.1.2
MBA                                                0.0-8 3.1.2
mboost                                             2.4-2 3.1.2
mcbiopi                                            1.1.2 3.1.2
mclust                                               4.4 3.1.2
MCMCpack                                           1.3-3 3.1.2
mda                                                0.4-4 3.1.2
mdqc                                              1.28.0 3.1.3
MEDIPSData                                         1.1.1 3.1.1
MEEBOdata                                          1.3.1 3.1.1
memoise                                            0.2.1 3.1.2
MergeMaid                                         2.38.0 3.1.3
MeSH.AOR.db                                        1.2.0 3.1.0
MeSH.db                                            1.2.0 3.1.0
MeSH.PCR.db                                        1.2.0 3.1.0
MeSHDbi                                            1.2.7 3.1.3
metaArray                                         1.44.0 3.1.3
metafor                                            1.9-5 3.1.3
metagenomeSeq                                      1.8.3 3.1.3
metaMSdata                                         1.1.1 3.1.1
methods                                            3.1.3 3.1.3
methyAnalysis                                      1.8.0 3.1.3
methylPipe                                         1.0.5 3.1.3
MethylSeekR                                        1.6.0 3.1.3
methylumi                                         2.12.0 3.1.3
Mfuzz                                             2.26.0 3.1.3
mgcv                                               1.8-6 3.1.3
mgsa                                              1.14.2 3.1.3
mgug4104a.db                                       3.0.0 3.1.0
mhsmm                                             0.4.14 3.1.2
microRNA                                          1.24.0 3.1.3
mime                                                 0.3 3.1.3
minet                                             3.24.0 3.1.3
minfi                                             1.12.0 3.1.3
minfiData                                          0.7.1 3.1.1
minpack.lm                                         1.1-8 3.1.2
minqa                                              1.2.4 3.1.2
mirbase.db                                         1.2.0 3.0.0
miRNAtap                                           1.0.0 3.1.3
miRNAtap.db                                       0.99.6 3.1.0
miRNATarget                                        1.3.1 3.1.1
misc3d                                             0.8-4 3.1.2
mitoODEdata                                        1.1.1 3.1.1
mixtools                                           1.0.2 3.1.2
mlbench                                            2.1-1 3.1.2
MLInterfaces                                      1.46.0 3.1.3
MLP                                               1.14.0 3.1.3
MMDiff                                             1.6.0 3.1.1
MMDiffBamSubset                                    1.1.1 3.1.1
mnormt                                             1.5-2 3.1.3
modeest                                              2.1 3.1.2
modeltools                                        0.2-21 3.1.2
MoExExonProbesetLocation                          1.15.0 3.1.0
mogene10sttranscriptcluster.db                     8.2.0 3.1.0
mosaics                                            2.0.1 3.1.3
mosaicsExample                                     1.1.1 3.1.1
MotifDb                                            1.8.0 3.1.3
motifStack                                        1.10.1 3.1.3
MotIV                                             1.22.0 3.1.3
mouse4302.db                                       3.0.0 3.1.0
mpm                                               1.0-22 3.1.2
mRMRe                                              2.0.5 3.1.2
msdata                                             0.3.3 3.1.3
MSGFgui                                            1.0.2 3.1.2
MSGFplus                                           1.0.5 3.1.3
msm                                                  1.5 3.1.2
msmsEDA                                            1.4.0 3.1.3
msmsTests                                          1.4.0 3.1.3
MSnbase                                           1.14.2 3.1.3
MSnID                                              1.0.1 3.1.2
MUGAExampleData                                    1.0.0 3.1.2
Mulcom                                            1.16.0 3.1.3
multcomp                                           1.4-0 3.1.2
multicool                                          0.1-5 3.1.2
multtest                                          2.22.0 3.1.3
munsell                                            0.4.2 3.1.2
Mus.musculus                                       1.1.2 3.0.2
MVCClass                                          1.40.0 3.1.3
mvoutData                                          1.1.1 3.1.1
mvoutlier                                          2.0.6 3.1.2
mvtnorm                                            1.0-2 3.1.2
mzID                                               1.4.1 3.1.3
mzR                                                2.0.0 3.1.3
NBPSeq                                             0.3.0 3.1.2
NCBI2R                                             1.4.7 3.1.2
ncdf                                               1.6.8 3.1.2
ncdfFlow                                          2.12.0 3.1.3
NCIgraph                                          1.14.0 3.1.3
neaGUI                                             1.4.0 3.1.3
nem                                               2.40.0 3.1.3
network                                           1.11.3 3.1.2
networkBMA                                         1.8.0 3.1.1
NGScopyData                                       0.99.2 3.1.1
nlcv                                               0.2-0 3.0.0
nleqslv                                              2.7 3.1.3
nlme                                             3.1-120 3.1.3
nloptr                                             1.0.4 3.1.2
NLP                                                0.1-6 3.1.2
NMF                                               0.20.5 3.1.2
NMFN                                                 2.0 3.1.2
nnet                                               7.3-9 3.1.3
nnls                                                 1.4 3.1.2
NOISeq                                             2.8.0 3.1.3
nor1mix                                            1.2-0 3.1.2
nortest                                            1.0-3 3.1.2
Nozzle.R1                                          1.1-1 3.1.2
numDeriv                                        2012.9-1 3.1.2
oligo                                             1.30.0 3.1.3
oligoClasses                                      1.28.0 3.1.3
oligoData                                          1.8.0 3.0.0
OLIN                                              1.44.0 3.1.3
Oncotree                                           0.3.3 3.1.2
ontoCAT                                           1.18.0 3.1.3
openCyto                                           1.4.0 3.1.3
optextras                                     2013-10.28 3.1.2
optimx                                          2013.8.7 3.1.2
optparse                                           1.3.0 3.1.2
ORCME                                              2.0.1 3.1.2
org.At.tair.db                                     3.0.0 3.1.0
org.Bt.eg.db                                       3.0.0 3.1.0
org.Ce.eg.db                                       3.0.0 3.1.0
org.Cf.eg.db                                       3.0.0 3.1.0
org.Dm.eg.db                                       3.0.0 3.1.0
org.EcK12.eg.db                                    3.0.0 3.1.0
org.Hs.eg.db                                       3.0.0 3.1.0
org.Hs.ipi.db                                      1.3.0 3.0.0
org.MeSH.Aca.db                                    1.2.0 3.1.0
org.MeSH.Atu.K84.db                                1.2.0 3.1.0
org.MeSH.Bsu.168.db                                1.2.0 3.1.0
org.MeSH.Hsa.db                                    1.2.0 3.1.0
org.MeSH.Syn.db                                    1.2.0 3.1.0
org.Mm.eg.db                                       3.0.0 3.1.0
org.Rn.eg.db                                       3.0.0 3.1.0
org.Sc.sgd.db                                      3.0.0 3.1.0
org.TguttataTestingSubset.eg.db                      0.1 3.0.2
OrganismDbi                                        1.8.1 3.1.3
OrgMassSpecR                                       0.4-4 3.1.2
ORIClust                                           1.0-1 3.1.2
orQA                                               0.2.1 3.1.2
OTUbase                                           1.16.0 3.1.3
outliers                                            0.14 3.1.2
pamr                                                1.55 3.1.2
pander                                             0.5.1 3.1.2
PAnnBuilder                                       1.30.1 3.1.3
PANR                                              1.12.1 3.1.3
parallel                                           3.1.3 3.1.3
parathyroidSE                                      1.3.2 3.1.1
parody                                            1.24.0 3.1.3
party                                             1.0-20 3.1.2
pasilla                                            0.5.1 3.1.3
pasillaBamSubset                                   0.3.1 3.1.1
PathNetData                                        1.1.1 3.1.1
pathview                                           1.6.0 3.1.3
pbapply                                            1.1-1 3.1.2
pbivnorm                                           0.6.0 3.1.2
pbkrtest                                           0.4-2 3.1.2
pcaGoPromoter.Hs.hg19                              1.1.1 3.1.1
pcaGoPromoter.Mm.mm9                               1.1.1 3.1.1
pcaGoPromoter.Rn.rn4                               1.1.1 3.1.1
pcalg                                             2.0-10 3.1.3
pcaMethods                                        1.56.0 3.1.3
pcaPP                                             1.9-60 3.1.2
pd.atdschip.tiling                                 0.3.4 3.1.1
pd.charm.hg18.example                             0.99.4 3.1.3
pd.genomewidesnp.5                                3.10.0 3.2.0
pd.genomewidesnp.6                                3.10.0 3.2.0
pd.hg.u95a                                        3.10.0 3.2.0
pd.hg18.60mer.expr                                 3.4.1 3.1.3
pd.huex.1.0.st.v2                                 3.10.0 3.2.0
pd.hugene.1.0.st.v1                               3.10.0 3.2.0
pd.mapping250k.nsp                                3.10.0 3.2.0
pd.mapping250k.sty                                3.10.0 3.2.0
pd.mapping50k.hind240                             3.10.0 3.2.0
pd.mapping50k.xba240                              3.10.0 3.2.0
pdInfoBuilder                                     1.30.6 3.1.2
pdmclass                                          1.38.0 3.1.3
penalized                                         0.9-45 3.1.2
pepDat                                             1.0.0 3.1.2
PerfMeas                                           1.2.1 3.1.2
permute                                            0.8-3 3.1.2
PFAM.db                                            3.0.0 3.1.0
PGSEA                                             1.40.0 3.1.3
phastCons100way.UCSC.hg19                          3.0.0 3.2.0
pheatmap                                           1.0.2 3.1.3
PICS                                              2.10.0 3.1.3
pixmap                                            0.4-11 3.1.2
pkgmaker                                            0.22 3.1.2
plasmodiumanophelescdf                            2.15.0 3.1.0
plier                                             1.36.0 3.1.3
plotmo                                             2.2.1 3.1.2
plotrix                                           3.5-11 3.1.2
pls                                                2.4-3 3.1.2
plsgenomics                                        1.2-6 3.1.2
plyr                                               1.8.1 3.1.2
png                                                0.1-7 3.1.2
PoiClaClu                                          1.0.2 3.1.2
polspline                                          1.1.9 3.1.2
polynom                                            1.3-8 3.1.2
PolynomF                                            0.94 3.1.2
PolyPhen.Hsapiens.dbSNP131                         1.0.2 3.0.0
ppiData                                            0.3.1 3.1.3
ppiStats                                          1.32.0 3.1.3
prabclus                                           2.2-6 3.1.2
pracma                                             1.8.3 3.1.2
prada                                             1.42.0 3.1.3
prebsdata                                          1.1.1 3.1.1
PREDA                                             1.12.0 3.1.3
PREDAsampledata                                    0.5.1 3.1.1
preprocessCore                                    1.28.0 3.1.3
princurve                                         1.1-12 3.1.2
pROC                                               1.7.3 3.1.2
prodlim                                            1.5.1 3.1.2
profileModel                                       0.5-9 3.1.2
pRoloc                                             1.6.2 3.1.3
pRolocdata                                         1.4.1 3.1.3
proto                                             0.3-10 3.1.2
protViz                                            0.2.9 3.1.2
proxy                                             0.4-14 3.1.2
PSCBS                                             0.44.0 3.1.2
PSICQUIC                                           1.4.4 3.1.3
pspline                                           1.0-16 3.1.2
psych                                              1.5.1 3.1.2
ptw                                                1.0-7 3.1.2
puma                                               3.8.0 3.1.3
pumadata                                           2.1.1 3.1.1
pvclust                                            1.3-2 3.1.2
Pviz                                               1.0.0 3.1.3
PWMEnrich                                          4.2.0 3.1.3
PWMEnrich.Dmelanogaster.background                 4.0.3 3.1.1
PWMEnrich.Hsapiens.background                      4.0.1 3.1.1
PWMEnrich.Mmusculus.background                     4.0.1 3.1.1
qgraph                                             1.3.1 3.1.3
qpcR                                               1.4-0 3.1.2
qpcrNorm                                          1.24.0 3.1.3
qpgraph                                            2.0.5 3.1.3
qtl                                               1.36-6 3.1.2
QTLRel                                            0.2-14 3.1.2
quadprog                                           1.5-5 3.1.2
quantreg                                            5.11 3.1.2
quantsmooth                                       1.32.0 3.1.3
QuasiSeq                                           1.0-6 3.1.2
qvalue                                            1.43.0 3.1.3
R.cache                                           0.10.0 3.1.2
R.devices                                         2.13.0 3.1.2
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R.methodsS3                                        1.7.0 3.1.2
R.oo                                              1.19.0 3.1.2
R.rsp                                             0.20.0 3.1.2
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R2HTML                                             2.3.1 3.1.2
R6                                                 2.0.1 3.1.2
rae230a.db                                         3.0.0 3.1.0
rae230aprobe                                      2.15.0 3.1.0
RaExExonProbesetLocation                          1.15.0 3.1.0
ragene10sttranscriptcluster.db                     8.2.0 3.1.0
rama                                              1.40.0 3.1.3
randomForest                                      4.6-10 3.1.2
randomForestSRC                                    1.6.1 3.1.2
RankProd                                          2.38.0 3.1.3
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Rattus.norvegicus                                  1.1.2 3.0.2
rbamtools                                         2.10.0 3.1.2
RBGL                                              1.42.0 3.1.3
rBiopaxParser                                      2.4.0 3.1.3
Rbowtie                                            1.6.0 3.1.3
rcdk                                               3.3.2 3.1.2
rcdklibs                                         1.5.8.4 3.1.2
Rcgmin                                         2013-2.21 3.1.2
rChoiceDialogs                                     1.0.6 3.1.2
RCircos                                            1.1.2 3.1.2
Rclusterpp                                         0.2.3 3.1.2
RColorBrewer                                       1.1-2 3.1.2
Rcpp                                              0.11.5 3.1.2
RcppArmadillo                                0.4.650.1.1 3.1.2
RcppClassic                                        0.9.6 3.1.2
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Rcsdp                                             0.1.53 3.1.2
RCurl                                           1.95-4.5 3.1.2
RCytoscape                                        1.16.0 3.1.3
rda                                              1.0.2-2 3.1.2
RDAVIDWebService                                   1.4.0 3.1.3
Rdisop                                            1.26.0 3.1.3
reactome.db                                       1.50.0 3.1.1
ReactomePA                                        1.10.1 3.1.3
readBrukerFlexData                                 1.8.2 3.1.3
readMzXmlData                                        2.8 3.1.3
ReadqPCR                                          1.12.0 3.1.3
rebmix                                             2.7.1 3.1.3
RedeR                                            1.14.10 3.1.3
refGenome                                          1.3.0 3.1.2
RefManageR                                        0.8.45 3.1.2
registry                                             0.2 3.1.2
relations                                          0.6-4 3.1.2
relimp                                             1.0-4 3.1.2
ReportingTools                                     2.6.0 3.1.3
reportr                                            1.1.2 3.1.2
reshape                                            0.8.5 3.1.2
reshape2                                           1.4.1 3.1.2
RFOC                                               3.3-3 3.1.2
RforProteomics                                     1.4.1 3.1.2
rGADEM                                            2.14.0 3.1.3
rggobi                                            2.1.20 3.1.2
rgl                                            0.95.1201 3.1.2
Rgraphviz                                         2.10.0 3.1.3
RGtk2                                            2.20.31 3.1.2
rhdf5                                             2.10.0 3.1.3
Ringo                                             1.30.0 3.1.3
RIPSeeker                                          1.6.0 3.1.1
rjags                                               3-14 3.1.2
rJava                                              0.9-6 3.1.2
rjson                                             0.2.15 3.1.2
RJSONIO                                            1.3-0 3.1.2
Rlab                                              2.15.1 3.1.2
rlecuyer                                           0.3-3 3.1.2
RMallow                                              1.0 3.1.2
rmarkdown                                          0.5.1 3.1.2
RMassBank                                          1.8.1 3.1.2
RMassBankData                                      1.3.1 3.1.1
rmeta                                               2.16 3.1.2
RmiR                                              1.22.0 3.1.3
RmiR.Hs.miRNA                                      1.0.7 3.0.2
Rmixmod                                            2.0.2 3.1.2
Rmpi                                               0.6-3 3.0.1
rms                                                4.3-0 3.1.2
RNAinteract                                       1.14.0 3.1.1
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14                        0.3.2 3.1.1
rnaSeqMap                                         2.24.0 3.1.3
RnaSeqTutorial                                     0.3.1 3.1.1
rngtools                                           1.2.4 3.1.2
robCompositions                                    1.9.0 3.1.2
robustbase                                        0.92-3 3.1.2
ROC                                               1.42.0 3.1.3
ROCR                                               1.0-7 3.1.3
rols                                               1.8.0 3.1.3
Rook                                               1.1-1 3.1.2
roxygen2                                           4.1.0 3.1.2
rpart                                              4.1-9 3.1.3
rphast                                               1.6 3.1.2
RPMG                                               2.1-5 3.1.2
RPMM                                                1.20 3.1.2
RPostgreSQL                                          0.4 3.1.2
RpsiXML                                            2.8.0 3.1.3
rpx                                                1.2.0 3.1.3
rrcov                                              1.3-8 3.1.2
rRDP                                               1.0.0 3.1.3
rRDPData                                           1.0.0 3.1.2
Rsamtools                                         1.18.3 3.1.3
rsbml                                             2.24.1 3.1.3
RSEIS                                              3.3-3 3.1.2
Rserve                                             1.7-3 3.1.2
rSFFreader                                        0.14.0 3.1.3
Rsolnp                                              1.15 3.1.2
RSQLite                                            1.0.0 3.1.2
rstudioapi                                         0.3.1 3.1.3
RSVGTipsDevice                                     1.0-4 3.1.3
rTANDEM                                            1.6.0 3.1.3
rtfbs                                              0.3.4 3.1.2
rtiff                                              1.4.4 3.1.2
RTN                                                1.4.1 3.1.2
rtracklayer                                       1.26.3 3.1.3
rTRM                                               1.4.0 3.1.3
RUnit                                             0.4.28 3.1.2
RUVnormalizeData                                   1.0.0 3.1.2
Rvmmin                                        2013-11.12 3.1.2
Rwave                                                2.2 3.1.2
S4Vectors                                          0.4.0 3.1.3
safe                                               3.6.1 3.1.3
sampling                                             2.6 3.1.2
samr                                                 2.0 3.1.2
sandwich                                           2.3-3 3.1.3
scales                                             0.2.4 3.1.2
scatterplot3d                                     0.3-35 3.1.2
ScISI                                             1.38.0 3.1.3
scrime                                             1.3.3 3.1.2
sda                                                1.3.6 3.1.3
segmented                                        0.5-1.1 3.1.2
sem                                                3.1-5 3.1.2
sendmailR                                          1.2-1 3.1.2
sendplot                                           4.0.0 3.1.2
SeqArray                                           1.6.1 3.1.3
seqbias                                           1.14.0 3.1.3
seqCNA.annot                                       1.1.1 3.1.1
seqinr                                             3.1-3 3.1.2
seqLogo                                           1.32.1 3.1.3
seriation                                         1.0-14 3.1.2
serumStimulation                                   1.1.1 3.1.1
setRNG                                          2013.9-1 3.1.2
sets                                              1.0-13 3.1.2
sfsmisc                                           1.0-27 3.1.2
sgeostat                                          1.0-25 3.1.2
shape                                              1.4.2 3.1.2
shiny                                             0.11.1 3.1.2
shinyFiles                                         0.6.0 3.1.3
shinyMethylData                                    1.0.0 3.1.2
shinyRGL                                           0.1.0 3.1.2
ShortRead                                         1.24.0 3.1.3
SIFT.Hsapiens.dbSNP132                             1.0.2 3.0.0
SIFT.Hsapiens.dbSNP137                             1.0.0 3.1.0
sigaR                                             1.10.0 3.1.3
sigclust                                           1.1.0 3.1.2
siggenes                                          1.40.0 3.1.3
signal                                             0.7-4 3.1.2
sigPathway                                        1.34.0 3.1.3
simpIntLists                                       1.1.1 3.1.1
simpleaffy                                        2.42.0 3.1.3
sizepower                                         1.36.0 3.1.3
slam                                              0.1-32 3.1.2
SLGI                                              1.26.0 3.1.3
SLqPCR                                            1.32.0 3.1.3
sm                                               2.2-5.4 3.1.2
sn                                                 1.2-0 3.1.3
sna                                                2.3-2 3.1.2
SNAGEE                                             1.6.0 3.1.1
SNAGEEdata                                         1.1.1 3.1.3
snapCGH                                           1.36.0 3.1.3
snow                                              0.3-13 3.1.2
snowfall                                          1.84-6 3.1.2
SNPchip                                           2.12.0 3.1.3
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506                   0.99.8 3.0.0
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427                   0.99.6 3.0.0
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109                   0.99.6 3.0.0
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815                   0.99.6 3.0.0
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608                   0.99.9 3.0.0
SNPRelate                                          1.0.1 3.1.3
snpStats                                          1.16.0 3.1.3
som                                                0.3-5 3.1.2
SomaticCancerAlterations                           1.1.1 3.1.1
SomaticSignatures                                  2.2.3 3.1.3
sonicLength                                        1.4.4 3.1.2
sp                                                1.0-17 3.1.2
spam                                               1.0-1 3.1.2
SPARQL                                              1.16 3.1.2
sparsediscrim                                        0.2 3.1.2
sparseLDA                                          0.1-6 3.1.3
SparseM                                              1.6 3.1.2
spatial                                            7.3-9 3.1.3
spdep                                             0.5-88 3.1.3
SPIA                                              2.18.0 3.1.3
SpikeIn                                            1.7.1 3.1.1
SpikeInSubset                                      1.5.1 3.1.1
splancs                                          2.01-37 3.1.3
splines                                            3.1.3 3.1.3
splots                                            1.32.0 3.1.3
spls                                               2.2-1 3.1.2
splus2R                                            1.2-0 3.1.2
sqldf                                             0.4-10 3.1.2
SQN                                                1.0.5 3.1.2
SRAdb                                            1.20.11 3.1.2
ssize                                             1.40.0 3.1.3
SSOAP                                              0.8-0 3.0.0
st                                                 1.2.4 3.1.3
stabledist                                         0.6-6 3.1.2
stabs                                              0.5-1 3.1.2
startupmsg                                           0.9 3.1.2
statmod                                           1.4.21 3.1.3
stats                                              3.1.3 3.1.3
stats4                                             3.1.3 3.1.3
stemHypoxia                                        1.1.1 3.1.1
stjudem                                            1.5.1 3.1.1
Streamer                                          1.12.0 3.1.3
STRINGdb                                           1.5.5 3.1.3
stringr                                            0.6.2 3.1.2
strucchange                                        1.5-0 3.1.2
superpc                                             1.09 3.1.2
SuppDists                                        1.1-9.1 3.1.2
survcomp                                          1.16.0 3.1.3
survey                                            3.30-3 3.1.2
survival                                          2.38-1 3.1.3
survivalROC                                        1.0.3 3.1.2
sva                                               3.12.0 3.1.3
svDialogs                                         0.9-57 3.1.2
SVGAnnotation                                     0.93-1 3.0.0
svGUI                                             0.9-55 3.1.2
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SweaveListingUtils                                 0.6.2 3.1.2
synapter                                           1.8.4 3.1.3
synapterdata                                       1.3.2 3.1.3
targetscan.Hs.eg.db                                0.6.1 3.1.0
targetscan.Mm.eg.db                                0.6.1 3.1.0
TargetScore                                        1.4.0 3.1.1
TargetScoreData                                    1.1.1 3.1.1
TargetSearch                                      1.22.0 3.1.3
TargetSearchData                                   1.3.1 3.1.1
TCC                                                1.6.5 3.1.3
TCGAMethylation450k                                1.1.1 3.1.1
tcltk                                              3.1.3 3.1.3
tcltk2                                            1.2-11 3.1.2
TeachingDemos                                        2.9 3.1.2
test3cdf                                          2.15.0 3.1.0
testthat                                           0.9.1 3.1.2
TFMPvalue                                          0.0.5 3.1.2
TH.data                                            1.0-6 3.1.2
tiff                                               0.1-5 3.1.2
tilingArray                                       1.44.0 3.1.3
timeDate                                        3012.100 3.1.2
timeSeries                                       3012.99 3.1.2
timsac                                             1.3.3 3.1.2
tinesath1cdf                                       1.3.1 3.1.3
tkrplot                                           0.0-23 3.1.2
tkWidgets                                         1.44.0 3.1.3
tm                                                   0.6 3.1.2
tools                                              3.1.3 3.1.3
topGO                                             2.18.0 3.1.3
topologyGSA                                        1.4.4 3.1.2
tractor.base                                       2.5.0 3.1.2
translations                                       3.1.3 3.1.3
tree                                              1.0-35 3.1.2
trimcluster                                        0.1-2 3.1.2
truncnorm                                          1.0-7 3.1.2
tseries                                          0.10-34 3.1.2
TSP                                                1.1-0 3.1.3
tspair                                            1.24.0 3.1.3
TTR                                               0.22-0 3.1.2
tweeDEseqCountData                                 1.3.1 3.1.1
twilight                                          1.42.0 3.1.3
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22                3.0.0 3.1.0
TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene                     3.0.0 3.1.0
TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene                3.0.0 3.1.0
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene                  3.0.0 3.1.0
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene                  3.0.0 3.1.0
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene                 3.0.0 3.1.0
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene                  3.0.0 3.1.0
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene                  3.0.0 3.1.0
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn5.refGene                  3.0.0 3.1.0
ucminf                                             1.1-3 3.1.2
UniProt.ws                                         2.6.2 3.1.3
utils                                              3.1.3 3.1.3
VanillaICE                                        1.28.5 3.1.3
VariantAnnotation                                 1.12.9 3.1.3
VariantFiltering                                  1.2.14 3.1.3
varSelRF                                           0.7-5 3.1.2
vcd                                                1.3-2 3.1.2
vegan                                              2.2-1 3.1.2
VennDiagram                                        1.6.9 3.1.2
VGAM                                               0.9-7 3.1.2
vioplot                                              0.2 3.1.2
vsn                                               3.34.0 3.1.3
wateRmelon                                         1.6.0 3.1.3
waveslim                                           1.7.5 3.1.2
wavethresh                                         4.6.6 3.1.2
waveTilingData                                     1.1.1 3.1.1
weaver                                            1.32.0 3.1.3
WGCNA                                               1.46 3.1.3
whisker                                            0.3-2 3.1.2
widgetTools                                       1.44.0 3.1.3
wmtsa                                              2.0-0 3.1.2
wordcloud                                            2.5 3.1.2
WriteXLS                                           3.5.1 3.1.2
xcms                                              1.42.0 3.1.3
xlsx                                               0.5.7 3.1.2
xlsxjars                                           0.6.1 3.1.2
Xmisc                                              0.2.1 3.1.2
XML                                             3.98-1.1 3.1.2
XMLRPC                                             0.3-0 3.0.0
XMLSchema                                          0.7-2 3.0.0
xtable                                             1.7-4 3.1.2
xts                                                0.9-7 3.1.2
XVector                                            0.6.0 3.1.3
yaml                                              2.1.13 3.1.2
yaqcaffy                                          1.26.0 3.1.3
yeast2.db                                          3.0.0 3.1.0
yeastCC                                            1.5.1 3.1.1
yeastExpData                                      0.11.1 3.1.1
yeastNagalakshmi                                   1.1.1 3.1.1
yeastRNASeq                                        0.3.1 3.1.1
zebrafishRNASeq                                    1.0.0 3.1.2
zlibbioc                                          1.12.0 3.1.3
zoo                                               1.7-12 3.1.3